RNA id: TCONS_00058612



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058612
length 411
RNA type mRNA
GC content 0.49
exon number 3
gene id XLOC_029919
representative False

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 13243446 ~ 13249866 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATGCGTCATATATCTATTCTCGGATTTCTGAGTGTTTTTCTGCTGGTCCTGGACCCAGTTCAGAGCAATCCGATCATGGCTCAGTGTGTGGAGCACACATACTGCTCGTCCACACTGAAAGAGTACCACGAACAGCTCATCAACCTGCCCAGCCGGATCAATGAGCGCAGCATCGCTGGATGGAGCTACACGGATAACATCGACTTGGAACGTGTGCCACAGAGAATCTCTGAAGCAAACTGCCTAAACAGTCATTACTGTAAGGGGTACGACAGCGACTTCAGTCTGGAGAGCGTCCCGATCTCAATCAAAATGCCATTTCTCCGAAAAAACCCAAGATGCCCGACCTACGCACTGGAATTCGAGGACGTCAACATCGCCTGTATATGTGCAATATCTAGACAGAATTAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000186140

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061409 lncRNA upstream 144990 13096467 ~ 13098456 (+) True XLOC_029918
TCONS_00061663 lncRNA upstream 244405 12992736 ~ 12999041 (+) False XLOC_029917
TCONS_00061664 lncRNA upstream 244405 12993039 ~ 12999041 (+) False XLOC_029917
TCONS_00061665 lncRNA upstream 244405 12993144 ~ 12999041 (+) True XLOC_029917
TCONS_00058607 lncRNA upstream 392191 12845292 ~ 12851255 (+) True XLOC_029913
TCONS_00061666 lncRNA downstream 41747 13291009 ~ 13292474 (+) True XLOC_029922
TCONS_00058627 lncRNA downstream 211850 13461112 ~ 13468268 (+) True XLOC_029929
TCONS_00061410 lncRNA downstream 353967 13603229 ~ 13603662 (+) False XLOC_029932
TCONS_00058632 lncRNA downstream 354274 13603536 ~ 13616296 (+) False XLOC_029932
TCONS_00061411 lncRNA downstream 360134 13609396 ~ 13610301 (+) True XLOC_029932
TCONS_00058610 mRNA upstream 263460 12908781 ~ 12979986 (+) True XLOC_029915
TCONS_00058608 mRNA upstream 336904 12888260 ~ 12906542 (+) False XLOC_029914
TCONS_00058609 mRNA upstream 340513 12888816 ~ 12902933 (+) True XLOC_029914
TCONS_00058606 mRNA upstream 378060 12836913 ~ 12865386 (+) False XLOC_029913
TCONS_00058605 mRNA upstream 438540 12743640 ~ 12804906 (+) True XLOC_029912
TCONS_00058618 mRNA downstream 58877 13308139 ~ 13335624 (+) False XLOC_029925
TCONS_00058619 mRNA downstream 77503 13326765 ~ 13335624 (+) True XLOC_029925
TCONS_00058620 mRNA downstream 104604 13353866 ~ 13392579 (+) False XLOC_029926
TCONS_00058621 mRNA downstream 109884 13359146 ~ 13392962 (+) False XLOC_029926
TCONS_00058622 mRNA downstream 124331 13373593 ~ 13376424 (+) True XLOC_029927
TCONS_00058611 other upstream 315892 12927438 ~ 12927554 (+) True XLOC_029916
TCONS_00058604 other upstream 632563 12610802 ~ 12610883 (+) True XLOC_029911
TCONS_00058601 other upstream 701742 12530402 ~ 12541704 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058595 other upstream 1342772 11900557 ~ 11900674 (+) True XLOC_029903
TCONS_00058594 other upstream 1393955 11849377 ~ 11849491 (+) True XLOC_029902
TCONS_00058614 other downstream 39566 13288828 ~ 13288906 (+) True XLOC_029920
TCONS_00058615 other downstream 40091 13289353 ~ 13289433 (+) True XLOC_029921
TCONS_00058616 other downstream 47045 13296307 ~ 13296422 (+) True XLOC_029923
TCONS_00058617 other downstream 50069 13299331 ~ 13299414 (+) True XLOC_029924
TCONS_00058637 other downstream 1392890 14642152 ~ 14642269 (+) True XLOC_029938

Expression Profile


//