G118807


Basic Information

Item Value
gene id G118807
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000021
NCBI id null
chromosome length 7014339
location 5161087 ~ 5165347 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU134946
CGGATTCTCATTGGATGAAACCTGCTTAATCCGAGAGCTGAACATTTTATAACATCTACAGCATAAGCGTTTATTCATGGATTTACGGAGGGAGAAACAATACACGCGAACTTAAAATGCAATGACAGATCTGTCGGAAATGGAGGAGTCATCTATATCCTCAGTAGCGTGACAACGTGAGTAGCTTTCATGACATTTCCATGTTGAGACAGTGATGAATGAACACCACATGTGAGAGTAATGATAACTGGGTATAATAGGATACAGTAAAGCAGCACTGGGCAGACAGTGTCCTAAACCACAGCGAGACATATAGCTGATGAGACGCTCGCTTATGTCTGCTTATTGTGTACTAAACGCTCAGACATCAAGTGCAGTGCAGACGACAAAGACTCATAAATGAGTCTGGACTGCGTATTTCCTCCACCTGTTTCCAGTATGCCAGTGGAGACACATGCTCATATAAACACAAACCGCGGGTCACTTCATGAGAGAATAAGGGCGTCCCATCCTAAAATATAGCTATTATTGTTAATAGCGTTTTACAGTATCTGTCTGTTCTGTCACGAAACATACGGTAAATGGCAGATTGTCTAATCATTAATAGCGTGGTTTATCCTCAACAAGCTCCAGTAAGGGCGCTGTACACAATATGTTTCTAACCGTTTGTTCCTCTAAACAGCACAAACATGCTCGGTTATTTGAGGACAACATTTTGCGATGTCCGAATCAAAACGTTATTTTAAGTCGAATCTTGGCTCATTATAGCCGCTCGATCGTTTTTGAAATGAACTGTTCGAAAGAATCGATTCGCTTAGATGAGATGAGCCGGAATTCTCATCACTATTCTGCTTTCCGGTGTGCTCGCGAACAACGACGTAACGTGAAAAACTCCGTGTTATGACTTATTTGTTCTTCTGTTATATTAAAACGACACTCTAGCGCAGTACTGTAACATGACTGGTGATTGGTTTATAAGTATTCTCAAATTCAGGTATGACTATGGCCCTGCGTGGATCAATGAAGGCGTAGCAGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTCACAGGGCCCTGAAAAATGTATACATATGTGTATGTTAAAACACATGGAAAAATAGAGGAAATGTAGAATGTCCTGGAAAATTGTTTTGTTATCCTGGATTTTTTATTTATATTTTTTATAATTGTTCTGTTTTCCTTTAGCTAAGAAAGAAGAGTTTATCATAAAACAATAAATAATAAGTGAAGTAGCAGAAAGTACTATGATCAGGGATACTGAGTTTTTTTTTGTTTGTTTTTTTGACATGTGAGAGAAGTATCTTGAATGATGATAGTGTTGGCCCTTGCAGCAGTTAACTGCACAAATGTTTACTCACCCTCAAGCCATCCTAGGTGTATATGACTATCTTCTCTCAGACTAACACAATCTAAGATATATTTATCCTTGCTCTTCCAAGCTTTGTAACGGTATAAAAAATAATCCATATGGCTCCAGGGGTTTAATAAAGGCCTTTTGAAGTGAAGCAAAGCGTTTTTGTAAGGAAAATATCTAATTATAGAAAATATCATATTTAAAACTTTATAAATTCAAATAACTAGCTTCCGGCAGACAACCGTATACATAATGTGCAAGTCGACTTGCGACAAATGAGTAACCCCCTAACGCGATGTATGACGTAGCCTGTAGGAGTAAGCTTAGACACCCCTCGCGGTTTAAACAAATAGAGCTGTGCAACAAACTCAAGCTCCTCTTCTCATATCGAAATCCTCTGACTTTTCTCTTTAAAAATAATCGTTTGAGACTTCTAATTGGTGACTGGTGTTTTGTTTTGTTCTATCCTCTGTGCTTCCGCGTTCGTCATTGCGTCATGCGTCGGTCAGAGGTAGGGCTGCACGATTAATCGTAATCGAATCGAAATCGCGATTTAGCTTAGTGCGATTATGATATCGCAAAGGCTGCGATTTTTAATTTTATAAATATGTACACAGCATGTTAGTGAAGATCTGCTCTGTGATCAGTAGTAAACAACGCTCCATCTGAGAGCACTGCATTAGAAAAAGCAACACACGTCAAATATACAAACTTTCCAAACATGAGAAGCCTTTATGAACTTCTTTTCTAACAAAAGACAACATTTAATGTGTTTTTTTACTCCAAACTCTCTTCATAACATCAGTTATCGTTCAGTGTTTGAAATAGCATTTTGATTAGCATTGGATTATAAATATACTTTATTATTACGGAAATACCCGAGAAAGCCTTTTCCACAGCCGAGATGCATAAGAGGCACGTAGTTCATATTAAATACATGGACTCCATTTTTGATTTTGCATACCTCCATACAAAAATAAAGAAATTATTGAGACAGATTTTTATCATAATAATATAATATTTGATAATAAATCCTTAGACCTTTCTAATGATTTATAGACATACTGCTTGCATGTTAACAGGTAACCCCACATTTTGTCATACAAGTTTTAAATATTATTTTCTAATTATTATAGTTATATTTAAAATTAAATACTAATGCTAAATACTTTAATAATGAAAGTTATTACAACAGTAATATTTCTTATTTGGTTTAATATTTTTATTTAGCAATAATGATAATAATAATAATAAAAATAATTAGTCAAAATAATATATTAGCACAAAATTTCGGGTCAAATTCTGCAGCCCTACAAACAAGCAAAACAAGCCTGGTATTGTTTATCTTTTTTCTTTTTTTTTCATTTGTTTTATAAAATCGCATTTTAAATCCAAATTTTAACCAGAAAAATCGCAATTAGATTTTCTCTCCAAATCGTGCAGCCCTAGCCAGAGGTTGCCGCAAATTGATGTGTACGGGCGTTTGCCGGAAGCTAGTTATTATAGTTAATAAAGTTTTAAATATGGATATTTTTATTACAAAAATCCATTGCTTCGCTTCAGAAGGTCTTTATTAACCCCCAGGAGCCGTATGGATTATATTTATGATGAATGATGCATTTGTTTTTTTGCTTTAAAATGTCAACCCCCCCCCATGAGTAAATCATTGGATAATTTTCATTTTTGGGTGAACTATCCCTTTAAGGGTGCATCTCAACCAGCTCCCTAGTTCAGTAGTCAGGGCACTGATCGGGGAGTCAGCCATTTTAAGGGCTGTCCCAATCACAGAATCCTTCCAGGGCACTGAAACGTTCACTCCCTAAAAAGTCCCACAATGCACCGTGAAAACCAGGGAGCATCAATGCTCACTTTGCTCCCTTAACGCAAGTTCTGAAGCGCGAAACTTAAATCACGTGAGCAAACTCACTACACATAACGACGCACAATAGATGTTTTTAAAAATACAAACCATTATGTTATTGTATTTCAGCATAAACATACGTCGCTGGACAGGTGAACATAATCTAGCTAACATTTATAATTTATTTATGCCTGAAATGTTGCACCGTATATGTAACAAGCAAAGTATTTACCATAATGTGCTTTAAATAACATGTCAGAAAGATATCAGCTCTGCTGTTGTTCATAAGTACCAGTAGTGATGTTGTACAATGTGGACGTTGTCACGTGTCATCAGTGTCCCAGTGTCTAGTGATCCAGCTACATATTTACTGTCCTTACCAGTGCCCGAATTTGTGTACACGATATACTGATTCACCAGCTAGGGAGCTGATTGAGTTTTTTTTGTTTTTTGTTTTTCTTTTGCAAACAAAGCATTTGCGTCGCCTTCATAAAACTGAGGTTAAACCACTGGACTCACATGGATTACTTATGATGTCTTAACTGCCTTTCTGGGGCTTGAAAATGGTAGTTGCGTAGGCTGTCAATGGAGGGACAGAAAGCGCTCAGATTTCATAAAAAAGATCTTAATTTGTGTTCCGAAGATGAACGAATGGCTTACGGGTTTGGAACGACATGAGGAATTAATGACAGAATTTTCATTTCTGGGTGAACTATCCCTTTAATTACAAAATATTTGAAGGCTACATGTTAATGTTTTTATGTATTATATTATGTATTAAATTATCATTAGCATTAATAATTTATTGACTTTAATATTTTTATTTTTAAATAGTTAAAATATTTAAATGGCTCATATTAATAAACTAATTTTAATGGCCATAAACTGTACGTCTTTTAAAGACTTATGGAGAGAGGAATATATTACTATAGGGCGATCTTTGTCTTTTATTTCCGAAATTGAAAATGTCCTGGAAAATTATAACTGAAAAGGGTGGGAACCATGTTTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU134946 True 4235 lncRNA 0.36 2 5161087 5165347

