G68433


Basic Information

Item Value
gene id G68433
gene name NA
gene type non-coding
species eurasian perch (Perca fluviatilis)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_053117.1
NCBI id CM020914.1
chromosome length 43979800
location 41943696 ~ 42008298 (+)
genome version GENO_Pfluv_1.0_2020_eurasian_perch_Genome

Sequence

>TU91484
GTGCTGACCTGGGGGCTGAGAGGAGGCAGTGTTTTCACGGTGGCGGCAGACACCACGGTGTTGAGGCTGACGCAGTCCGATGAGTctggttcaggttcaggttctggttctggttccgGGTGGTCTGGGTGGTCTGGGTGGTCTGGGTGGCCCACGGTCTCCCTGGAGGGGCTGGAGCTCATGGAGCTGATGCCGCTGGTGGTGGTGTCCGTGTTGAAGCTCTGACTGCGGCTCTTAAACTGAGTGCTGGCGCCCCCCCCCACCACGTTCCCTCCGCTGGACGAGCTGCCTCCATCTCCTGAGGGTTAGACAGGGTCACAtgttaggggggggggggagtctgtctgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgcgtctggcgtacgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttctgtctgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91485
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgcgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91486
ctgcctgtgtctgtgtatctgtgtgtgtgtgtctgtttgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91487
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgcgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgactgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91488
tgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91489
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgcgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtgtg
>TU91490
gtgtgtctgtgtgtgtctgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgcgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91491
tgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtgtctgtgcgtgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91492
ctgcctgtgtctgtgtatctgtgtgtgtgtgtctgtttgtgtgtgtgtctgtctctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtgtctgtctctgtgtctgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctgtctgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt
>TU91494
tgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtctctctgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtctgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgcgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtctctgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtctctgtgtgtgtgtgtctgtctgtgtgtgtctctgtgtgtgt

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU91484 True 657 lncRNA 0.57 4 41955478 42008298
TU91485 False 267 lncRNA 0.50 3 41943696 42008298
TU91486 False 288 lncRNA 0.50 3 42003362 42008298
TU91487 False 371 lncRNA 0.50 2 41943696 42008298
TU91488 False 227 lncRNA 0.50 3 42003573 42008298
TU91489 False 204 lncRNA 0.50 2 41943696 41953714
TU91490 False 268 lncRNA 0.50 3 41992533 42008298
TU91491 False 237 lncRNA 0.50 2 41943696 42008298
TU91492 False 262 lncRNA 0.50 2 42003362 42008298
TU91494 False 339 lncRNA 0.50 2 42003573 42008298

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
npc1l1 npc1l1 coding upstream 11500 41889339 ~ 41932196 (+)
LOC120560218 NA coding upstream 232490 41707504 ~ 41711206 (+)
LOC120560215 NA coding upstream 241196 41699362 ~ 41702500 (+)
LOC120560214 NA coding upstream 289046 41641330 ~ 41654650 (+)
LOC120560213 NA coding upstream 307807 41630736 ~ 41635889 (+)
LOC120561109 NA coding downstream 45123 42053421 ~ 42070713 (+)
LOC120560236 LOC103396904,LOC100693342,LOC103375480,LOC104933652,LOC104940903 coding downstream 132285 42140583 ~ 42147455 (+)
LOC120560233 LOC103473932 coding downstream 142333 42150631 ~ 42158948 (+)
LOC120560192 NA coding downstream 209864 42218162 ~ 42240929 (+)
LOC120560201 NA coding downstream 314176 42322474 ~ 42420106 (+)
G68369 NA non-coding upstream 14555 41928654 ~ 41929141 (+)
G68366 NA non-coding upstream 15777 41863775 ~ 41927919 (+)
G68425 NA non-coding upstream 27036 41892909 ~ 41916660 (+)
G68427 NA non-coding upstream 40106 41902901 ~ 41903590 (+)
G68426 NA non-coding upstream 45267 41897926 ~ 41898429 (+)
G68447 NA non-coding downstream 15955 42024253 ~ 42043878 (+)
G68449 NA non-coding downstream 30770 42039068 ~ 42039465 (+)
G68451 NA non-coding downstream 31566 42039864 ~ 42140064 (+)
G68463 NA non-coding downstream 81743 42090041 ~ 42090526 (+)
G68472 NA non-coding downstream 99411 42107709 ~ 42112264 (+)
LOC120561105 NA other upstream 4638 41932563 ~ 41939058 (+)
aebp1b LOC104948491,LOC103367614 other upstream 150785 41720800 ~ 41792911 (+)
G68349 NA other upstream 538882 41366584 ~ 41404814 (+)
anxa1a anxa1,LOC103133394,LOC103146482 other upstream 672847 41135777 ~ 41270849 (+)
LOC120561097 LOC106674743,LOC106674997,LOC102290162 other upstream 676177 41266647 ~ 41267519 (+)
G68504 NA other downstream 314175 42322473 ~ 42396643 (+)
G68598 NA other downstream 955742 42964040 ~ 43023819 (+)
LOC120561116 LOC101485158,LOC102302930,LOC100699693,LOC106633016 other downstream 967848 42976146 ~ 42998383 (+)
entr1 NA other downstream 1016967 43025265 ~ 43038474 (+)
G68626 NA other downstream 1023969 43032267 ~ 43162404 (+)

Expression


Co-expression Network

Homologous

species gene id symbol gene type chromosome NCBI id location