RNA id: TCONS_00044851


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00044851
length 22175
lncRNA type inter_gene
GC content 0.36
exon number 1
gene id XLOC_021795
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007134.7
NCBI id CM002907.2
chromosome length 46223584
location 31863739 ~ 31885913 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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TCONS_00043223 other upstream 196196 31667429 ~ 31667543 (+) True XLOC_021793
TCONS_00043220 other upstream 430076 31433579 ~ 31433663 (+) True XLOC_021791
TCONS_00043219 other upstream 430391 31433273 ~ 31433348 (+) True XLOC_021790
TCONS_00043209 other upstream 884240 30979385 ~ 30979499 (+) True XLOC_021782
TCONS_00043184 other upstream 2275181 29588444 ~ 29588558 (+) True XLOC_021766
TCONS_00043229 other downstream 47762 31933675 ~ 31940874 (+) True XLOC_021797
TCONS_00043240 other downstream 146852 32032765 ~ 32038219 (+) False XLOC_021802
TCONS_00043247 other downstream 215298 32101211 ~ 32107481 (+) False XLOC_021804
TCONS_00043259 other downstream 521282 32407195 ~ 32409927 (+) True XLOC_021810
TCONS_00043260 other downstream 526621 32412534 ~ 32421750 (+) True XLOC_021809

Expression Profile

//

Homologous

species RNA id representative length rna type GC content exon number chromosome id location
striped catfish (Pangasianodon hypophthalmus) TU310626 True 361 lncRNA 0.50 1 NC_047611.1 2217486 ~ 2217846 (+)
mexican tetra (Astyanax mexicanus) TU310626 True 6133 lncRNA 0.37 3 NW_019170681.1 27487 ~ 33840 (+)