RNA id: TCONS_00025343



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00025343
length 117
RNA type rRNA
GC content 0.46
exon number 1
gene id XLOC_012689
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007129.7
NCBI id CM002902.2
chromosome length 51023478
location 15712429 ~ 15712545 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ATCCACTGCCATATCACCCCACAGGCCAACACTGCTTACtaattgaagctaagcagggctgagccaaTTTAGAACCTGAATGGGAGACCtcatggaaaaactaggttgctgttgaaa

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000174699

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00027077 lncRNA upstream 255682 15453915 ~ 15456747 (+) True XLOC_012684
TCONS_00027076 lncRNA upstream 259777 15449505 ~ 15452652 (+) True XLOC_012683
TCONS_00027075 lncRNA upstream 262984 15446623 ~ 15449445 (+) True XLOC_012682
TCONS_00027071 lncRNA upstream 270957 15433554 ~ 15441472 (+) False XLOC_012681
TCONS_00027074 lncRNA upstream 271569 15440123 ~ 15440860 (+) True XLOC_012680
TCONS_00025359 lncRNA downstream 421163 16133708 ~ 16138355 (+) True XLOC_012697
TCONS_00025361 lncRNA downstream 479573 16192118 ~ 16193797 (+) True XLOC_012698
TCONS_00027078 lncRNA downstream 597576 16310121 ~ 16315811 (+) True XLOC_012700
TCONS_00027079 lncRNA downstream 1086210 16798755 ~ 16862419 (+) False XLOC_012707
TCONS_00027080 lncRNA downstream 1086510 16799055 ~ 16836065 (+) True XLOC_012707
TCONS_00025341 mRNA upstream 19189 15683157 ~ 15693240 (+) True XLOC_012687
TCONS_00025340 mRNA upstream 45487 15644559 ~ 15666942 (+) True XLOC_012686
TCONS_00025339 mRNA upstream 77022 15616167 ~ 15635407 (+) True XLOC_012685
TCONS_00025338 mRNA upstream 422432 15271993 ~ 15289997 (+) True XLOC_012679
TCONS_00025336 mRNA upstream 524375 15175478 ~ 15188054 (+) False XLOC_012678
TCONS_00025344 mRNA downstream 45830 15758375 ~ 15768336 (+) True XLOC_012690
TCONS_00025345 mRNA downstream 65565 15778110 ~ 15793163 (+) True XLOC_012691
TCONS_00025346 mRNA downstream 83021 15795566 ~ 15837342 (+) False XLOC_012692
TCONS_00025347 mRNA downstream 83203 15795748 ~ 15837303 (+) False XLOC_012692
TCONS_00025348 mRNA downstream 83320 15795865 ~ 15837342 (+) True XLOC_012692
TCONS_00025333 other upstream 715724 14989079 ~ 14996705 (+) True XLOC_012675
TCONS_00025324 other upstream 1063134 14642871 ~ 14649295 (+) False XLOC_012672
TCONS_00025309 other upstream 1763505 13948810 ~ 13948924 (+) True XLOC_012664
TCONS_00025284 other upstream 3881409 11830905 ~ 11831020 (+) True XLOC_012642
TCONS_00025282 other upstream 4255099 11457213 ~ 11457330 (+) True XLOC_012639
TCONS_00025358 other downstream 421139 16133684 ~ 16140348 (+) False XLOC_012697
TCONS_00025367 other downstream 1003406 16715951 ~ 16719190 (+) False XLOC_012703
TCONS_00025369 other downstream 1009254 16721799 ~ 16721982 (+) True XLOC_012704
TCONS_00025380 other downstream 1266083 16978628 ~ 16983066 (+) False XLOC_012711
TCONS_00025381 other downstream 1266171 16978716 ~ 16983066 (+) False XLOC_012711

Expression Profile


//