pln


Basic Information

Item Value
gene id pln
gene name NA
gene type misc
species striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_047613.1
NCBI id CM018559.1
chromosome length 22090854
location 16134134 ~ 16142616 (-)
genome version GENO_Phyp_1.0_2019_striped_catfish_Genome

Sequence

>TU351347
TGCGCTCTTTCACTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAAATAACGGACgggattaaaaaataaaaaccattcAGCAAAGGCATGCTGAGACGCCCACTTTTCATAAGCCAGTCAAAGTCTGAGGGATAAAACCCAAAGCCCACTAATACATGCTGTTTTACCCAGAAATGTCAGTTTAAAGCCCTATTTGGATTGGATTCATTTTATACGTGGAGGTGGactaatgtaattattaccaatgtatctctgggattttggTCTGAATCCGTCATGTCGGATAAAATATAGATGAcgtttaaaataacttttcagAGAAGTGATGCTTTTGGGGTTTTAGGGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACACCTACTGAGCCACCGCTTATGTTTCTTTTTGCC
>TU351348
TGCGCTCTTTCACTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACACCTACTGAGCCACCGCTTATGTTTCTTTTTGCC
>TU351350
TGCGCTCTTTCACTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTGTGGACTCCACCAGCTCCTGGACCACCTCTGTCCTCACGAGCACTACGAGCACCTCCACACCACACCCTGCACTcctacacctctctctctcctctctctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgcacttcACCTCCAGCACCCCACGAGTACAGTGCTAGCGTACTATGGAGAAGGTGCAGCACATAACCCGTGCGGCCATCAGGAGGGCGTCCACCATGGAGGTTCCACAGCAGGCTAAGCAGAACATGCAGAACCTCTTCGTCAACTTCTGCCTCATCCTCATCTGCCTGCTGCTCATCTACATCATCGTCTTGCTAATCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAAATAACGGACgggattaaaaaataaaaaccattcAGCAAAGGCATGCTGAGACGCCCACTTTTCATAAGCCAGTCAAAGTCTGAGGGATAAAACCCAAAGCCCACTAATACATGCTGTTTTACCCAGAAATGTCAGTTTAAAGCCCTATTTGGATTGGATTCATTTTATACGTGGAGGTGGactaatgtaattattaccaatgtatctctgggattttggTCTGAATCCGTCATGTCGGATAAAATATAGATGAcgtttaaaataacttttcagAGAAGTGATGCTTTTGGGGTTTTAGGGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaagatatatatatatatatatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACACCTACTGAGCCACCGCTTATGTTTCTTTTTGCC
>TU351351
TGCGCTCTTTCACTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTGTGGACTCCACCAGCTCCTGGACCACCTCTGTCCTCACGAGCACTACGAGCACCTCCACACCACACCCTGCACTcctacacctctctctctcctctctctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgcacttcACCTCCAGCACCCCACGAGTACAGTGCTAGCGTACTATGGAGAAGGTGCAGCACATAACCCGTGCGGCCATCAGGAGGGCGTCCACCATGGAGGTTCCACAGCAGGCTAAGCAGAACATGCAGAACCTCTTCGTCAACTTCTGCCTCATCCTCATCTGCCTGCTGCTCATCTACATCATCGTCTTGCTAATCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAAATAACGGACgggattaaaaaataaaaaccattcAGCAAAGGCATGCTGAGACGCCCACTTTTCATAAGCCAGTCAAAGTCTGAGGGATAAAACCCAAAGCCCACTAATACATGCTGTTTTACCCAGAAATGTCAGTTTAAAGCCCTATTTGGATTGGATTCATTTTATACGTGGAGGTGGactaatgtaattattaccaatgtatctctgggattttggTCTGAATCCGTCATGTCGGATAAAATATAGATGAcgtttaaaataacttttcagAGAAGTGATGCTTTTGGGGTTTTAGGGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACACCTACTGAGCCACCGCTTATGTTTCTTTTTGCC
>XM_026922822.2
CTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTGTGGACTCCACCAGCTCCTGGACCACCTCTGTCCTCACGAGCACTACGAGCACCTCCACACCACACCCTGCACTcctacacctctctctctcctctctctctctctgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgcacttcACCTCCAGCACCCCACGAGTACAGTGCTAGCGTACTATGGAGAAGGTGCAGCACATAACCCGTGCGGCCATCAGGAGGGCGTCCACCATGGAGGTTCCACAGCAGGCTAAGCAGAACATGCAGAACCTCTTCGTCAACTTCTGCCTCATCCTCATCTGCCTGCTGCTCATCTACATCATCGTCTTGCTAATCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAAATAACGGACgggattaaaaaataaaaaccattcAGCAAAGGCATGCTGAGACGCCCACTTTTCATAAGCCAGTCAAAGTCTGAGGGATAAAACCCAAAGCCCACTAATACATGCTGTTTTACCCAGAAATGTCAGTTTAAAGCCCTATTTGGATTGGATTCATTTTATACGTGGAGGTGGactaatgtaattattaccaatgtatctctgggattttggTCTGAATCCGTCATGTCGGATAAAATATAGATGAcgtttaaaataacttttcagAGAAGTGATGCTTTTGGGGTTTTAGGGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACA
>XR_003403300.2
CTCATAAACTCTCAGACATCCTGAACAAAACTCCCAGAGCGCACTGTCAGCCGCTGAAGCAGTGTGTGAACCGGAGCGAGGACGTAAAACCCACCCGCGGAGGCTGGACCTCACTGCCGCGGCCTCGCTTCTACAGGCTCAGCTCTTTCCATGTGTGAAGGATGGACAGCGTGGTGTAACCTCGTCCTCCTCCCGGCACCGCACGCTTAGCACGTCTGTCCCTGAGCCACACGGTGCCTCACTGCGAGCTCGCACTCTGCGATTGTCCAGCCCCGACACACCAGCTCTGAAATCTTCACCATGGATCTCACCAACAACCGGGGTCTCAACCTGCTGCTCAACTTCCTGCTCATCGTCATCGTGCTGCTGCTCATGCTCATTCTGGTCAAGCTCATGTGACCTGAGCTGAGCTGCTCACCAAGCACGCAAGACTTAATATGGCCTGAACACATTTACTACAGAGGGAGAGGCATCgggctctttctctctctctctctctctctctctctcacacgacTTGTCTGTTTGAGTGTCTGTTCCACTTTCTCACTTTATAAATCGCAATTTGATGCATCGCTTTAAGACTAAGTGCTCCTTAAAGCAACGTAGGAGGTCTTTTATGTGGAAAAGATGTGCGTGTTTTAACGACAACCTAAAATCAAAACTGACCTTTTTACCATGAGAGCGCACATCCTTGTTCAGATTGTGCTTGAAAAACAATTCTAATTTGTCCATAATCTTCCACTAAAGTGCAGCACTAAACGTTTTCCTGCCTCTAAATAGCCTCAGACTTTTAGCTACGTCACTGTGAAAATAACGGACgggattaaaaaataaaaaccattcAGCAAAGGCATGCTGAGACGCCCACTTTTCATAAGCCAGTCAAAGTCTGAGGGATAAAACCCAAAGCCCACTAATACATGCTGTTTTACCCAGAAATGTCAGTTTAAAGCCCTATTTGGATTGGATTCATTTTATACGTGGAGGTGGactaatgtaattattaccaatgtatctctgggattttggTCTGAATCCGTCATGTCGGATAAAATATAGATGAcgtttaaaataacttttcagAGAAGTGATGCTTTTGGGGTTTTAGGGAAGTTATTGAGCTCCACATGCGCACAGGTAAAGCTTACATACAtgtcatggtcatgtgaccttttgCTCAAACACAACTTGTGCAGCCACAAGACTTACAACATGTGCTTATAATAGAGGTCAATACGATCAGTTTGGTGTATGTAACAggagtgtaaacctcaggcttcaaTTCTTACCAGACTTGTGTCTGAAAATCTTATCCATCCGAACAGCACTTAAGACACGTAAGTGATAAACACGGCTTCCTACTCGCTTGCACCATCTGGTGGTGATGTTTATACTGCAATGATTAAAACCCTAAGACCAATGTCTTTAATTCCACTCCTCCATCCTTCTCCCTATGCCCTATAAACtgcacagtgcattatgggagatCTGCAGACCCTAGGCTACACTGTTCGATTTGGTCTGATGATAAAACTTCTCACTACATAGTGAACATGGGTAGGGTATCGACTTTGCCTCTCAAACATACCTGATTCAGCTGACTAGGAGCTGGGTGATAAGACTCGATTGTTACTCATGGTGACGAACAGCTGGTGTGTaccaaatgtttcatttttaaagtgttttatttgtctggACGTCAAATGAAATGTCTTTAAAACCGTCCTTGTCACAGAAACTTTTAAATGCGGCActaggggtgggtgatatgacaaaagtcatatatcatgatacttaaagatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatacacacaaatatatgaaaaataagtttgctaaaaaaataaaaacagcagcaaacCAATAGTGTCGCGATCATGACTGAGTTGTAGGATactgaaataatttaaaaaagaaggaaaaataaatgctgtaaaaaaaaaaactgtacatatTACTACACaaaattttaacaacaaatcagcAACCAATCAGttttaattctattttaaatattaaaaaatatttataccaAAATCTGTGATATCTCAGAAGAGTATTGCGATATAATTgttcacaatatcaatattattgtCATATTACCCAGCCCTATGCttcactactgtttttttttgtttgtttgttttttagcagTTCGCAAAAGTAAATAtcttgaaatatattttaagtatattaatgcagtatttttgtcaTGTCATTCACCCTCATTGCCATGTGTGGTAGAGCTGAAATGATCAAACTGTGCTGCACGCTGCCTTCCAGGACTCAGACTGATGACCTCTGATCTAAGAAATGTAATAACGTGGCCATGATGGGTCTCCAAatcataaagaaagaaagaaagctgcCTGAGTGAAACGTGGTGTACAGTGATGAAACACACATGGCTGTTCgattacagaaaataatcacCATTTTACAACCTGAAACACTGATGTTACACTGATGTTACACTGTTTGGTTTGTATATAGTTTCTGTAGAAATGTAATCGATGTTGTTTGTACATTCACGAGTgtgctgattttaaaatgtcagcAGATACACAAGAGAGAGATTAGAATAAAGGTGTAAGTGAATTAAACTGCAAATAAACATCCTCCACTGATGATCACA

