RNA id: TCONS_00073824


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073824
length 355
lncRNA type antisense
GC content 0.46
exon number 2
gene id XLOC_037587
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 3153726 ~ 3154286 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

GCTTCAGCTGCGACTGTATCGTGGTTTTTGTGATCGTCCATCGTACACAGAGCAAACGTCACACTTCACATCTCCAAGTCCAGCAGGAACAGAAGCTTGGAGTTTAGTCTTCTGGAGTTGCTCCACTAATTCAGCAAGAATGGAGTTTTTATTTAAAGCAGGTCTTGGACTGAATGTTTGTCTGCATTGAGGGCAGCTGTAGACTCCCTTCTCGTCCTCCTGATCCCAGCAATCTGTAACACAGCTCATACAGTAACTGTGTCCACACGGAATGGCCACCGGATCCTTTAGTAGATCCAGACATACAGGACAGATGAACTAGTCTTGAGAAAAACCAACTTCTGCCATTTCGCTG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000157133

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075283 lncRNA downstream 21558 3130688 ~ 3132168 (-) True XLOC_037585
TCONS_00074960 lncRNA downstream 287272 2861221 ~ 2866454 (-) True XLOC_037581
TCONS_00073816 lncRNA downstream 287319 2861221 ~ 2866407 (-) False XLOC_037581
TCONS_00075282 lncRNA downstream 372903 2777346 ~ 2780823 (-) False XLOC_037580
TCONS_00075281 lncRNA downstream 372903 2777346 ~ 2780823 (-) True XLOC_037580
TCONS_00075284 lncRNA upstream 111282 3265568 ~ 3280451 (-) True XLOC_037588
TCONS_00075285 lncRNA upstream 204111 3358397 ~ 3395521 (-) False XLOC_037589
TCONS_00075286 lncRNA upstream 220349 3374635 ~ 3395254 (-) False XLOC_037589
TCONS_00075287 lncRNA upstream 239723 3394009 ~ 3395254 (-) True XLOC_037589
TCONS_00073839 lncRNA upstream 777437 3931723 ~ 3951826 (-) True XLOC_037596
TCONS_00073823 mRNA downstream 3830 3135062 ~ 3149896 (-) True XLOC_037586
TCONS_00073821 mRNA downstream 119601 2949272 ~ 3034125 (-) False XLOC_037584
TCONS_00073822 mRNA downstream 119662 2949601 ~ 3034064 (-) True XLOC_037584
TCONS_00073819 mRNA downstream 208718 2896009 ~ 2945008 (-) False XLOC_037583
TCONS_00073820 mRNA downstream 217709 2896903 ~ 2936017 (-) True XLOC_037583
TCONS_00073825 mRNA upstream 243121 3397407 ~ 3400729 (-) True XLOC_037590
TCONS_00073826 mRNA upstream 336538 3490824 ~ 3496548 (-) False XLOC_037591
TCONS_00073828 mRNA upstream 344091 3498377 ~ 3519253 (-) False XLOC_037592
TCONS_00073829 mRNA upstream 344798 3499084 ~ 3519717 (-) False XLOC_037592
TCONS_00073831 mRNA upstream 467682 3621968 ~ 3653259 (-) False XLOC_037593
TCONS_00073809 other downstream 816423 2330861 ~ 2337303 (-) True XLOC_037575
TCONS_00073808 other downstream 876234 2226463 ~ 2277492 (-) False XLOC_037574
TCONS_00073798 other downstream 1194174 1938985 ~ 1959552 (-) False XLOC_037565
TCONS_00073827 other upstream 336545 3490831 ~ 3496579 (-) True XLOC_037591
TCONS_00073830 other upstream 354032 3508318 ~ 3519711 (-) True XLOC_037592
TCONS_00073841 other upstream 1289632 4443918 ~ 4447104 (-) True XLOC_037598
TCONS_00073868 other upstream 3254871 6409157 ~ 6409271 (-) True XLOC_037613
TCONS_00073875 other upstream 3563391 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618