XLOC_003831 (cnpy2)


Basic Information

Item Value
gene id XLOC_003831
gene name cnpy2
gene type coding
species zebrafish (Danio rerio)
category of species model fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007122.7
NCBI id CM002895.2
chromosome length 45484837
location 2540139 ~ 2549140 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome

Sequence

>TCONS_00007360
CGGCAGTAAAGCAATACACAGCAGCCAACAGTAGTGAAGAAGAGCAAGAAAAGCTTGTGGCAGATCCCAGATCAGCAGTCAGCCCGGTGTGCACGTCATCAGTTCACCAGCGCGTGTGTGTGCGGCGAATTTAAAGCAAaaggtttgttatattttttcacAAATTGCGTGAACCGAACTCAGTGTTTACATCGACACACCGCATTTAGTGCTCGATGGAGTTTGATAAATATAACCCATTCATTCAGAGTTTTACTTCAGTAGTCTCATGTTGCGGTTGTTCCTCATTATCGTCATATATTATTGTGCATTTTCATAAATATGTGTTTTGTAGGTGGTTATGGAAAAGCAGTATCATATTATTATCTTCTGTGCACTTTTGTCTGTGCACCTATCATTTGTCCAAGGCGCCAGACAGGGTCAAGACGTCAAATGTGGAGCATGCAGGGCGTTAGTTGATGAAATGGAGTGGGAAATATCGCAAATCGATCCCAAGAAAACAATCCAGACTGGATCATTTAGGATCAATCCTGATGGCAGTCAGTCAGTACGAGAGGTCCCATACTCTCGCTCAGAGGGTCATCTACTCGAGTTGATGGAAGAGGTTTGTGAGAAGATGAATGATTACGGTGAACGCGTCGATCCTGTTACTGATCGGAAGACATACGTGAGACACACGTCCCGGGACGGCACGGCAATGGACCTCTCTGATGTGGCGTTTGACTCCAGAGTCAGCTCCAGCTTAAAGTTTGCTTGTGAAACAATCGTGGAGCAGCATGAGGATGAACTTATTGAATTCTTTGCTCATGAGACGGACAATGTAAAAGACAAGCTCTGCAGTAAGAGGACAgATCTCTGTGACCACGCGCTGAACATCCATCATGATGAGCTCTAACACGAGTCTGCAGCTTCACCTATGGAGAATAATGTGTGAGGAAGCTGAGCCTATGTAATGTACTGGACCCCATGGGTTACTGTTGACCTGTTCAGCTGTATCAATGGCTTCTCCATCACAACTGTTCATCGTCATCAATTAAAGCTGACTTTCTACAGCTGAAGCGAGATCTCTTCTCGAGTCTCTCCAATGGCGtacttttgtatttaaaacacatttgagTGCACTTAGTGTTTAGTTTAGAAAACGTCTTGCAGGATATTTATTAAAAGCGCAGAGTTCTTATTAGTTTGTCTTTGTATTTGAATCTGACCAGATTACTAGTCTTAAAGGGCtcgttcacacaaaaatgaaaattctgtcatcatctatTGATGTTTGAGATGGTTTCTTCTGTctaacaaaaaaagaagatattttgaaaaatgataaccattaaaggggacctgttatacaaaagtcacttttataaggggtttcaAAACAGTTGTGCAGCAAAAATATGTGAATGTAACTAGcttttaatggtttattataGAAAtggtctgcagaaacactttgattgacattctccctttgtactaaaggggaaagccccacccactagtgaccatctctccctcattagcttaggataggggtgtccaaactcggttctggaaggccggtgtcctgcagattttatctccaaccccAATAAGACAAACCTGGGCTaggtaatcaagctcttactaggctttctagaaacatccttgcaggcgtgttgaggcaagttggagctgaaatgtgcaggacaccgaccctccaggaccgagtttggacacccctggcataggaagttagtcttgtttttgaatctgccactatgctgacaggcatctgtagctccgccctcttctgaaaagagctcaatctcatttgaatttaaagcgacggTCACCTAAAcgccacaatttggatcaaagcctaaaaggggcagattcgagttgtaaaacattattagtgtggtattttgagctgaaacttttcaCACACACTCTAAACTGTCCTTTAAACCATGCACCAAAACAATTGAGAACGGTATAAACGGAGGTTGGAGCCAACTCCAAGTGGATGGGCCTTCGAGCTctaagtgggctgtacaaacctggagtttttatttatttaatgtcttgtacgTGACATTGAGTCCAATATTGTACTTTATGAATGTCTtccccaacctcacagtaacctgatgtgttttattaatgtttactccacctacaccacctaaacccaacctacttgtgacgaaggtccctcccacttggaggtcccCCAACCTATTTGTggtgtaatccctcccacttggaggtctccgggctgcagcgatacctacttTGAAACAGTTGTCCACCATTGTATTTGTTTGTCCTGCAGCGGATATCAATGgtattcaacattcttcaaaatatcttcttttgtgtttcaaTATAAGAATGAAGCTCTTAAACATTTTGAGCTATTTAAGGGCAAATAAATTATGAGTATTTTTGTATTCATGGGTAAACTATCATCTTTGTCTCTTGtttttccctgctctgttaaatataatttgggaaatatttaaaaaagaaaaacaaactcaaagtggggctaataattctgacttcaactgtatatatacaatttttttttcgtgTTTTCACAAGCAAAAGCAATGGGAATGTCTGCATTTTTAGAGGGTTTTTTCCATCGCAGTTGTGAATTAGTAAAGTCTGATggcatttttatacattaaagcaCTTACTGTCAGATGCCAAACTTGAGTATTAGCAAAGCCACAAAGAACATTTAATAAAGTCTTCTTTCTTGCATACAGTTATTTGCATAcaggtattttatttttacaaaagttATTTGATACGTTAAAGTTCATCCATTTTGCTTGCATTTAGTATGATTTCTGTGACTAAATGACTTTTTACtgctaatgtaaagaaaacatccaaaatgcGTCTTATCAACAATTACAACTAcacatttatatactgtattatatctCAGAATATTGTTTTGTGCTGCAGGTTGGTAATTGATTAATGTGGTCCAAGTTTacatgtttacaaaaaaataaataaatagatttttagacattttaattTCTAGAGAGGACATTTCTGTAGAACTTATTTGATTATTGTGATCTAAGTTTAAATGTTaggaaaaaaaatagatttttagacATTTTGATGCCTGAAGAGGACATTTCTGTAGAATTTACCTGATTAATGTGGTCTGAGTTGAAATGTTagaaaaataaagacattttttttagaCATTTGCTATACCAAAAGATGGCTTTTCTGTTGACGATAATTTATTAACGTACCTAACTCAATGTTTACACAAGAGGACATTTTTGTTGAAGGTAATTCATGAATGTGGTCTTGGTTTACATCGTAAGCGGGTTTAAAAGTTGTAAAAATAAAAGGGTTTTTAGGTTTTTTGCTATACCAAAGGAAAACATTTCTGTTGAAGACAATTGTTGTTTAAGTTTTAAtgtttgcaacaacaacaaaaaaggtaCGGTAATTGATTAAAGTGGTGTAAGTTTCAATCACAGGTTTAAATGATAGAAAAAAATGATAGGCTAGCTTTTTAGACATTTTtctataccaaaaaaaaaagcctttctgTTGAAGATAATTGAATAATGTGGTCTATAagtttaaatgtttacaaaacaaatacatttttagaccTTTTTGCTATAGCAAAATAAGACGTTTCTGTTGAAGATAATTAATTAATGCGATGTTAGTTTATACTATAGACAGGTTTAAATGATAGAAAAATAGAGTTTAAACAAATATCTTTTGTTTTAGTATATCTCTTAGTATATTAAGTGTACTgtcatttatattttagtttatccTACTTATTTTCACTATCATTGATGCTGTTGgcactattattatattattattatttaataacctCCATTTATTTGGTTATTACATGTATTTCTAATGCTCACTGTTATATGCTGATTGTCATATTTTTTGTGTTCacataatttcaaaataaaagaataaagatttaatgaaaag
>TCONS_00007359
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Function