Function

GO:

id name namespace
GO:0048738 cardiac muscle tissue development biological_process
GO:0007507 heart development biological_process
GO:0008015 blood circulation biological_process
GO:0003013 circulatory system process biological_process
GO:0060537 muscle tissue development biological_process
GO:0014706 striated muscle tissue development biological_process

KEGG:

id description
ko05410 Hypertrophic cardiomyopathy

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU351347 False 2690 lncRNA 0.41 3 16134134 16142616
TU351348 False 2413 lncRNA 0.40 4 16134134 16142616
TU351350 False 3046 lncRNA 0.42 4 16134134 16142616
TU351351 True 3054 lncRNA 0.42 4 16134134 16142616
XM_026922822.2 False 3035 mRNA 0.41 3 16134167 16142604
XR_003403300.2 False 2697 misc_RNA 0.40 2 16134167 16142604

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
trnav-cac_21 NA coding downstream 354835 15779227 ~ 15779299 (-)
trnad-guc_29 NA coding downstream 359954 15774109 ~ 15774180 (-)
trnav-cac_19 NA coding downstream 360172 15773890 ~ 15773962 (-)
trnad-guc_28 NA coding downstream 363251 15770812 ~ 15770883 (-)
trnav-cac_17 NA coding downstream 363469 15770593 ~ 15770665 (-)
si:dkeyp-114g9.1 LOC108257881,LOC107603058 coding upstream 23813 16166429 ~ 16181922 (-)
slc35f1 slc35f1,LOC107678858,LOC107727669,LOC107697151,LOC107743307,LOC106571386 coding upstream 41637 16184253 ~ 16299085 (-)
nus1 nus1,LOC107549681,LOC107736830 coding upstream 170995 16313611 ~ 16326865 (-)
LOC113531921 LOC108257860 coding upstream 184965 16327581 ~ 16334071 (-)
dcbld1 dcbld1 coding upstream 219486 16362102 ~ 16398260 (-)
G296237 NA non-coding downstream 810724 15322991 ~ 15323410 (-)
G295909 NA non-coding downstream 1341385 14792540 ~ 14792749 (-)
G295836 NA non-coding downstream 1445498 14688358 ~ 14688636 (-)
G295828 NA non-coding downstream 1463824 14670101 ~ 14670310 (-)
G295827 NA non-coding downstream 1464409 14669508 ~ 14669725 (-)
G296731 NA non-coding upstream 9718 16152334 ~ 16155973 (-)
G296734 NA non-coding upstream 14718 16157334 ~ 16165845 (-)
G296733 NA non-coding upstream 20875 16163491 ~ 16165288 (-)
LOC117599726 NA non-coding upstream 196466 16339082 ~ 16342070 (-)
G296823 NA non-coding upstream 449297 16591913 ~ 16592120 (-)
G296263 cx32,LOC108257940,LOC108424424 other downstream 651773 15463081 ~ 15482361 (-)
pkib pkib other downstream 829837 15273854 ~ 15304297 (-)
pex7 pex7,LOC107727680,LOC107676274 other downstream 1362099 14726401 ~ 14772035 (-)
trnal-cag_15 NA other downstream 1537739 14596313 ~ 14596395 (-)
trnal-cag_14 NA other downstream 1539503 14594549 ~ 14594631 (-)
G296802 igf2r other upstream 412487 16555103 ~ 16557927 (-)
ttc32 ttc32 other upstream 900550 17043166 ~ 17046831 (-)
gtf2h5 gtf2h5,tf2h5,LOC107721375,LOC107659223 other upstream 1091361 17233977 ~ 17236129 (-)
esr1 esr1 other upstream 1342968 17485584 ~ 17506658 (-)
acot20 LOC108257587,LOC108257591 other upstream 1564670 17707286 ~ 17715272 (-)

Expression


Co-expression Network