RNA id: TCONS_00025309


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00025309
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.56
exon number 1
gene id XLOC_012664
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 13948810 ~ 13948924 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

gccagcagctagctcgctgcaactctcacatggtcaaccactgaagctaagcagggctgggtCCAgccagtatctggatgggagaccacatgggaaagttaCGTTggtgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000181329

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027069 lncRNA upstream 433502 13494245 ~ 13515308 (+) True XLOC_012662
TCONS_00026876 lncRNA upstream 433657 13494240 ~ 13515153 (+) False XLOC_012662
TCONS_00027068 lncRNA upstream 789056 13133657 ~ 13159754 (+) True XLOC_012654
TCONS_00026875 lncRNA upstream 1006790 12941800 ~ 12942020 (+) True XLOC_012652
TCONS_00027067 lncRNA upstream 1294165 12580449 ~ 12654645 (+) True XLOC_012650
TCONS_00027070 lncRNA downstream 285445 14234369 ~ 14239459 (+) True XLOC_012665
TCONS_00025327 lncRNA downstream 696800 14645724 ~ 14647889 (+) False XLOC_012672
TCONS_00025328 lncRNA downstream 698996 14647920 ~ 14649295 (+) False XLOC_012672
TCONS_00025329 lncRNA downstream 703872 14652796 ~ 14655181 (+) True XLOC_012672
TCONS_00025332 lncRNA downstream 744850 14693774 ~ 14697233 (+) True XLOC_012674
TCONS_00025306 mRNA upstream 627748 13315739 ~ 13321062 (+) True XLOC_012661
TCONS_00025305 mRNA upstream 635473 13309862 ~ 13313337 (+) True XLOC_012660
TCONS_00025304 mRNA upstream 641553 13300768 ~ 13307257 (+) True XLOC_012659
TCONS_00025302 mRNA upstream 655168 13248956 ~ 13293642 (+) False XLOC_012658
TCONS_00025303 mRNA upstream 668751 13275735 ~ 13280059 (+) True XLOC_012658
TCONS_00025310 mRNA downstream 328079 14277003 ~ 14329439 (+) False XLOC_012666
TCONS_00025311 mRNA downstream 358135 14307059 ~ 14331863 (+) False XLOC_012666
TCONS_00025312 mRNA downstream 380307 14329231 ~ 14332060 (+) True XLOC_012666
TCONS_00025313 mRNA downstream 393402 14342326 ~ 14400837 (+) False XLOC_012667
TCONS_00025314 mRNA downstream 393402 14342326 ~ 14421236 (+) True XLOC_012667
TCONS_00025284 other upstream 2117790 11830905 ~ 11831020 (+) True XLOC_012642
TCONS_00025282 other upstream 2491480 11457213 ~ 11457330 (+) True XLOC_012639
TCONS_00025273 other upstream 3206647 10742049 ~ 10742163 (+) True XLOC_012635
TCONS_00025271 other upstream 3278072 10670661 ~ 10670738 (+) True XLOC_012633
TCONS_00025267 other upstream 3932184 10016508 ~ 10016626 (+) True XLOC_012628
TCONS_00025324 other downstream 693947 14642871 ~ 14649295 (+) False XLOC_012672
TCONS_00025333 other downstream 1040155 14989079 ~ 14996705 (+) True XLOC_012675
TCONS_00025343 other downstream 1763505 15712429 ~ 15712545 (+) True XLOC_012689
TCONS_00025358 other downstream 2184760 16133684 ~ 16140348 (+) False XLOC_012697
TCONS_00025367 other downstream 2767027 16715951 ~ 16719190 (+) False XLOC_012703