RNA id: TCONS_00073868



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00073868
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_037613
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 6409157 ~ 6409271 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTAaaaagctagctctctgcaactctcacatggtcgcccactgaagctaagcagggctgtgccgggtcagtacctggatgggagaccacatgggaaagctaggttgctgtgtGTG

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000184055

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00075290 lncRNA downstream 1363168 5044975 ~ 5045989 (-) True XLOC_037603
TCONS_00073852 lncRNA downstream 1365069 5043087 ~ 5044088 (-) False XLOC_037603
TCONS_00075289 lncRNA downstream 1541718 4866100 ~ 4867439 (-) True XLOC_037602
TCONS_00075288 lncRNA downstream 1867336 4539475 ~ 4541821 (-) False XLOC_037600
TCONS_00073839 lncRNA downstream 2457331 3931723 ~ 3951826 (-) True XLOC_037596
TCONS_00073869 lncRNA upstream 5513 6414784 ~ 6502093 (-) True XLOC_037612
TCONS_00074961 lncRNA upstream 122278 6531549 ~ 6548796 (-) True XLOC_037614
TCONS_00073887 lncRNA upstream 948548 7357819 ~ 7359484 (-) True XLOC_037626
TCONS_00075291 lncRNA upstream 1089989 7499260 ~ 7505531 (-) True XLOC_037631
TCONS_00075292 lncRNA upstream 1532498 7941769 ~ 7942597 (-) True XLOC_037636
TCONS_00073866 mRNA downstream 28504 6371926 ~ 6380653 (-) True XLOC_037611
TCONS_00073865 mRNA downstream 36622 6371919 ~ 6372535 (-) False XLOC_037611
TCONS_00073864 mRNA downstream 201090 6118362 ~ 6208067 (-) True XLOC_037610
TCONS_00073862 mRNA downstream 492402 5893608 ~ 5916755 (-) False XLOC_037609
TCONS_00073863 mRNA downstream 492464 5898659 ~ 5916693 (-) True XLOC_037609
TCONS_00073870 mRNA upstream 198243 6607514 ~ 6618067 (-) True XLOC_037615
TCONS_00073871 mRNA upstream 214265 6623536 ~ 6624663 (-) True XLOC_037616
TCONS_00073872 mRNA upstream 249323 6658594 ~ 6661665 (-) False XLOC_037617
TCONS_00073873 mRNA upstream 249428 6658699 ~ 6661657 (-) False XLOC_037617
TCONS_00073874 mRNA upstream 249428 6658699 ~ 6661666 (-) True XLOC_037617
TCONS_00073841 other downstream 1962053 4443918 ~ 4447104 (-) True XLOC_037598
TCONS_00073830 other downstream 2889446 3508318 ~ 3519711 (-) True XLOC_037592
TCONS_00073827 other downstream 2912578 3490831 ~ 3496579 (-) True XLOC_037591
TCONS_00073809 other downstream 4071854 2330861 ~ 2337303 (-) True XLOC_037575
TCONS_00073808 other downstream 4131665 2226463 ~ 2277492 (-) False XLOC_037574
TCONS_00073875 other upstream 308406 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618
TCONS_00073897 other upstream 1113164 7522435 ~ 7539023 (-) True XLOC_037632
TCONS_00073901 other upstream 1232489 7641760 ~ 7655301 (-) True XLOC_037633
TCONS_00073935 other upstream 3334288 9743559 ~ 9805319 (-) False XLOC_037657
TCONS_00073936 other upstream 3361064 9770335 ~ 9805319 (-) True XLOC_037657

Expression Profile


//