RNA id: TCONS_00058594



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058594
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_029902
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 11849377 ~ 11849491 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ACCGGCAGCAAaaaccctgcagcccaagaccgattactcactgaagctaagtagggctgagcctggtcagtacctggataggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182206

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00058591 lncRNA upstream 32898 11812080 ~ 11816479 (+) False XLOC_029900
TCONS_00061659 lncRNA upstream 121501 11727284 ~ 11727876 (+) True XLOC_029899
TCONS_00061655 lncRNA upstream 242671 11575239 ~ 11606706 (+) False XLOC_029897
TCONS_00061657 lncRNA upstream 242671 11576248 ~ 11606706 (+) False XLOC_029897
TCONS_00061658 lncRNA upstream 242671 11576442 ~ 11606706 (+) True XLOC_029897
TCONS_00061660 lncRNA downstream 60224 11909715 ~ 11915290 (+) True XLOC_029904
TCONS_00061661 lncRNA downstream 133095 11982586 ~ 11984884 (+) True XLOC_029906
TCONS_00061408 lncRNA downstream 176028 12025519 ~ 12025954 (+) True XLOC_029907
TCONS_00058600 lncRNA downstream 679278 12528769 ~ 12537080 (+) False XLOC_029909
TCONS_00061662 lncRNA downstream 680911 12530402 ~ 12549604 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058592 mRNA upstream 12820 11812089 ~ 11836557 (+) True XLOC_029900
TCONS_00058590 mRNA upstream 434729 11407535 ~ 11414648 (+) True XLOC_029895
TCONS_00058589 mRNA upstream 487784 11290851 ~ 11361593 (+) False XLOC_029894
TCONS_00058579 mRNA upstream 1755946 10084100 ~ 10093431 (+) True XLOC_029883
TCONS_00058577 mRNA upstream 1793036 10046643 ~ 10056341 (+) False XLOC_029882
TCONS_00058596 mRNA downstream 94301 11943792 ~ 11960218 (+) False XLOC_029905
TCONS_00058597 mRNA downstream 94563 11944054 ~ 11953275 (+) True XLOC_029905
TCONS_00058598 mRNA downstream 665911 12515402 ~ 12517368 (+) True XLOC_029908
TCONS_00058599 mRNA downstream 679202 12528693 ~ 12549732 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058603 mRNA downstream 740912 12590403 ~ 12625837 (+) True XLOC_029910
TCONS_00058587 other upstream 1099573 10747294 ~ 10749804 (+) False XLOC_029891
TCONS_00058588 other upstream 1100014 10747740 ~ 10749363 (+) True XLOC_029891
TCONS_00058586 other upstream 1127815 10719453 ~ 10721562 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058585 other upstream 1127818 10719302 ~ 10721559 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058584 other upstream 1337049 10511958 ~ 10512328 (+) True XLOC_029889
TCONS_00058595 other downstream 51066 11900557 ~ 11900674 (+) True XLOC_029903
TCONS_00058601 other downstream 680911 12530402 ~ 12541704 (+) False XLOC_029909
TCONS_00058604 other downstream 761311 12610802 ~ 12610883 (+) True XLOC_029911
TCONS_00058611 other downstream 1077947 12927438 ~ 12927554 (+) True XLOC_029916
TCONS_00058614 other downstream 1439337 13288828 ~ 13288906 (+) True XLOC_029920

Expression Profile


//