G2079657


Basic Information

Item Value
gene id G2079657
gene name NA
gene type misc
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048591.1
NCBI id CM023245.2
chromosome length 51556237
location 37815848 ~ 37819286 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU2377951
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>TU2377938
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>TU2377942
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>TU2377944
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Function

NR:

description
PREDICTED: matrix-remodeling-associated protein 5-like isoform X2

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU2377951 False 3361 lncRNA 0.41 2 37815848 37819286
TU2377938 False 3333 lncRNA 0.41 2 37815878 37819286
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TU2377944 True 3278 TUCP 0.41 3 37815878 37819286

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
LOC110508012 LOC106581399 coding upstream 246975 37536529 ~ 37568873 (+)
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trnat-agu-151 NA coding upstream 310214 37505561 ~ 37505634 (+)
mre11a mre11a coding upstream 458242 37318716 ~ 37357606 (+)
LOC110536894 NA coding upstream 540766 37031161 ~ 37276857 (+)
LOC110508017 NA coding downstream 233347 38052633 ~ 38060113 (+)
LOC110507217 NA coding downstream 650632 38469918 ~ 38474599 (+)
LOC110508002 LOC106581401 coding downstream 800264 38619550 ~ 38628170 (+)
LOC118944799 NA coding downstream 1220287 39039573 ~ 39039625 (+)
LOC110508028 neus coding downstream 1848703 39667989 ~ 39681560 (+)
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G2079643 NA non-coding upstream 98287 37717080 ~ 37717561 (+)
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G2079661 NA non-coding downstream 2883 37822169 ~ 37824025 (+)
G2079690 NA non-coding downstream 24571 37843857 ~ 37844332 (+)
G2079693 NA non-coding downstream 31721 37851007 ~ 37936371 (+)
G2079733 NA non-coding downstream 99877 37919163 ~ 37919722 (+)
G2080048 NA non-coding downstream 156031 37975317 ~ 37975666 (+)
G2079468 LOC106581367 other upstream 447712 37366739 ~ 37368136 (+)
G2079197 NA other upstream 535016 37279105 ~ 37280832 (+)
LOC110508005 LOC106613226 other upstream 1376494 36438225 ~ 36440709 (+)
G2078493 NA other upstream 1513806 36263506 ~ 36302664 (+)
G2080014 NA other downstream 125646 37944932 ~ 37945151 (+)
G2081884 LOC106581433 other downstream 2008372 39827658 ~ 39837383 (+)
LOC110507223 LOC106613251 other downstream 2076381 39781189 ~ 39938079 (+)
G2081949 NA other downstream 2112588 39931874 ~ 39933835 (+)
G2082162 NA other downstream 2137929 39957215 ~ 39957751 (+)
G2079621 NA non-coding upstream 144534 37670827 ~ 37671344 (+)
G2079617 NA non-coding upstream 149695 37665813 ~ 37666183 (+)

Expression


Co-expression Network