RNA id: TCONS_00043223



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00043223
length 115
RNA type rRNA
GC content 0.52
exon number 1
gene id XLOC_021793
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 31667429 ~ 31667543 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


TTTGATCATAAGCTCTCTGCAACtatcacatggttgcccactgaagctaagcagggctgcgcccggtcagtacctggatggaagaccacatgggaaagctagattgctgccGGAA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185203

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00043214 lncRNA upstream 418484 31245431 ~ 31248945 (+) False XLOC_021787
TCONS_00043215 lncRNA upstream 418639 31245792 ~ 31248790 (+) True XLOC_021787
TCONS_00044850 lncRNA upstream 581478 31078564 ~ 31085951 (+) True XLOC_021785
TCONS_00043203 lncRNA upstream 894543 30764287 ~ 30772886 (+) True XLOC_021777
TCONS_00044849 lncRNA upstream 1234044 30402314 ~ 30433385 (+) True XLOC_021774
TCONS_00044851 lncRNA downstream 196196 31863739 ~ 31885913 (+) True XLOC_021795
TCONS_00043238 lncRNA downstream 361082 32028625 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043241 lncRNA downstream 367198 32034741 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043242 lncRNA downstream 369544 32037087 ~ 32038060 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043249 lncRNA downstream 526865 32194408 ~ 32201494 (+) True XLOC_021805
TCONS_00043221 mRNA upstream 61837 31596194 ~ 31605592 (+) False XLOC_021792
TCONS_00043222 mRNA upstream 62122 31596441 ~ 31605307 (+) True XLOC_021792
TCONS_00043217 mRNA upstream 231507 31431956 ~ 31435922 (+) False XLOC_021789
TCONS_00043218 mRNA upstream 231507 31431978 ~ 31435922 (+) True XLOC_021789
TCONS_00043216 mRNA upstream 243700 31405497 ~ 31423729 (+) True XLOC_021788
TCONS_00043224 mRNA downstream 147880 31815423 ~ 31830043 (+) False XLOC_021794
TCONS_00043225 mRNA downstream 147949 31815492 ~ 31829033 (+) True XLOC_021794
TCONS_00043226 mRNA downstream 245339 31912882 ~ 31914996 (+) False XLOC_021796
TCONS_00043227 mRNA downstream 245749 31913292 ~ 31919155 (+) True XLOC_021796
TCONS_00043228 mRNA downstream 266040 31933583 ~ 31940912 (+) False XLOC_021797
TCONS_00043220 other upstream 233766 31433579 ~ 31433663 (+) True XLOC_021791
TCONS_00043219 other upstream 234081 31433273 ~ 31433348 (+) True XLOC_021790
TCONS_00043209 other upstream 687930 30979385 ~ 30979499 (+) True XLOC_021782
TCONS_00043184 other upstream 2078871 29588444 ~ 29588558 (+) True XLOC_021766
TCONS_00043178 other upstream 2304584 29357790 ~ 29362845 (+) False XLOC_021762
TCONS_00043229 other downstream 266132 31933675 ~ 31940874 (+) True XLOC_021797
TCONS_00043240 other downstream 365222 32032765 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043247 other downstream 433668 32101211 ~ 32107481 (+) False XLOC_021804
TCONS_00043259 other downstream 739652 32407195 ~ 32409927 (+) True XLOC_021810
TCONS_00043260 other downstream 744991 32412534 ~ 32421750 (+) True XLOC_021809

Expression Profile


//