XLOC_001242 (AL935184.2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_001242
gene name AL935184.2
gene type non-coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 25555725 ~ 25558287 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00002010
agatgcagaaacttttgacatatgaattcatcttgactaaggaactCTTCACAGCACTTCATCTGAACAGTCACAACCTCACAGAGCTGCTCAACTGCCCCTCTCAGATCAGTGTTGAAGCTGGAACCTCATCTTGTGTACAGCAAAGGCAGAGCTGAAAATTCACTGTTTGTCTTGTATTGTGTGtggcaaaacctggaataacacatgggagccctccaggaattgctgacactttacgcccaagtctcctcatgctaaccggattgcaatatgacagtctagtcaGCATAAACACCTGGACTCGCCAAGCACACTTTGGTTCTTAGTGTTTTGTACAAATTGTTTTTGCTATTCTTCAGtaaatacttgaatatgttttgaacttattctacttttgatgtttaagttcagaaagttgttattataaacataatttgcattggtcatgaacttgacttcttgttgttgtgaaagctgtttattataatggcatttccaaaggcattatttgaaaagattttttgcagtgcagttttacttgagcttgacataccagatgtatgacatgaataaatatcacaaaataaatataataatgataatacaaaatataaatttccttcaattataattgtttttaatcatttatatatgtatggtaatatattattgcattaaaaactgttataaatatatatatttttggtttttgcatgtttgcgtgattttttttttttgtggcattataaataaattataaatgtttcat
>TCONS_00003417
TACAAGTATAATTTGgcctttaccaatttatttaataaaagaaagaatctaTCATCTCTAAATTGTGGTAAAGAGGCACAACAAGCTGTCTTCTTTGTCCAATATTATGTCAGTCAGGATGGTAATGGTAAAACTCAAGGATTACCTTGCACCTTCTCAGAAATTTACCATTGATCATATGTATTACAAGTGGctggattgtttttaacacaagcaacgttttttaaatcattatcttaAACAGATTAAGGCTCATTTTGGACTACACTTACATTACTTTACAACTGCTTAATGCAGTACTGATGCATCTAGTAGTTAGTGGGTTTAACTaatgtcacatctgtttttattcattttagatgcagaaacttttgacatatgaattcatcttgactaagggtaaggtttttgttcagaattaatcattatttaaaatcattgtattttctttgttattatgtacagattttaaaagaatgtactttcttttaataaagaactCTTCACAGCACTTCATCTGAACAGTCACAACCTCACAGAGCTGCTCAACTGCCCCTCTCAGATCAGTGTTGAAGCTGGAACCTCATCTTGTGTACAGCAAAGGCAGAGCTGAAAATTCACTGTTTGTCTTGTATTGTGTGGTAAgtcatagttttattaattttaatttcattgcaaCACTAAGTAGTCCATTCTGTGGCCAATATGATATAAAAGGCCTAAAATGGGACTAACGTGattattgttttgatttcttGAAATACTTATGgggctacacatgcagctgaTGTTAGCTACATGGAGTAGGACATTTCTTTCAgtatactcttaaagagattcacccaaaaatgaaaatactgtcattAATGACTCatacttcacttgttccaaatatgtctgagttgctttcttcagttaaacacaatttatattttaaagaaagatgaaaacctgcaaacattaacttccatggtatttgttttttcctactatgcatgtcaatgttttcagcttttcagctttcttcaaaaacttccttcatgttcaacacaaagtaacttggaagtttttaaaaaaggtttacaaccacttaaaggagagtaaatagtgaactaTTCCTATAACCCaatctagttgactttactagaaaattgtatagaaacccagtgccttaaaccccttacattttatacagggtacaacttaacagccatacttgaattaaaatattactgtaagtccaagaagattgtaaaggttctaggttaatttaaagaaggctgtttagtttcaccttgtgtaaaaacataaaggGTTTAAGGCAACATTTtccatgcagtttttttttttataaagtcaacTAGTTTGAGTTAAGAATGTAATGGGTTTCAGTAAAAGCAGTGAATCATGCAGGCATGAAATTAATGTTTAGCCTTGTAAAACAATAAGCTTgttataatttagaaatatttttagggTGGAGCACAGTATGCTGTAGTAGTTTTCATATAATTGATGAGTCAAACATgagatgtgtgttttaaattgcaagaagtgaattaacaatatgttcatcaagattcaaatcTTGCATCTTATATTTAAGATTTTGGCCCAATAATACCCATATtcggctatttaaaaaaaaaaaaacttgctggaatttGTGTCAGCATTCCCTTCAATGAAAACTACAGCAGTGGACTTCagtggtgataaaaatgtatgaGAAGGATAAGGGTGTTCATAATGAGAAGTGCAGTCACTATCCTGATCTCTGAGTTTGTAGAACTGACAGATCTGCTTGGAATACATGGAAACATGCTGGGAATGTTTAACCTATTATACAGTTAATTAAAGAGTGCCAGGTTTAATGacactttacatatataaataaatatcactgaactttctaaatgaaacctaacactcattctttgttcagtaatgatattgtgcacttttaatactttacagtggcaaaacctggaataacacatgggagccctccaggaattgctgacactttacgcccaagtctcctcatgctaaccggattgcaatatgacagtctagtcaGCATAAACACCTGGACTCGCCAAGCACACTTTGGTTCTTAGTGTTTTGTACAAATTGTTTTTGCTATTCTTCAGtaaatacttgaatatgttttgaacttattctacttttgatgtttaagttcagaaagttgttattataaacataatttgcattggtcatgaacttgacttcttgttgttgtgaaagctgtttattataatggcatttccaaaggcattatttgaaaagattttttgcagtgcagttttacttgagcttgacataccagatgtatgacatgaataaatatcacaaaataaatataataatgataatacaaaatataaatttccttcaattataattgtttttaatcatttatatatgtatggtaatatattattgcattaaaaactgttataaatatatatatttttggtttttgcatgtttgcgtgattttttttttttgtggcattataaataaattataaatgtttcat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000095408

