XLOC_000284 (slit2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_000284
gene name slit2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 23783349 ~ 23912788 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00000473
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Function

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slit2 Predicted to enable Roundabout binding activity and heparin binding activity. Acts upstream of or within endocardial progenitor cell migration to the midline involved in heart field formation; generation of neurons; and morphogenesis of a branching structure. Predicted to be located in extracellular region. Is expressed in several structures, including axial mesoderm; forebrain neural tube; hypochord; nervous system; and neural plate. Orthologous to human SLIT2 (slit guidance ligand 2).

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ZDB-GENE-010306-3 Predicted to enable Roundabout binding activity and heparin binding activity. Acts upstream of or within endocardial progenitor cell migration to the midline involved in heart field formation; generation of neurons; and morphogenesis of a branching structure. Predicted to be located in extracellular region. Is expressed in several structures, including axial mesoderm; forebrain neural tube; hypochord; nervous system; and neural plate. Orthologous to human SLIT2 (slit guidance ligand 2).

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XLOC_000280 chrna9 coding upstream 365412 23406403 ~ 23417937 (+)
XLOC_000279 rhoh coding upstream 384357 23398405 ~ 23398992 (+)
XLOC_000286 mab21l2 coding downstream 163455 24076243 ~ 24078099 (+)
XLOC_000287 BX119984.1 coding downstream 201737 24114525 ~ 24114558 (+)
XLOC_000288 NA coding downstream 205579 24118367 ~ 24119067 (+)
XLOC_000289 NA coding downstream 213592 24126380 ~ 24144170 (+)
XLOC_000290 NA coding downstream 424192 24336980 ~ 24343734 (+)
XLOC_000270 CR376846.1 non-coding upstream 1262023 22521212 ~ 22521326 (+)
XLOC_000269 NA non-coding upstream 1264595 22510734 ~ 22518754 (+)
XLOC_000263 NA non-coding upstream 2281865 21500645 ~ 21501484 (+)
XLOC_000292 NA non-coding downstream 449205 24361993 ~ 24363690 (+)

Expression


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