RNA id: TCONS_00058595



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058595
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.53
exon number 1
gene id XLOC_029903
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 11900557 ~ 11900674 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTAGCCGGCAgcaagctctctgcaactctcacatggtcgcccactgaagcaaagcagggctgcgcctggtcaatacctggatgggagatcacatgggaaagttaagcctggtttata

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000125015

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00058591 lncRNA upstream 84078 11812080 ~ 11816479 (+) False XLOC_029900
TCONS_00061659 lncRNA upstream 172681 11727284 ~ 11727876 (+) True XLOC_029899
TCONS_00061657 lncRNA upstream 293851 11576248 ~ 11606706 (+) False XLOC_029897
TCONS_00061660 lncRNA downstream 9041 11909715 ~ 11915290 (+) True XLOC_029904
TCONS_00061661 lncRNA downstream 81912 11982586 ~ 11984884 (+) True XLOC_029906
TCONS_00061408 lncRNA downstream 124845 12025519 ~ 12025954 (+) True XLOC_029907
TCONS_00058600 lncRNA downstream 628095 12528769 ~ 12537080 (+) False XLOC_029909
TCONS_00061662 lncRNA downstream 629728 12530402 ~ 12549604 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058593 mRNA upstream 36133 11840905 ~ 11864424 (+) True XLOC_029901
TCONS_00058592 mRNA upstream 64000 11812089 ~ 11836557 (+) True XLOC_029900
TCONS_00058590 mRNA upstream 485909 11407535 ~ 11414648 (+) True XLOC_029895
TCONS_00058589 mRNA upstream 538964 11290851 ~ 11361593 (+) False XLOC_029894
TCONS_00058579 mRNA upstream 1807126 10084100 ~ 10093431 (+) True XLOC_029883
TCONS_00058596 mRNA downstream 43118 11943792 ~ 11960218 (+) False XLOC_029905
TCONS_00058597 mRNA downstream 43380 11944054 ~ 11953275 (+) True XLOC_029905
TCONS_00058598 mRNA downstream 614728 12515402 ~ 12517368 (+) True XLOC_029908
TCONS_00058599 mRNA downstream 628019 12528693 ~ 12549732 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058603 mRNA downstream 689729 12590403 ~ 12625837 (+) True XLOC_029910
TCONS_00058594 other upstream 51066 11849377 ~ 11849491 (+) True XLOC_029902
TCONS_00058587 other upstream 1150753 10747294 ~ 10749804 (+) False XLOC_029891
TCONS_00058588 other upstream 1151194 10747740 ~ 10749363 (+) True XLOC_029891
TCONS_00058586 other upstream 1178995 10719453 ~ 10721562 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058585 other upstream 1178998 10719302 ~ 10721559 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058601 other downstream 629728 12530402 ~ 12541704 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058604 other downstream 710128 12610802 ~ 12610883 (+) True XLOC_029911
TCONS_00058611 other downstream 1026764 12927438 ~ 12927554 (+) True XLOC_029916
TCONS_00058614 other downstream 1388154 13288828 ~ 13288906 (+) True XLOC_029920
TCONS_00058615 other downstream 1388679 13289353 ~ 13289433 (+) True XLOC_029921

Expression Profile


//