RNA id: TCONS_00030881


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00030881
length 80
lncRNA type antisense
GC content 0.30
exon number 1
gene id XLOC_015437
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007113.7
NCBI id CM002886.2
chromosome length 59640629
location 24261217 ~ 24261296 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CCTACTAACAGAAAAACTTTTTGTTCGTCTtacatttgaaaataaacataacacaaacaaaaagCTTCTCTGTCAGTAGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000154747

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00033539 lncRNA upstream 236769 24022798 ~ 24024448 (+) True XLOC_015434
TCONS_00033538 lncRNA upstream 320887 23936535 ~ 23940330 (+) True XLOC_015432
TCONS_00033537 lncRNA upstream 481788 23772918 ~ 23779429 (+) True XLOC_015428
TCONS_00030862 lncRNA upstream 640994 23613106 ~ 23620223 (+) True XLOC_015424
TCONS_00033536 lncRNA upstream 651941 23576001 ~ 23609276 (+) True XLOC_015422
TCONS_00033540 lncRNA downstream 222977 24484273 ~ 24488154 (+) False XLOC_015443
TCONS_00030890 lncRNA downstream 222979 24484275 ~ 24488154 (+) False XLOC_015443
TCONS_00030894 lncRNA downstream 246474 24507770 ~ 24509698 (+) False XLOC_015444
TCONS_00033541 lncRNA downstream 341996 24603292 ~ 24612068 (+) True XLOC_015446
TCONS_00033542 lncRNA downstream 455018 24716314 ~ 24720787 (+) True XLOC_015449
TCONS_00030877 mRNA upstream 8711 24188502 ~ 24252506 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030876 mRNA upstream 8711 24188502 ~ 24252506 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030875 mRNA upstream 8711 24188502 ~ 24252506 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030873 mRNA upstream 8881 24177006 ~ 24252336 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030874 mRNA upstream 39123 24177190 ~ 24222094 (+) False XLOC_015436
TCONS_00030882 mRNA downstream 43558 24304854 ~ 24308682 (+) True XLOC_015438
TCONS_00030883 mRNA downstream 56169 24317465 ~ 24320183 (+) False XLOC_015439
TCONS_00030884 mRNA downstream 56191 24317487 ~ 24319965 (+) True XLOC_015439
TCONS_00030886 mRNA downstream 91201 24352497 ~ 24355324 (+) True XLOC_015441
TCONS_00030887 mRNA downstream 113009 24374305 ~ 24386382 (+) False XLOC_015442
TCONS_00030870 other upstream 246274 24013250 ~ 24014943 (+) True XLOC_015433
TCONS_00030864 other upstream 581228 23679873 ~ 23679989 (+) True XLOC_015426
TCONS_00030856 other upstream 986436 23274332 ~ 23274781 (+) True XLOC_015415
TCONS_00030855 other upstream 1003320 23257777 ~ 23257897 (+) True XLOC_015416
TCONS_00030841 other upstream 1269696 22986282 ~ 22991521 (+) True XLOC_015408
TCONS_00030885 other downstream 87293 24348589 ~ 24351040 (+) True XLOC_015440
TCONS_00030891 other downstream 222993 24484289 ~ 24497841 (+) True XLOC_015443
TCONS_00030897 other downstream 278751 24540047 ~ 24540765 (+) False XLOC_015445
TCONS_00030898 other downstream 278913 24540209 ~ 24540725 (+) True XLOC_015445
TCONS_00030908 other downstream 581291 24842587 ~ 24845999 (+) True XLOC_015452