RNA id: TCONS_00043209



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043209
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.58
exon number 1
gene id XLOC_021782
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 30979385 ~ 30979499 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


gctggcagctagctctctgcaactttcacattgtcgcccactgaagcgaagcagggctgtgcccagtCAGCACCTGGATGGgacaccacatgggaaaactaggttgctgcctggg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000187148

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00043203 lncRNA upstream 206499 30764287 ~ 30772886 (+) True XLOC_021777
TCONS_00044849 lncRNA upstream 546000 30402314 ~ 30433385 (+) True XLOC_021774
TCONS_00043197 lncRNA upstream 969343 30006206 ~ 30010042 (+) False XLOC_021772
TCONS_00043195 lncRNA upstream 969986 30006206 ~ 30009399 (+) False XLOC_021772
TCONS_00043198 lncRNA upstream 970195 30006236 ~ 30009190 (+) True XLOC_021772
TCONS_00044850 lncRNA downstream 99065 31078564 ~ 31085951 (+) True XLOC_021785
TCONS_00043214 lncRNA downstream 265932 31245431 ~ 31248945 (+) False XLOC_021787
TCONS_00043215 lncRNA downstream 266293 31245792 ~ 31248790 (+) True XLOC_021787
TCONS_00044851 lncRNA downstream 884240 31863739 ~ 31885913 (+) True XLOC_021795
TCONS_00043238 lncRNA downstream 1049126 32028625 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043207 mRNA upstream 60078 30898013 ~ 30919307 (+) True XLOC_021780
TCONS_00043206 mRNA upstream 88535 30859086 ~ 30890850 (+) True XLOC_021779
TCONS_00043204 mRNA upstream 133526 30827959 ~ 30845859 (+) False XLOC_021778
TCONS_00043205 mRNA upstream 133526 30835589 ~ 30845859 (+) True XLOC_021778
TCONS_00043201 mRNA upstream 226832 30730121 ~ 30752553 (+) False XLOC_021776
TCONS_00043210 mRNA downstream 6031 30985530 ~ 30996756 (+) True XLOC_021783
TCONS_00043211 mRNA downstream 20744 31000243 ~ 31022418 (+) True XLOC_021784
TCONS_00043212 mRNA downstream 128186 31107685 ~ 31118371 (+) True XLOC_021786
TCONS_00043213 mRNA downstream 265896 31245395 ~ 31248952 (+) False XLOC_021787
TCONS_00043216 mRNA downstream 425998 31405497 ~ 31423729 (+) True XLOC_021788
TCONS_00043184 other upstream 1390827 29588444 ~ 29588558 (+) True XLOC_021766
TCONS_00043178 other upstream 1616540 29357790 ~ 29362845 (+) False XLOC_021762
TCONS_00043179 other upstream 1616852 29357952 ~ 29362533 (+) False XLOC_021762
TCONS_00043174 other upstream 2053345 28925923 ~ 28926040 (+) True XLOC_021760
TCONS_00043173 other upstream 2075929 28903330 ~ 28903456 (+) True XLOC_021759
TCONS_00043219 other downstream 453774 31433273 ~ 31433348 (+) True XLOC_021790
TCONS_00043220 other downstream 454080 31433579 ~ 31433663 (+) True XLOC_021791
TCONS_00043223 other downstream 687930 31667429 ~ 31667543 (+) True XLOC_021793
TCONS_00043229 other downstream 954176 31933675 ~ 31940874 (+) True XLOC_021797
TCONS_00043240 other downstream 1053266 32032765 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802