G51265



Basic Information


Item Value
gene id G51265
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information


Item Value
chromosome id CI01000009
NCBI id null
chromosome length 16003125
location 2242709 ~ 2363171 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence


>TU58399
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AGAAAATTATTTACTTTATTTTCCATTTCAAACTTCATATTTCATCACACACTGTCTAATATATTTAAAGAGCACAATGAGATGTCAAGCTTTAATTGGTGCACTGTATTAAGTTGATACTCTGAAATCTCAATTTCATTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGTTGTCATATAAAAGGGACAAAGGTGTCTTTAATTTATAATCATCAGAACAGCATCACGAGTACAGTAAATTATGACAAATGATTCACGTTATTCATGTGATACCAGATTCATGTGAAAATTCTGATATTTTAGTTAAAATTACATGGTCAAACAATTTTCATATATATATTTTCATATATACAATTTTTTTTTATATATATATATATATTCACAAACATTATTAATCATTCACAATAAGACCAGAAACATGCAATAAGAAAATTATTACGAAAATTATTTAAATGAATTCATGCTGATTTTAAGCACACACCAACACGGGGAGAATGTGCAAACTCCACACAGAAAAGCCCCCTTGCTCAGCCAGGACTCGAACTAGGAAGCTTCTTGCTCTGAGGTGACAGTACTACTCATAATTATGCAGAATGCACAAACTTGGACAGGACTTTGCCAGCACTCTTCAGGCGCTCCAGGCGCTCTTTCAGTTCTTTCCTTTTATGTGCAATACCGAAATCTTCTCGGAGGAGCATTCCTGGATTGTTCCCTCCAATCATGGCAAGCATTGCATTCTGAAGCTGAGAGATGTACTGGTCCAGCAAGTGGTACTGGACTATCAGTGGCACTTGATTAGCCAGACGGTTAC
>TU58415
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>TU58409
ACTTTGTAGAAATCAGTCTGCATGTATTGCAATGTAACAGGCCTAATTTTTATTATGGTCCTCCTCTGCACCTTTCACCATTAGACTGAAAAACGAAGTTCCAGGATTGTAGTTTTTTAGTTTAAGACAGTAAAGGGAACAACAGCAAAGCTGTGCTCATACCACAAGTCTATATTTCTGTGTCAAAGCTGTTTGTGTGAAGTTAGGTCATTTAAGCAGTTTAGAAAGTGTAGGCCTATATAGAACAGTGTAATTCATGAACAAAACTAATAACTACCAATATGCAGTAATATATGGATCACATTAAACAGACAAATATGAAAGATATGATTATTTATTAACCACACAGTGCACAGATCAAGGAGAAATAATCAGGTCTTATACTTTGACGGAGCTTCAGATAAAATATTACAGGCTCGGTGGTAGTAGACACATATACATTAGCCAACACTGTGCAATGGCAAAGCCAGGATTGTATAGATGTTCACATGTTTGAAGAAAGCCGGGTTATTTGAGAAGAACATTAAAGGCAGGAATTTTATTTTCAGATCAGAGTGACAAATGTTAGAAAAAAGTGGATATGGCAATGCTTGAAAATTAGTCTGTGCAGTTTCTATGTATGTTTTAAGAGATTTCCACGCAATCTGTATAGACTAATTTTCAAGCATT

Function


NR:

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PREDICTED: proprotein convertase subtilisin/kexin type 6-like

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GO:0000377 RNA splicing, via transesterification reactions with bulged adenosine as nucleophile biological_process
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KEGG:

id description
ko03040 Spliceosome

RNA


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Neighbor


gene id symbol gene type direction distance location
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CI01000009_02398010_02399639 NA coding downstream 32894 2396065 ~ 2399752 (+)
CI01000009_02426085_02433745 CNGA4 coding downstream 62404 2425575 ~ 2433795 (+)
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CI01000009_03202999_03207060 MPC2, MPC2.S other downstream 839601 3202207 ~ 3208984 (+)
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CI01000009_05931829_05943829 KCNH3 other downstream 3497131 5931718 ~ 5943899 (+)
G53651 NA other downstream 3882393 6245564 ~ 6248392 (+)

Expression



Co-expression Network