RNA id: TCONS_00073809


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073809
length 249
RNA type processed_transcript
GC content 0.54
exon number 3
gene id XLOC_037575
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 2330861 ~ 2337303 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATCTTACCTGGCGTATCCAATGATGAGGCTGCCGAACACGGTACCGATTCCAGCACCGGATCCCGCAACTCCCacagtagcagctccagctccgATGAACTTAGCAGCAGTGTGAACATCTTGAAATATGACTCCGCATGCAGTATTTGTCTGCTTGAGGGTGATGAATGGCCTGCGGGTGCCGCGGGTCGAGTGGAGGTTCAGGTAATGAGTGCAGTGAGTGTGACGAGCTCAGGTGCGATCAGTACA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000144630

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075279 lncRNA downstream 53225 2235893 ~ 2277636 (-) True XLOC_037574
TCONS_00074958 lncRNA downstream 123603 2180519 ~ 2207258 (-) True XLOC_037573
TCONS_00075278 lncRNA downstream 157664 2150922 ~ 2173197 (-) True XLOC_037572
TCONS_00075277 lncRNA downstream 159565 2150922 ~ 2171296 (-) False XLOC_037572
TCONS_00075276 lncRNA downstream 394692 1931428 ~ 1936169 (-) False XLOC_037564
TCONS_00074959 lncRNA upstream 45038 2382341 ~ 2389808 (-) True XLOC_037576
TCONS_00075280 lncRNA upstream 216571 2553874 ~ 2557307 (-) True XLOC_037577
TCONS_00073813 lncRNA upstream 231041 2568344 ~ 2572791 (-) True XLOC_037578
TCONS_00075282 lncRNA upstream 440043 2777346 ~ 2780823 (-) False XLOC_037580
TCONS_00075281 lncRNA upstream 440043 2777346 ~ 2780823 (-) True XLOC_037580
TCONS_00073807 mRNA downstream 340538 1986816 ~ 1990323 (-) True XLOC_037571
TCONS_00073806 mRNA downstream 344847 1981882 ~ 1986014 (-) True XLOC_037570
TCONS_00073805 mRNA downstream 346257 1981882 ~ 1984604 (-) False XLOC_037570
TCONS_00073804 mRNA downstream 352771 1975818 ~ 1978090 (-) True XLOC_037569
TCONS_00073803 mRNA downstream 360790 1967707 ~ 1970071 (-) True XLOC_037568
TCONS_00073810 mRNA upstream 222916 2560219 ~ 2573121 (-) False XLOC_037578
TCONS_00073811 mRNA upstream 223237 2560540 ~ 2572831 (-) False XLOC_037578
TCONS_00073812 mRNA upstream 229880 2567183 ~ 2572790 (-) False XLOC_037578
TCONS_00073814 mRNA upstream 254665 2591968 ~ 2594410 (-) False XLOC_037579
TCONS_00073815 mRNA upstream 255089 2592392 ~ 2594464 (-) True XLOC_037579
TCONS_00073808 other downstream 53369 2226463 ~ 2277492 (-) False XLOC_037574
TCONS_00073798 other downstream 371309 1938985 ~ 1959552 (-) False XLOC_037565
TCONS_00073801 other downstream 374938 1953021 ~ 1955923 (-) True XLOC_037566
TCONS_00073800 other downstream 377828 1952956 ~ 1953033 (-) False XLOC_037566
TCONS_00073794 other downstream 396775 1931440 ~ 1934086 (-) True XLOC_037564
TCONS_00073827 other upstream 1153528 3490831 ~ 3496579 (-) True XLOC_037591
TCONS_00073830 other upstream 1171015 3508318 ~ 3519711 (-) True XLOC_037592
TCONS_00073841 other upstream 2106615 4443918 ~ 4447104 (-) True XLOC_037598
TCONS_00073868 other upstream 4071854 6409157 ~ 6409271 (-) True XLOC_037613
TCONS_00073875 other upstream 4380374 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618