symbol description
cnpy2 Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Orthologous to human CNPY2 (canopy FGF signaling regulator 2).

GO:

id name namespace
GO:0005783 endoplasmic reticulum cellular_component

KEGG: NA

ZFIN:

id description
ZDB-GENE-060315-4 Predicted to be active in endoplasmic reticulum. Orthologous to human CNPY2 (canopy FGF signaling regulator 2).

Ensembl:

ensembl_id ENSDARG00000007207

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TCONS_00007360 False 3990 mRNA 0.37 5 2540139 2549140
TCONS_00007359 True 3798 mRNA 0.37 6 2540139 2549140

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
XLOC_003830 dgkab coding downstream 35389 2480293 ~ 2504750 (-)
XLOC_003829 si:ch73-267c23.10 coding downstream 61765 2471382 ~ 2478374 (-)
XLOC_003828 SERINC3 coding downstream 70610 2464543 ~ 2469529 (-)
XLOC_003827 slc2a10 coding downstream 83353 2448781 ~ 2456786 (-)
XLOC_003826 NA coding downstream 91625 2446641 ~ 2448514 (-)
XLOC_003832 nab2 coding upstream 22346 2571486 ~ 2594045 (-)
XLOC_003833 si:ch211-160o17.2 coding upstream 67676 2616816 ~ 2632747 (-)
XLOC_003834 si:ch211-160o17.6 coding upstream 142103 2691243 ~ 2700397 (-)
XLOC_003835 NA coding upstream 207753 2756893 ~ 2760366 (-)
XLOC_003836 lhfpl5a coding upstream 280672 2829812 ~ 2838699 (-)
XLOC_003938 BX324177.10 misc upstream 8789664 11338804 ~ 11339100 (-)
XLOC_003942 BX324177.17 misc upstream 8818454 11367594 ~ 11367890 (-)
XLOC_003943 BX324177.3 misc upstream 8821315 11370455 ~ 11370653 (-)
XLOC_003944 BX324177.4 misc upstream 8831764 11380904 ~ 11381204 (-)
XLOC_003945 BX324177.6 misc upstream 8834693 11383833 ~ 11384130 (-)
XLOC_003825 NA non-coding downstream 223926 2315496 ~ 2316213 (-)
XLOC_003821 NA non-coding downstream 317699 2211065 ~ 2222440 (-)
XLOC_003817 NA non-coding downstream 619618 1915963 ~ 1920521 (-)
XLOC_003816 NA non-coding downstream 624685 1911551 ~ 1915454 (-)
XLOC_003837 NA non-coding upstream 292958 2842098 ~ 2843883 (-)
XLOC_003838 NA non-coding upstream 427463 2976603 ~ 2982382 (-)
XLOC_003843 NA non-coding upstream 835964 3385104 ~ 3494964 (-)
XLOC_003853 CR450797.1 non-coding upstream 1404583 3953723 ~ 3953837 (-)

Expression


Co-expression Network