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00002010 False 772 processed_transcript 0.32 3 25555725 25557930
TCONS_00003417 True 2563 lncRNA 0.31 1 25555725 25558287

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_001241 sfrp2 coding downstream 59592 25491324 ~ 25496133 (-)
XLOC_001240 arfip1 coding downstream 69154 25442699 ~ 25486571 (-)
XLOC_001239 fhdc1 coding downstream 116791 25399514 ~ 25438934 (-)
XLOC_001238 trim2a coding downstream 185444 25322445 ~ 25370281 (-)
XLOC_001237 tmem154 coding downstream 378500 25154076 ~ 25177225 (-)
XLOC_001243 si:dkey-30k22.7 coding upstream 66471 25624758 ~ 25648568 (-)
XLOC_001244 fgg coding upstream 111512 25669799 ~ 25679383 (-)
XLOC_001245 NA coding upstream 151025 25709312 ~ 25714494 (-)
XLOC_001246 map9 coding upstream 179480 25737767 ~ 25749888 (-)
XLOC_001247 CU929073.1 coding upstream 304679 25862966 ~ 25863639 (-)
XLOC_001235 BX511127.1 non-coding downstream 730462 24825147 ~ 24825263 (-)
XLOC_001234 NA non-coding downstream 948963 24602332 ~ 24606762 (-)
XLOC_001230 NA non-coding downstream 1644719 23908717 ~ 23911006 (-)
XLOC_001229 NA non-coding downstream 1771956 23751953 ~ 23783769 (-)
XLOC_001225 NA non-coding downstream 2108425 23445485 ~ 23447300 (-)
XLOC_001256 NA non-coding upstream 625112 26183399 ~ 26185720 (-)
XLOC_001257 NA non-coding upstream 685218 26243505 ~ 26248287 (-)
XLOC_001259 CU570873.1 non-coding upstream 792239 26350526 ~ 26350641 (-)

Expression


Co-expression Network