RNA id: TCONS_00058584



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00058584
length 309
RNA type processed_transcript
GC content 0.32
exon number 2
gene id XLOC_029889
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007116.7
NCBI id CM002889.2
chromosome length 72500376
location 10511958 ~ 10512328 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GATGATaggttattaattatattataaatggttatgttctggtcaatgaaataataccCTTAggagaattctgctttgcatttttctatgcattactaacatcactaaaccagacatttgttttataagttaaccaaatattcgCAGAGATTCAGCGGTTTTTGTCTGACGCGTTTGCCATTCATgccagtcagtgaaaaaaaagtaactgtggCCCTGTTTGCAGGTATTAAGATTcgttttcatcaatctgatgcaacttttattatttacaggacgtaaaaatgcaattaaaagtttcaaatcaat

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000138779

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00061648 lncRNA upstream 66780 10379331 ~ 10445178 (+) False XLOC_029888
TCONS_00061649 lncRNA upstream 66780 10430572 ~ 10445178 (+) False XLOC_029888
TCONS_00061650 lncRNA upstream 66780 10430619 ~ 10445178 (+) True XLOC_029888
TCONS_00058582 lncRNA upstream 81312 10379293 ~ 10430646 (+) False XLOC_029888
TCONS_00061404 lncRNA upstream 236405 10246859 ~ 10275553 (+) True XLOC_029885
TCONS_00061651 lncRNA downstream 207839 10720167 ~ 10721819 (+) True XLOC_029890
TCONS_00061652 lncRNA downstream 249166 10761494 ~ 10784742 (+) False XLOC_029892
TCONS_00061405 lncRNA downstream 249248 10761576 ~ 10764166 (+) True XLOC_029892
TCONS_00061653 lncRNA downstream 450699 10963027 ~ 10964817 (+) True XLOC_029893
TCONS_00061406 lncRNA downstream 804841 11317169 ~ 11366499 (+) True XLOC_029894
TCONS_00058579 mRNA upstream 418527 10084100 ~ 10093431 (+) True XLOC_029883
TCONS_00058577 mRNA upstream 455617 10046643 ~ 10056341 (+) False XLOC_029882
TCONS_00058578 mRNA upstream 455622 10046698 ~ 10056336 (+) True XLOC_029882
TCONS_00058574 mRNA upstream 465775 10014604 ~ 10046183 (+) False XLOC_029881
TCONS_00058589 mRNA downstream 778523 11290851 ~ 11361593 (+) False XLOC_029894
TCONS_00058590 mRNA downstream 895207 11407535 ~ 11414648 (+) True XLOC_029895
TCONS_00058592 mRNA downstream 1299761 11812089 ~ 11836557 (+) True XLOC_029900
TCONS_00058593 mRNA downstream 1328577 11840905 ~ 11864424 (+) True XLOC_029901
TCONS_00058596 mRNA downstream 1431464 11943792 ~ 11960218 (+) False XLOC_029905
TCONS_00058581 other upstream 175195 10336135 ~ 10336763 (+) True XLOC_029887
TCONS_00058580 other upstream 245268 10265648 ~ 10266690 (+) True XLOC_029886
TCONS_00058525 other upstream 3635924 6875920 ~ 6876034 (+) True XLOC_029838
TCONS_00058523 other upstream 3648238 6858139 ~ 6863720 (+) True XLOC_029836
TCONS_00058515 other upstream 3806885 6699120 ~ 6705073 (+) True XLOC_029832
TCONS_00058585 other downstream 206974 10719302 ~ 10721559 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058586 other downstream 207125 10719453 ~ 10721562 (+) False XLOC_029890
TCONS_00058587 other downstream 234966 10747294 ~ 10749804 (+) False XLOC_029891
TCONS_00058588 other downstream 235412 10747740 ~ 10749363 (+) True XLOC_029891
TCONS_00058594 other downstream 1337049 11849377 ~ 11849491 (+) True XLOC_029902

Expression Profile


//