RNA id: TCONS_00073957


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073957
length 273
RNA type mRNA
GC content 0.48
exon number 3
gene id XLOC_037665
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 10778227 ~ 10778615 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGGAAGGAGTTAGCTTTCCATCTCTGAAGAGCGTCTCGCTGTCAATTTTGGCGTATGGGTCATTAGGATTGGGGTCACTGGGAGTTCCCTCCACTCTGGCCCATTTGCCAATGGTGCTTTCCCAACCCACAATGCTGTTCAGCACGCACACACACCGTCAGGTTATATATTGCATATTGATGATGGACTCCCTCACACGAACTCCTGCACCGATCGTTACGCCTGTTCCTATTGACACATTCGGACCtaactgggggaaaaaaaaaatataa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000182577

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074962 lncRNA downstream 407602 10368380 ~ 10370625 (-) True XLOC_037663
TCONS_00073926 lncRNA downstream 1407361 9355372 ~ 9370866 (-) True XLOC_037651
TCONS_00073922 lncRNA downstream 1489157 9286419 ~ 9289070 (-) True XLOC_037649
TCONS_00073923 lncRNA downstream 1489167 9286419 ~ 9289060 (-) False XLOC_037649
TCONS_00073924 lncRNA downstream 1489188 9286419 ~ 9289039 (-) False XLOC_037649
TCONS_00073971 lncRNA upstream 776461 11555076 ~ 11560109 (-) False XLOC_037670
TCONS_00073972 lncRNA upstream 778591 11557206 ~ 11560339 (-) True XLOC_037670
TCONS_00075298 lncRNA upstream 792697 11571312 ~ 11572249 (-) False XLOC_037671
TCONS_00075299 lncRNA upstream 792697 11571312 ~ 11572354 (-) False XLOC_037671
TCONS_00075300 lncRNA upstream 817372 11595987 ~ 11598944 (-) False XLOC_037673
TCONS_00073956 mRNA downstream 9130 10758339 ~ 10769097 (-) True XLOC_037664
TCONS_00073954 mRNA downstream 245636 10152820 ~ 10532591 (-) False XLOC_037662
TCONS_00073953 mRNA downstream 318140 10152820 ~ 10460087 (-) False XLOC_037662
TCONS_00073955 mRNA downstream 420589 10157382 ~ 10357638 (-) True XLOC_037662
TCONS_00073952 mRNA downstream 632347 10138200 ~ 10145880 (-) True XLOC_037661
TCONS_00073959 mRNA upstream 3072 10781687 ~ 10805231 (-) False XLOC_037666
TCONS_00073958 mRNA upstream 3072 10781687 ~ 10805231 (-) False XLOC_037666
TCONS_00073960 mRNA upstream 8664 10787279 ~ 10804796 (-) True XLOC_037666
TCONS_00073962 mRNA upstream 467347 11245962 ~ 11263228 (-) True XLOC_037668
TCONS_00073963 mRNA upstream 769618 11548233 ~ 11550711 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073935 other downstream 972908 9743559 ~ 9805319 (-) False XLOC_037657
TCONS_00073936 other downstream 972908 9770335 ~ 9805319 (-) True XLOC_037657
TCONS_00073901 other downstream 3122926 7641760 ~ 7655301 (-) True XLOC_037633
TCONS_00073897 other downstream 3239204 7522435 ~ 7539023 (-) True XLOC_037632
TCONS_00073875 other downstream 4060426 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618
TCONS_00073961 other upstream 67303 10845918 ~ 10846549 (-) True XLOC_037667
TCONS_00073965 other upstream 770157 11548772 ~ 11550397 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073967 other upstream 772989 11551604 ~ 11551704 (-) True XLOC_037669
TCONS_00073973 other upstream 793358 11571973 ~ 11572055 (-) True XLOC_037671
TCONS_00073978 other upstream 1043764 11822379 ~ 11855305 (-) True XLOC_037675