RNA id: TCONS_00073179



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073179
length 640
RNA type mRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_037175
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 27371240 ~ 27371879 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTACTTCAAGCCGTTCTATCACATCGCCAGTGGATGGTTTCGAGAGGCTTTCCGTATGAAGGAGAAACAGCAGTACCGCTATGATGCTTTTGTGTCTTACAGCAGCAAGGATGAGCACTGGGTCATAGAGGAACTTCTTCCAAACCTAGAACAGCGTGGACCTCCATTTCTGCGTCTCTGTCTGCACAGTCGAGACTTTCAGCTGGGACACGACATTGTGGAAAACATCACAGACAGCATCTACGCAAGTCGCCGAACTCTTTGTCTCGTCAGTCGCAACTACCTCAATAGCAACTGGTGCTCAGTGGAGATGCAGCTGGCCACCTACCGGCTCCAGGTAGAACACAGAGACATTCTTATCCTGGTCTTCCTAGAAACCATTCCATCTCGCTTGCTTTCCTCCCATCACAGACTGGCCCGGCTGGTAAAAACTAGGACCTATCTGGACTGGCCACAGGAGTCGAAGATGCATGAAGCATTCTGGGACAGGTTGTGGTGTAAACTGAGCTCTAATAAAGCCAACTAGACTTTCCTTCTGTTTATTGTAAAGTTGCTTAAGATAATTACAAACTTTCTTTTGCAAAGTGATCAATATTTCAGTAAACGTTTATTAGATTTGATGCTTAATAAAGAGAAAGTG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000060337

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075127 lncRNA upstream 21903 27348630 ~ 27349337 (+) False XLOC_037173
TCONS_00074907 lncRNA upstream 47525 27314951 ~ 27323715 (+) True XLOC_037170
TCONS_00074906 lncRNA upstream 69675 27300664 ~ 27301565 (+) True XLOC_037169
TCONS_00075126 lncRNA upstream 146106 27182702 ~ 27225134 (+) True XLOC_037167
TCONS_00074905 lncRNA upstream 367924 26968430 ~ 27003316 (+) False XLOC_037167
TCONS_00075128 lncRNA downstream 39452 27411331 ~ 27416223 (+) False XLOC_037177
TCONS_00075129 lncRNA downstream 39736 27411615 ~ 27416223 (+) True XLOC_037177
TCONS_00075130 lncRNA downstream 435648 27807527 ~ 27811141 (+) True XLOC_037181
TCONS_00074908 lncRNA downstream 756819 28128698 ~ 28130735 (+) False XLOC_037187
TCONS_00074909 lncRNA downstream 757228 28129107 ~ 28130735 (+) True XLOC_037187
TCONS_00073178 mRNA upstream 15907 27354653 ~ 27355333 (+) True XLOC_037174
TCONS_00073176 mRNA upstream 15959 27352298 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073177 mRNA upstream 15959 27354414 ~ 27355281 (+) False XLOC_037174
TCONS_00073175 mRNA upstream 21879 27348809 ~ 27349361 (+) True XLOC_037173
TCONS_00073174 mRNA upstream 26557 27339505 ~ 27344683 (+) True XLOC_037172
TCONS_00073180 mRNA downstream 7135 27379014 ~ 27379721 (+) False XLOC_037176
TCONS_00073181 mRNA downstream 7314 27379193 ~ 27379739 (+) True XLOC_037176
TCONS_00073182 mRNA downstream 39623 27411502 ~ 27416612 (+) False XLOC_037177
TCONS_00073184 mRNA downstream 348549 27720428 ~ 27734078 (+) True XLOC_037178
TCONS_00073185 mRNA downstream 378611 27750490 ~ 27776997 (+) False XLOC_037179
TCONS_00073172 other upstream 88804 27282322 ~ 27282436 (+) True XLOC_037168
TCONS_00073169 other upstream 673935 26694869 ~ 26697305 (+) True XLOC_037166
TCONS_00073166 other upstream 866788 26199659 ~ 26504452 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073165 other upstream 959862 26199624 ~ 26411378 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073164 other upstream 1077651 26199624 ~ 26293589 (+) False XLOC_037163
TCONS_00073183 other downstream 348388 27720267 ~ 27733587 (+) False XLOC_037178
TCONS_00073189 other downstream 410625 27782504 ~ 27787376 (+) True XLOC_037180
TCONS_00073190 other downstream 446046 27817925 ~ 27822574 (+) True XLOC_037182
TCONS_00073191 other downstream 462566 27834445 ~ 27844628 (+) True XLOC_037183
TCONS_00073192 other downstream 465183 27837062 ~ 27838013 (+) False XLOC_037184

Expression Profile


//