RNA id: TCONS_00016597


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00016597
length 83
RNA type miRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_008229
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 1543686 ~ 1543768 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCTTAGACCGCTAAAGCAGCGCGTCATGGTTTTCAACATTAGAGAAGGTGCAAGCCATCATTTGCTGCTCTAGAGTTTTAAGG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000116593

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018749 lncRNA upstream 308993 1221817 ~ 1234693 (+) True XLOC_008225
TCONS_00018748 lncRNA upstream 323563 1207720 ~ 1220123 (+) False XLOC_008224
TCONS_00018747 lncRNA upstream 323563 1207720 ~ 1220123 (+) True XLOC_008224
TCONS_00018746 lncRNA upstream 332125 1207720 ~ 1211561 (+) False XLOC_008224
TCONS_00018745 lncRNA upstream 716711 823442 ~ 826975 (+) True XLOC_008210
TCONS_00016601 lncRNA downstream 117324 1661092 ~ 1668218 (+) True XLOC_008231
TCONS_00018865 lncRNA downstream 149429 1693197 ~ 1718629 (+) False XLOC_008232
TCONS_00018866 lncRNA downstream 171593 1715361 ~ 1718629 (+) False XLOC_008232
TCONS_00018867 lncRNA downstream 171986 1715754 ~ 1718629 (+) True XLOC_008232
TCONS_00016615 lncRNA downstream 878067 2421835 ~ 2423611 (+) True XLOC_008240
TCONS_00016595 mRNA upstream 94981 1440364 ~ 1448705 (+) True XLOC_008227
TCONS_00016593 mRNA upstream 106979 1372343 ~ 1436707 (+) False XLOC_008226
TCONS_00016594 mRNA upstream 106979 1397811 ~ 1436707 (+) True XLOC_008226
TCONS_00016592 mRNA upstream 333140 1199407 ~ 1210546 (+) False XLOC_008224
TCONS_00016591 mRNA upstream 348674 1167119 ~ 1195012 (+) True XLOC_008223
TCONS_00016600 mRNA downstream 110011 1653779 ~ 1672461 (+) False XLOC_008231
TCONS_00016602 mRNA downstream 161399 1705167 ~ 1711472 (+) True XLOC_008233
TCONS_00016603 mRNA downstream 222220 1765988 ~ 1795631 (+) False XLOC_008234
TCONS_00016604 mRNA downstream 222966 1766734 ~ 1783965 (+) True XLOC_008234
TCONS_00016605 mRNA downstream 252545 1796313 ~ 1802034 (+) True XLOC_008235
TCONS_00016581 other upstream 464582 1078989 ~ 1079104 (+) True XLOC_008218
TCONS_00016598 other downstream 89 1543857 ~ 1543943 (+) True XLOC_008230
TCONS_00016599 other downstream 16897 1560665 ~ 1568342 (+) True XLOC_008228
TCONS_00016606 other downstream 329890 1873658 ~ 1873778 (+) True XLOC_008236
TCONS_00016611 other downstream 814743 2358511 ~ 2358625 (+) True XLOC_008239
TCONS_00016622 other downstream 1130167 2673935 ~ 2674590 (+) True XLOC_008245