RNA id: TCONS_00045423


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00045423
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_022853
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007135.7
NCBI id CM002908.2
chromosome length 42172926
location 15412989 ~ 15413105 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TGCTacagtcatatcaccctgcagcccaagactggttgctcactgaagctaagcaagctTGAGcccggtcagtatctggatgggagaccacattaaAAAACAAGGTTGCTGTTGGTA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187820

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00046951 lncRNA upstream 827180 14582244 ~ 14585809 (+) True XLOC_022845
TCONS_00045407 lncRNA upstream 857635 14553315 ~ 14555354 (+) True XLOC_022843
TCONS_00045405 lncRNA upstream 862376 14541089 ~ 14550613 (+) False XLOC_022843
TCONS_00045406 lncRNA upstream 863406 14541281 ~ 14549583 (+) False XLOC_022843
TCONS_00046950 lncRNA upstream 1334353 14055096 ~ 14078636 (+) True XLOC_022837
TCONS_00045432 lncRNA downstream 736335 16149440 ~ 16164447 (+) True XLOC_022858
TCONS_00046802 lncRNA downstream 753660 16166765 ~ 16185858 (+) False XLOC_022859
TCONS_00046952 lncRNA downstream 758806 16171911 ~ 16194730 (+) True XLOC_022859
TCONS_00045433 lncRNA downstream 761094 16174199 ~ 16175294 (+) False XLOC_022860
TCONS_00045434 lncRNA downstream 761414 16174519 ~ 16177300 (+) False XLOC_022860
TCONS_00045422 mRNA upstream 134214 15277216 ~ 15278775 (+) True XLOC_022852
TCONS_00045419 mRNA upstream 305659 14937205 ~ 15107330 (+) False XLOC_022851
TCONS_00045421 mRNA upstream 305659 15020402 ~ 15107330 (+) True XLOC_022851
TCONS_00045418 mRNA upstream 527635 14859274 ~ 14885354 (+) True XLOC_022850
TCONS_00045417 mRNA upstream 528446 14859238 ~ 14884543 (+) False XLOC_022850
TCONS_00045425 mRNA downstream 241964 15655069 ~ 15669056 (+) False XLOC_022854
TCONS_00045424 mRNA downstream 241964 15655069 ~ 15669056 (+) False XLOC_022854
TCONS_00045426 mRNA downstream 242128 15655233 ~ 15669210 (+) True XLOC_022854
TCONS_00045427 mRNA downstream 256908 15670013 ~ 15671038 (+) True XLOC_022855
TCONS_00045428 mRNA downstream 484612 15897717 ~ 16136569 (+) False XLOC_022856
TCONS_00045420 other upstream 368201 15020402 ~ 15044788 (+) False XLOC_022851
TCONS_00045413 other upstream 776686 14623831 ~ 14636303 (+) True XLOC_022846
TCONS_00045414 other upstream 777570 14635303 ~ 14635419 (+) True XLOC_022847
TCONS_00045400 other upstream 1061969 14350900 ~ 14351020 (+) True XLOC_022840
TCONS_00045390 other upstream 1447050 13925066 ~ 13965939 (+) False XLOC_022836
TCONS_00045443 other downstream 980422 16393527 ~ 16550549 (+) False XLOC_022862
TCONS_00045446 other downstream 1394416 16807521 ~ 16807648 (+) True XLOC_022864
TCONS_00045449 other downstream 1570198 16983303 ~ 16985539 (+) False XLOC_022866
TCONS_00045453 other downstream 1592573 17005678 ~ 17011082 (+) False XLOC_022867
TCONS_00045465 other downstream 1784118 17197223 ~ 17209646 (+) False XLOC_022869