RNA id: TCONS_00000650



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000650
length 800
RNA type mRNA
GC content 0.39
exon number 1
gene id XLOC_000382
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 32013688 ~ 32014487 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GCAACAGTCAAGTCAGTAGGACCAGCATTCCACAAGGCATCTCTGAGAGGAGGGGCCCTATCACTAAAAGAGCGTTTTTGACAACGGAGATACAGCTAGAGGGAGATAGCTGCCAGGAAGCCATTTCATTTCTAAAACACTGTTCTGATCTGGAGCAAGTGGCTGCAAAGATGAAATCTACTTTCCAGTATCGCCAGGAACTGATCCGCAATCCTGAAAAGTCGTCATCTGTTTTCAATATATTCCCTAGGTTTCTTGACACAAAAGGCCTGGTATGTGCTGCACCAACTGATGGTggtttaaaatggattttaatctGCTGATGTGACATGACATTTCTGTTTTAATCTATATAAAACATTAGGTGCTTCAAGACTTTGAGTTGCTGTTTGGAGTAGAGACTTCAGCAAAGCTTCTGGAGAAGTGGGGATCTTCTCTTAAACACAAAGTAATTGGAGAAGCCAAAAACCTGACCCAGTCATTTCATCTGAGTCGTCTGATCGAGTCTGCAGAGCAATGTGAAAGCAGTCAAGAAGTTACAGGTAGTTATTTATGTATCGCAATAATTGTGTGTTTCTTTTATGGCTTTTAGGCTTTATTATAAGTAATTTTAAGTCATACACATAGATTATCTTGATTTAATTCATGTAGATTGAAACAATTATGGGCCATGGTGTTTTCTGAAAGGATGTGAttaatcatatgcatttgttttaaaaataatgggCCATGATGTTTTCCTTTTCTTGACTTTTAGAGTGGGACAGTGACATGTCTTCACTGTTGTTGCTTCTCTATCT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000168045

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002849 lncRNA upstream 1310 32011880 ~ 32012378 (+) True XLOC_000381
TCONS_00003083 lncRNA upstream 1894 32010262 ~ 32011794 (+) True XLOC_000380
TCONS_00000637 lncRNA upstream 492716 31519239 ~ 31520972 (+) True XLOC_000371
TCONS_00002847 lncRNA upstream 654369 31354585 ~ 31359319 (+) False XLOC_000370
TCONS_00002846 lncRNA upstream 654369 31354585 ~ 31359319 (+) False XLOC_000370
TCONS_00000651 lncRNA downstream 2950 32017437 ~ 32018115 (+) True XLOC_000383
TCONS_00002850 lncRNA downstream 1503315 33517802 ~ 33518823 (+) True XLOC_000394
TCONS_00000683 lncRNA downstream 1682854 33697341 ~ 33701916 (+) True XLOC_000399
TCONS_00003084 lncRNA downstream 2217116 34231603 ~ 34234056 (+) False XLOC_000404
TCONS_00002851 lncRNA downstream 2217251 34231738 ~ 34232127 (+) True XLOC_000404
TCONS_00000649 mRNA upstream 34178 31942961 ~ 31979510 (+) True XLOC_000379
TCONS_00000648 mRNA upstream 145971 31864404 ~ 31867717 (+) True XLOC_000378
TCONS_00000646 mRNA upstream 214329 31725154 ~ 31799359 (+) False XLOC_000377
TCONS_00000647 mRNA upstream 233831 31725301 ~ 31779857 (+) True XLOC_000377
TCONS_00000644 mRNA upstream 290813 31706668 ~ 31722875 (+) False XLOC_000376
TCONS_00000652 mRNA downstream 37094 32051581 ~ 32077473 (+) False XLOC_000384
TCONS_00000654 mRNA downstream 39672 32054159 ~ 32074141 (+) True XLOC_000384
TCONS_00000655 mRNA downstream 326997 32341484 ~ 32385665 (+) False XLOC_000385
TCONS_00000656 mRNA downstream 327247 32341734 ~ 32342951 (+) True XLOC_000385
TCONS_00000658 mRNA downstream 506982 32521469 ~ 32693950 (+) False XLOC_000387
TCONS_00000645 other upstream 290813 31706669 ~ 31722875 (+) True XLOC_000376
TCONS_00000632 other upstream 949838 31057240 ~ 31063850 (+) True XLOC_000367
TCONS_00000628 other upstream 1048684 30955925 ~ 30965004 (+) True XLOC_000366
TCONS_00000618 other upstream 1786183 30227391 ~ 30227505 (+) True XLOC_000361
TCONS_00000617 other upstream 1847623 30165953 ~ 30166065 (+) True XLOC_000360
TCONS_00000653 other downstream 37126 32051613 ~ 32065030 (+) False XLOC_000384
TCONS_00000657 other downstream 499502 32513989 ~ 32514104 (+) True XLOC_000386
TCONS_00000661 other downstream 691622 32706109 ~ 32706227 (+) True XLOC_000388
TCONS_00000663 other downstream 1200754 33215241 ~ 33216718 (+) False XLOC_000390
TCONS_00000664 other downstream 1200756 33215243 ~ 33216083 (+) True XLOC_000390

Expression Profile


//