RNA id: TCONS_00073961


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073961
length 471
RNA type processed_transcript
GC content 0.32
exon number 2
gene id XLOC_037667
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 10845918 ~ 10846549 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CATTCAGACCTGAGTATTGTTTATCCCACgaacattacactcaaaaaaatcaactaggcatgtattggatttacaaaataaaaatttgtcagattgaaaagaacaaatcaagtttacgtatgttaaatgattaattcatgttatttgaaactgaatcaagaaataatcaaatgaatttgatcagaacatgttgattcaatgagactgagacgcttcaaatcgacaactctgaacctggagagtcacttcgggcatatcagtaggtggcggtagtgcgtttggatgtcaccatacgaaaacaacaagaagtgtgttttcggcacagtttgggaattggttttcccaagagcttgaatgttatgcatgttattttgttggctaaatgtttcttatacatgttatattacatattacaattttggatattatataacattttgtatcagaatattaaagaagaaatttgtttaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000137177

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074962 lncRNA downstream 475293 10368380 ~ 10370625 (-) True XLOC_037663
TCONS_00073926 lncRNA downstream 1475052 9355372 ~ 9370866 (-) True XLOC_037651
TCONS_00073922 lncRNA downstream 1556848 9286419 ~ 9289070 (-) True XLOC_037649
TCONS_00073923 lncRNA downstream 1556858 9286419 ~ 9289060 (-) False XLOC_037649
TCONS_00073924 lncRNA downstream 1556879 9286419 ~ 9289039 (-) False XLOC_037649
TCONS_00073971 lncRNA upstream 708527 11555076 ~ 11560109 (-) False XLOC_037670
TCONS_00073972 lncRNA upstream 710657 11557206 ~ 11560339 (-) True XLOC_037670
TCONS_00075298 lncRNA upstream 724763 11571312 ~ 11572249 (-) False XLOC_037671
TCONS_00075299 lncRNA upstream 724763 11571312 ~ 11572354 (-) False XLOC_037671
TCONS_00075300 lncRNA upstream 749438 11595987 ~ 11598944 (-) False XLOC_037673
TCONS_00073959 mRNA downstream 40687 10781687 ~ 10805231 (-) False XLOC_037666
TCONS_00073958 mRNA downstream 40687 10781687 ~ 10805231 (-) False XLOC_037666
TCONS_00073960 mRNA downstream 41122 10787279 ~ 10804796 (-) True XLOC_037666
TCONS_00073957 mRNA downstream 67303 10778227 ~ 10778615 (-) True XLOC_037665
TCONS_00073956 mRNA downstream 76821 10758339 ~ 10769097 (-) True XLOC_037664
TCONS_00073962 mRNA upstream 399413 11245962 ~ 11263228 (-) True XLOC_037668
TCONS_00073963 mRNA upstream 701684 11548233 ~ 11550711 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073964 mRNA upstream 701684 11548233 ~ 11551608 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073966 mRNA upstream 702340 11548889 ~ 11549379 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073968 mRNA upstream 707540 11554089 ~ 11560110 (-) False XLOC_037670
TCONS_00073935 other downstream 1040599 9743559 ~ 9805319 (-) False XLOC_037657
TCONS_00073936 other downstream 1040599 9770335 ~ 9805319 (-) True XLOC_037657
TCONS_00073901 other downstream 3190617 7641760 ~ 7655301 (-) True XLOC_037633
TCONS_00073897 other downstream 3306895 7522435 ~ 7539023 (-) True XLOC_037632
TCONS_00073875 other downstream 4128117 6717677 ~ 6717801 (-) True XLOC_037618
TCONS_00073965 other upstream 702223 11548772 ~ 11550397 (-) False XLOC_037669
TCONS_00073967 other upstream 705055 11551604 ~ 11551704 (-) True XLOC_037669
TCONS_00073973 other upstream 725424 11571973 ~ 11572055 (-) True XLOC_037671
TCONS_00073978 other upstream 975830 11822379 ~ 11855305 (-) True XLOC_037675
TCONS_00073998 other upstream 1735717 12582266 ~ 12594717 (-) False XLOC_037682

Expression Profile

//