RNA id: TCONS_00045414


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00045414
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_022847
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 14635303 ~ 14635419 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agccacagccatatcaccctgcagcccaagagtggttattcactgaagctaagcagggctgagcctggtcagtaccttgatgggagaccacatagaaaaactagtttgctgtcggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193015

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046951 lncRNA upstream 49494 14582244 ~ 14585809 (+) True XLOC_022845
TCONS_00045407 lncRNA upstream 79949 14553315 ~ 14555354 (+) True XLOC_022843
TCONS_00045405 lncRNA upstream 84690 14541089 ~ 14550613 (+) False XLOC_022843
TCONS_00045406 lncRNA upstream 85720 14541281 ~ 14549583 (+) False XLOC_022843
TCONS_00046950 lncRNA upstream 556667 14055096 ~ 14078636 (+) True XLOC_022837
TCONS_00045432 lncRNA downstream 1514021 16149440 ~ 16164447 (+) True XLOC_022858
TCONS_00046802 lncRNA downstream 1531346 16166765 ~ 16185858 (+) False XLOC_022859
TCONS_00046952 lncRNA downstream 1536492 16171911 ~ 16194730 (+) True XLOC_022859
TCONS_00045433 lncRNA downstream 1538780 16174199 ~ 16175294 (+) False XLOC_022860
TCONS_00045434 lncRNA downstream 1539100 16174519 ~ 16177300 (+) False XLOC_022860
TCONS_00045409 mRNA upstream 33523 14595460 ~ 14601780 (+) False XLOC_022844
TCONS_00045411 mRNA upstream 35047 14595680 ~ 14600256 (+) False XLOC_022844
TCONS_00045410 mRNA upstream 35085 14595680 ~ 14600218 (+) False XLOC_022844
TCONS_00045412 mRNA upstream 35169 14595719 ~ 14600134 (+) True XLOC_022844
TCONS_00045408 mRNA upstream 38005 14581864 ~ 14597298 (+) False XLOC_022844
TCONS_00045415 mRNA downstream 78357 14713776 ~ 14725763 (+) True XLOC_022848
TCONS_00045416 mRNA downstream 166425 14801844 ~ 14810634 (+) True XLOC_022849
TCONS_00045417 mRNA downstream 223819 14859238 ~ 14884543 (+) False XLOC_022850
TCONS_00045418 mRNA downstream 223855 14859274 ~ 14885354 (+) True XLOC_022850
TCONS_00045419 mRNA downstream 301786 14937205 ~ 15107330 (+) False XLOC_022851
TCONS_00045400 other upstream 284283 14350900 ~ 14351020 (+) True XLOC_022840
TCONS_00045390 other upstream 669364 13925066 ~ 13965939 (+) False XLOC_022836
TCONS_00045382 other upstream 1566923 13017659 ~ 13068380 (+) True XLOC_022829
TCONS_00045367 other upstream 2411643 12157404 ~ 12223660 (+) True XLOC_022818
TCONS_00045358 other upstream 2573951 12058002 ~ 12061352 (+) True XLOC_022814
TCONS_00045420 other downstream 384983 15020402 ~ 15044788 (+) False XLOC_022851
TCONS_00045423 other downstream 777570 15412989 ~ 15413105 (+) True XLOC_022853
TCONS_00045443 other downstream 1758108 16393527 ~ 16550549 (+) False XLOC_022862
TCONS_00045446 other downstream 2172102 16807521 ~ 16807648 (+) True XLOC_022864
TCONS_00045449 other downstream 2347884 16983303 ~ 16985539 (+) False XLOC_022866