XLOC_002431 (CABZ01063556.1)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_002431
gene name CABZ01063556.1
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 42733210 ~ 42740662 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00004566
tgcaaggagcattttttgttttcgttAATACTAGACATTTTAATAAGTGCAGGTCAGAATAAGCATGTCATTTCATGTGAAAACACATATGTTACTCTAAATGACAACGGAACATCATTTAagtcatatttttacattatacaCATTCACCAATCtgcttttttacacattttgtatatataataacttcagtaaatgtaatttaatgctatttttatttattcatatgttcTTAGATgcttaaaatctaaattaataaaaataatcgcAATTATTAAATTTTAACCTATCATCACGCTCACTAAAATAGGTTAAATGCATAGGTTGAATGTTAGGTACTCCCAAATTTGTCGAATGTGACTTTAAGAAAACAAAGTTGATAAAAAAATGACGAAAATGCCGCCTTTAATCTGAAGcagaacaacaaaacaaaccaaaatggcGGCTTGCATGAGTGAAAACGGTGCAAATGGAAAACTGGAGTTCTTCTTAAAAGTCCCGTTCCCGACTGAAAGAGAGGCAAATATCGCTCTGCAGTCTTTATCTCCAGATCCCGAACCCAGGAAAGGAGGAATCAGCAAAAGTCTGTGTGTGTCTGGACAGACGCTGTCTGTGAGCTGGGCTGCAGATGAAGCTCGTATTCTCCGTGTTTCTGTCAGTTCATTCTTGGACCATTTGTCTCTGGTGATGGAAACCATGGATGCTTTTGGACCGCCTGTTTCACAGTGAAGCTCTAAGCAAGAAATGTGGATGCAGATGCTGTTTGCACTGAGAAACATCTGTTCAGTAtggactaaaataataataaatgtattaatgaatGTACTTTTGCTCTGTTTGAGAAATGAGGCATATTATAAAGTCTTAAATGATCACGCCATTAAAAGAAAAGCTAATTTTGCAGCTTGTCTAGacttaaacagttgagtttcaccattttttttacttttatttagccGATCTGTGGATCTGGTGGGAGcatttttagtttagcttagcataagtcatttaatcggattggaccattagcatctttctCAAAACTAGTCTAATTGTACAGTTCCCCTAGggctaaacagttgagttttgccatttttaaatgcattcagaTGATCTCCGggaacaattttagcttagcataaataattgaatcggattagaccattagcatctcgctcagctaagctaaaagtgttcctgccAGACTCAACGATCatctgaatgtttaaaaaaaaaaatgctaaaactcaactgttaaaCCCTATGAGAACTGTATAGATTATTTTTTAgtcagatgctaatggtctaatctgattcagtgatttatgctaagctaagctaaaagtgttcccaaAGTTTAgctgaatgtatttaaaaatgttaaaactcaactgtttagccCTAGGGGAACAGTTAAAGTAGACTATTttcgagtgagatgctaatggtctaatctgattcagtgatttatgctaagcgaAGCTAAAATTGTTCCCAGACATTGgctgaatgtatttaaaaatgctaaaactcaactgtATAACCCTAGGGGAACTCTATAATTAGACTATTTTTGAGTGAGACACTAATGTTCTAATCCgagtcaatgatttatgctaagctaaaagtgccctGAAGATTGgctgaatgtatttaaaaatggtaaaaaacaACAGTTTAACAACTGTTAATCAACTGTTTAACCTAAGTGGAACTGAAAGATTAAACAATTTTTTGAAcgagatgctaatgatctaatccgggtcaatgatttatgctaagctaaaagtgtcccTGCCAGACCCAaagattgttttaaaaaaatgccaaaacaaTTGGTCAACCCTATGGGAAATGTACTATTAGACTATTTtcgagcgagatgctaatggtctaatctgatttaacgATTTattctaagctaagctaagtGTCCCTGCCAGACCCAATGATTGTCTGAATGTTGTCAAAAAATACTAAAACTCAACTGCTCAACCCAATGGGAACTGTATAATTAGACTATTttcgagtgagatgctaatggtctaacccGAGTCAATGATCTGTGCTTAGCTAattattcaatgatttatgctaagctaagctaaaagtgttcccaaAGATAAGCTGAATGTATTTAAaactggtaaaactcaactgtttagctCTAGGGGAACAGTTAGACTATTttcgagtgagatgctaatggtctaatccaattcaatgatttatgctaagctaagctaaaagtgttcatAGAGATTAgctgaatgtatttaaaaatgctaaaactcaactgttaaaCCCTATGGGAACTGTGCAATGAGACTATttttgagtaagatgctaatggtctaatccgattcaatgatttatgctaagctaaactaaaagtgtcCCTGCAAGACCCAacgattgttaaaaaaaaaaaaaaaaagctaaaacaacTGTTCAACCCTAGGGGAACTGTATAATTATGCTATTTTCgggtgagatgctaatggtctaatctgattcaatgatttattctaagctaagctaagtGTCCCTGCCAGACCCAACGATTGTCTGAATGTtgtcaaaaaatacaaaaattcaaCTGCTCAACCCTACGGGAACTGAATAATTAGACTATTttcgagtgagatgctaatggtctaatccgattcaatgatttatgctaagctaagctaaaagtgttcccaaAGATTAgctgaatgtattttaaaatggtaaaactcaactgtttagaCCTAGGAGAACTGTAAAAGTAGACTACTttagagtgagatgctaatggtctaatctgattcaatgatttatgctaagctaaaagcgtTCGTGGAGATTAGctcaatgtatttaaaaatgctaaaactcaactgttaaaCCCTATGGGAACTGTATAGTCAGACTTTTTTTGAGCGagacgctaatggtctaatccgaatcaatgatttatgctaagctaaaagtgtcccTGCCAGACccacaattgttttttaaaaaatgcaaaaataactgTTCAACCCTATAGGGGAACTGTATAATTAGACTATTTTCGAGtcggatgctaatggtctaatccgattcaatgatttatgctaagctaagctaaaagtgttcccgccAGACCCAAAGATCAActgaatgtgttaaaaaatggtaaaaatcagCAGTTTAATCCCAGAGGGACAGTAAAATCAGACTATTTtttagtgagatgctaatggtctaatccgattcaatgatttatgctaagctaagctaaaagtgtttccgCCAGACCCGAAAAtcatctgaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000116344

