RNA id: TCONS_00069587


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00069587
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.50
exon number 1
gene id XLOC_035461
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 9893672 ~ 9893788 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TACTctagccatatcaccctgcagctcaagactggttactcacagaagctaagcaaggctgagcctggtcagtacctggatgtgagaccacatgggaaaactaggttgctgttggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000177618

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072143 lncRNA upstream 33062 9854738 ~ 9860610 (+) True XLOC_035459
TCONS_00072142 lncRNA upstream 97243 9794868 ~ 9796429 (+) True XLOC_035458
TCONS_00069583 lncRNA upstream 172134 9699127 ~ 9721538 (+) False XLOC_035457
TCONS_00069577 lncRNA upstream 917294 8973437 ~ 8976378 (+) True XLOC_035453
TCONS_00069574 lncRNA upstream 951216 8937723 ~ 8942456 (+) False XLOC_035451
TCONS_00069589 lncRNA downstream 174484 10068272 ~ 10074129 (+) False XLOC_035463
TCONS_00072144 lncRNA downstream 174491 10068279 ~ 10070370 (+) True XLOC_035463
TCONS_00071909 lncRNA downstream 274737 10168525 ~ 10170284 (+) False XLOC_035464
TCONS_00071910 lncRNA downstream 274737 10168525 ~ 10170870 (+) False XLOC_035464
TCONS_00071911 lncRNA downstream 274871 10168659 ~ 10173228 (+) False XLOC_035464
TCONS_00069582 mRNA upstream 101402 9699111 ~ 9792270 (+) False XLOC_035457
TCONS_00069584 mRNA upstream 160461 9715010 ~ 9733211 (+) True XLOC_035457
TCONS_00069581 mRNA upstream 193032 9688966 ~ 9700640 (+) True XLOC_035456
TCONS_00069580 mRNA upstream 198104 9684479 ~ 9695568 (+) False XLOC_035456
TCONS_00069579 mRNA upstream 726557 9149436 ~ 9167115 (+) True XLOC_035455
TCONS_00069588 mRNA downstream 108017 10001805 ~ 10013552 (+) True XLOC_035462
TCONS_00069591 mRNA downstream 411193 10304981 ~ 10308771 (+) False XLOC_035466
TCONS_00069592 mRNA downstream 411612 10305400 ~ 10307125 (+) True XLOC_035466
TCONS_00069593 mRNA downstream 446081 10339869 ~ 10413959 (+) False XLOC_035467
TCONS_00069595 mRNA downstream 456334 10350122 ~ 10449671 (+) False XLOC_035467
TCONS_00069578 other upstream 782482 9111072 ~ 9111190 (+) True XLOC_035454
TCONS_00069563 other upstream 1189242 8699105 ~ 8704430 (+) True XLOC_035446
TCONS_00069553 other upstream 1572076 8321482 ~ 8321596 (+) True XLOC_035442
TCONS_00069525 other upstream 2565348 7320321 ~ 7328324 (+) False XLOC_035428
TCONS_00069522 other upstream 2577466 7315769 ~ 7316206 (+) False XLOC_035429
TCONS_00069600 other downstream 950164 10843952 ~ 10844068 (+) True XLOC_035474
TCONS_00069612 other downstream 1793469 11687257 ~ 11715282 (+) False XLOC_035484
TCONS_00069614 other downstream 1966240 11860028 ~ 11860144 (+) True XLOC_035486
TCONS_00069632 other downstream 3249377 13143165 ~ 13153578 (+) True XLOC_035494
TCONS_00069647 other downstream 3995030 13888818 ~ 13944141 (+) False XLOC_035504