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000021_05050240_05098803 NA coding upstream 61288 5048920 ~ 5102550 (+)
CI01000021_04886787_04893309 PLAGL2 coding upstream 267613 4886337 ~ 4893474 (+)
CI01000021_04795987_04803001 PCMTD2 coding upstream 357983 4795987 ~ 4803104 (+)
CI01000021_04763908_04787185 MYT1B, MYT1 coding upstream 373120 4763908 ~ 4787967 (+)
CI01000021_04755472_04758504 NA coding upstream 402433 4755472 ~ 4758654 (+)
CI01000021_05193252_05204766 SLCO4A1 coding downstream 27436 5192783 ~ 5205113 (+)
CI01000021_05244908_05282588 NTSR1 coding downstream 79384 5244731 ~ 5282927 (+)
CI01000021_05302737_05307812 NA coding downstream 136996 5302343 ~ 5308673 (+)
CI01000021_05392788_05403219 NA coding downstream 226955 5392302 ~ 5404100 (+)
CI01000021_05451019_05481032 NA coding downstream 285672 5451019 ~ 5481196 (+)
G118798 NA non-coding upstream 7565 5153180 ~ 5153522 (+)
G118793 NA non-coding upstream 11402 5149334 ~ 5149685 (+)
G118442 NA non-coding upstream 53547 5045231 ~ 5107540 (+)
G118520 NA non-coding upstream 172350 4988263 ~ 4988737 (+)
G118891 NA non-coding downstream 123150 5288497 ~ 5288747 (+)
G118905 NA non-coding downstream 140607 5305954 ~ 5306248 (+)
G118916 NA non-coding downstream 153410 5318757 ~ 5320272 (+)
G118935 NA non-coding downstream 168780 5334127 ~ 5334340 (+)
G118945 NA non-coding downstream 173778 5339125 ~ 5339363 (+)
G117493 NA other upstream 1125411 4033000 ~ 4035676 (+)
G117484 NA other upstream 1203335 3956146 ~ 3957752 (+)
G117202 NA other upstream 1832854 3269144 ~ 3328233 (+)
G117237 NA other upstream 1917723 3237854 ~ 3243364 (+)
G119701 NA other downstream 1634797 6800144 ~ 6860606 (+)

Expression


Co-expression Network