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00004566 True 3393 mRNA 0.34 3 42733210 42740662

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_002430 NA coding upstream 1216 42729946 ~ 42731994 (+)
XLOC_002429 NA coding upstream 9989 42720841 ~ 42723221 (+)
XLOC_002428 rhobtb2b coding upstream 16471 42678520 ~ 42716739 (+)
XLOC_002427 fgfr1b coding upstream 71765 42589391 ~ 42661445 (+)
XLOC_002426 kctd9b coding upstream 177388 42542517 ~ 42555822 (+)
XLOC_002432 NA coding downstream 423 42741085 ~ 42745580 (+)
XLOC_002433 NA coding downstream 79064 42819726 ~ 42820906 (+)
XLOC_002434 zcchc9 coding downstream 157441 42898103 ~ 42903716 (+)
XLOC_002435 atg10 coding downstream 296402 43037064 ~ 43076207 (+)
XLOC_002436 xrcc4 coding downstream 347608 43088270 ~ 43184354 (+)
XLOC_002424 NA non-coding upstream 255951 42470616 ~ 42477259 (+)
XLOC_002417 NA non-coding upstream 746927 41982997 ~ 41986283 (+)
XLOC_002414 BX005006.1 non-coding upstream 893177 41839919 ~ 41840033 (+)
XLOC_002439 NA non-coding downstream 777932 43518594 ~ 43525213 (+)
XLOC_002441 NA non-coding downstream 1087665 43828327 ~ 43938288 (+)
XLOC_002442 CR384089.1 non-coding downstream 1252690 43993352 ~ 44024651 (+)

Expression


Co-expression Network