RNA id: TCONS_00016606



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00016606
length 121
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_008236
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007126.7
NCBI id CM002899.2
chromosome length 48040578
location 1873658 ~ 1873778 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


CGCATCAACCTATCAGGTCTACTTTGCCAGTTCACATGGTcgcctactgaagctaagcagggctgcgcccggtcagtacttggatgggagaccacatgggaaaactaagtTGTTGCTGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000119803

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00018865 lncRNA upstream 155029 1693197 ~ 1718629 (+) False XLOC_008232
TCONS_00018866 lncRNA upstream 155029 1715361 ~ 1718629 (+) False XLOC_008232
TCONS_00018867 lncRNA upstream 155029 1715754 ~ 1718629 (+) True XLOC_008232
TCONS_00016601 lncRNA upstream 205440 1661092 ~ 1668218 (+) True XLOC_008231
TCONS_00018749 lncRNA upstream 638965 1221817 ~ 1234693 (+) True XLOC_008225
TCONS_00016615 lncRNA downstream 548057 2421835 ~ 2423611 (+) True XLOC_008240
TCONS_00018868 lncRNA downstream 940292 2814070 ~ 2815714 (+) True XLOC_008247
TCONS_00018750 lncRNA downstream 971034 2844812 ~ 2855629 (+) True XLOC_008248
TCONS_00018751 lncRNA downstream 991846 2865624 ~ 2865929 (+) True XLOC_008250
TCONS_00018869 lncRNA downstream 1012922 2886700 ~ 2887498 (+) True XLOC_008249
TCONS_00016605 mRNA upstream 71624 1796313 ~ 1802034 (+) True XLOC_008235
TCONS_00016603 mRNA upstream 78027 1765988 ~ 1795631 (+) False XLOC_008234
TCONS_00016604 mRNA upstream 89693 1766734 ~ 1783965 (+) True XLOC_008234
TCONS_00016602 mRNA upstream 162186 1705167 ~ 1711472 (+) True XLOC_008233
TCONS_00016600 mRNA upstream 201197 1653779 ~ 1672461 (+) False XLOC_008231
TCONS_00016607 mRNA downstream 17911 1891689 ~ 1898233 (+) False XLOC_008237
TCONS_00016608 mRNA downstream 17914 1891692 ~ 1897728 (+) True XLOC_008237
TCONS_00016609 mRNA downstream 316451 2190229 ~ 2415435 (+) False XLOC_008238
TCONS_00016610 mRNA downstream 318122 2191900 ~ 2414403 (+) True XLOC_008238
TCONS_00016612 mRNA downstream 547654 2421432 ~ 2470804 (+) False XLOC_008240
TCONS_00016599 other upstream 305316 1560665 ~ 1568342 (+) True XLOC_008228
TCONS_00016598 other upstream 329715 1543857 ~ 1543943 (+) True XLOC_008230
TCONS_00016597 other upstream 329890 1543686 ~ 1543768 (+) True XLOC_008229
TCONS_00016581 other upstream 794554 1078989 ~ 1079104 (+) True XLOC_008218
TCONS_00016611 other downstream 484733 2358511 ~ 2358625 (+) True XLOC_008239
TCONS_00016622 other downstream 800157 2673935 ~ 2674590 (+) True XLOC_008245
TCONS_00016623 other downstream 811277 2685055 ~ 2685706 (+) True XLOC_008246
TCONS_00016634 other downstream 1632531 3506309 ~ 3506423 (+) True XLOC_008259
TCONS_00016665 other downstream 3981333 5855111 ~ 5855225 (+) True XLOC_008292