RNA id: TCONS_00066247


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00066247
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_033861
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 34080184 ~ 34080298 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

tctggcagctagctctctgcaactctcacatggttgcccactaaaGCAGAGCaaggctgcgcccggtcagtacctggatggtagaccacacgggaaagctaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181764

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068871 lncRNA upstream 124858 33949284 ~ 33955326 (+) True XLOC_033860
TCONS_00068870 lncRNA upstream 727598 33351182 ~ 33352586 (+) True XLOC_033856
TCONS_00066236 lncRNA upstream 908562 33168919 ~ 33171622 (+) True XLOC_033853
TCONS_00066231 lncRNA upstream 937909 33136533 ~ 33142275 (+) False XLOC_033850
TCONS_00066202 lncRNA upstream 1589034 32475343 ~ 32491150 (+) True XLOC_033841
TCONS_00068873 lncRNA downstream 22008 34102306 ~ 34106210 (+) False XLOC_033862
TCONS_00068872 lncRNA downstream 22008 34102306 ~ 34106210 (+) True XLOC_033862
TCONS_00068874 lncRNA downstream 83477 34163775 ~ 34187355 (+) True XLOC_033863
TCONS_00068875 lncRNA downstream 204269 34284567 ~ 34288459 (+) True XLOC_033866
TCONS_00068580 lncRNA downstream 336768 34417066 ~ 34417507 (+) True XLOC_033869
TCONS_00066245 mRNA upstream 604990 33457214 ~ 33475194 (+) True XLOC_033858
TCONS_00066244 mRNA upstream 607227 33457148 ~ 33472957 (+) False XLOC_033858
TCONS_00066242 mRNA upstream 636184 33372682 ~ 33444000 (+) False XLOC_033857
TCONS_00066243 mRNA upstream 638939 33424044 ~ 33441245 (+) True XLOC_033857
TCONS_00066241 mRNA upstream 638983 33372680 ~ 33441201 (+) False XLOC_033857
TCONS_00066248 mRNA downstream 146777 34227075 ~ 34236091 (+) False XLOC_033864
TCONS_00066249 mRNA downstream 146831 34227129 ~ 34230996 (+) False XLOC_033864
TCONS_00066250 mRNA downstream 151484 34231782 ~ 34236086 (+) True XLOC_033864
TCONS_00066251 mRNA downstream 155940 34236238 ~ 34240903 (+) False XLOC_033865
TCONS_00066252 mRNA downstream 156891 34237189 ~ 34245115 (+) True XLOC_033865
TCONS_00066246 other upstream 226877 33853188 ~ 33853307 (+) True XLOC_033859
TCONS_00066207 other upstream 1398429 32681640 ~ 32681755 (+) True XLOC_033844
TCONS_00066189 other upstream 2648973 31427169 ~ 31431211 (+) True XLOC_033834
TCONS_00066148 other upstream 3603802 30475836 ~ 30476382 (+) True XLOC_033822
TCONS_00066147 other upstream 3641163 30438905 ~ 30439021 (+) True XLOC_033821
TCONS_00066258 other downstream 225297 34305595 ~ 34311229 (+) False XLOC_033868
TCONS_00066266 other downstream 426497 34506795 ~ 34526500 (+) False XLOC_033873
TCONS_00066285 other downstream 726629 34806927 ~ 34811489 (+) True XLOC_033879
TCONS_00066310 other downstream 1599126 35679424 ~ 35752611 (+) False XLOC_033889
TCONS_00066311 other downstream 1631988 35712286 ~ 35734539 (+) False XLOC_033889