RNA id: TCONS_00066022



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00066022
length 379
lncRNA type lincRNA
GC content 0.45
exon number 3
gene id XLOC_033752
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 26750471 ~ 26756182 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AGGAGTGCAGCTTGCCAAAGCCTAATAGCATTATATATAGGCTACCCTACAGGACGGTACCTGTCTCCTCCAAGCACCGCATAGTATGGTGAAAAAAAGACTACTTTGATACATGATGATGGATGCATATAGTATACCTTCCTGCCAGGAATGATATCAGAGCAAGAGGGTAAGAGCCGCAACTGCAATACAAAGGAGCAACAAAAGACATGAAGACTTGAGGAGCAGCTGATAACCAGGAGTTCTATAAAAAGATGATCAGATGGATGATACTAGGAGAATGACGGGGAACCAGGAACAATGAGAGCCTGACACTGAGACCAGATGGGGAACCAGGACAGACCAACACTTGGAGAAAGACGTAAACACTGGAGATAAC

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000173859

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00066014 lncRNA upstream 134301 26611727 ~ 26616170 (+) True XLOC_033748
TCONS_00066013 lncRNA upstream 192065 26557767 ~ 26558406 (+) True XLOC_033747
TCONS_00068853 lncRNA upstream 208048 26534014 ~ 26542423 (+) False XLOC_033746
TCONS_00068854 lncRNA upstream 208048 26534071 ~ 26542423 (+) False XLOC_033746
TCONS_00066008 lncRNA upstream 214829 26534131 ~ 26535642 (+) False XLOC_033746
TCONS_00066027 lncRNA downstream 103306 26859488 ~ 26876314 (+) False XLOC_033754
TCONS_00066033 lncRNA downstream 285191 27041373 ~ 27044000 (+) True XLOC_033756
TCONS_00068855 lncRNA downstream 288347 27044529 ~ 27048457 (+) True XLOC_033758
TCONS_00066047 lncRNA downstream 616251 27372433 ~ 27424587 (+) False XLOC_033760
TCONS_00066048 lncRNA downstream 688567 27444749 ~ 27449362 (+) True XLOC_033760
TCONS_00066021 mRNA upstream 10797 26716321 ~ 26739674 (+) True XLOC_033751
TCONS_00066019 mRNA upstream 12349 26709251 ~ 26738122 (+) False XLOC_033751
TCONS_00066020 mRNA upstream 12351 26709271 ~ 26738120 (+) False XLOC_033751
TCONS_00066018 mRNA upstream 45862 26649319 ~ 26704609 (+) True XLOC_033750
TCONS_00066017 mRNA upstream 46954 26649319 ~ 26703517 (+) False XLOC_033750
TCONS_00066023 mRNA downstream 6535 26762717 ~ 26837282 (+) False XLOC_033753
TCONS_00066024 mRNA downstream 6776 26762958 ~ 26836835 (+) False XLOC_033753
TCONS_00066025 mRNA downstream 6808 26762990 ~ 26837182 (+) True XLOC_033753
TCONS_00066026 mRNA downstream 88079 26844261 ~ 26892613 (+) False XLOC_033754
TCONS_00066029 mRNA downstream 241987 26998169 ~ 27021303 (+) False XLOC_033755
TCONS_00065996 other upstream 629735 26120631 ~ 26120736 (+) True XLOC_033735
TCONS_00065993 other upstream 678963 26071426 ~ 26071508 (+) True XLOC_033733
TCONS_00065992 other upstream 679464 26070874 ~ 26071007 (+) True XLOC_033732
TCONS_00065985 other upstream 721698 26028659 ~ 26028773 (+) True XLOC_033727
TCONS_00065983 other upstream 765632 25973649 ~ 25984839 (+) True XLOC_033725
TCONS_00066028 other downstream 132228 26888410 ~ 26892142 (+) True XLOC_033754
TCONS_00066032 other downstream 285182 27041364 ~ 27044003 (+) False XLOC_033756
TCONS_00066034 other downstream 287533 27043715 ~ 27043842 (+) True XLOC_033757
TCONS_00066036 other downstream 303212 27059394 ~ 27136646 (+) False XLOC_033759
TCONS_00066050 other downstream 699158 27455340 ~ 27660728 (+) False XLOC_033761

Expression Profile


//