RNA id: TCONS_00073875


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00073875
length 125
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_037618
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007120.7
NCBI id CM002893.2
chromosome length 56459846
location 6717677 ~ 6717801 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

agagggcgcaatatacagctagctctctgcaactctcacatggttgcccactgaagctaagcaaggctgtgCCTGGTCTGTACCTGGAtagaagaccacatgggaaagccagGTTGCTGCCTCGA

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117131

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00074961 lncRNA downstream 168881 6531549 ~ 6548796 (-) True XLOC_037614
TCONS_00073869 lncRNA downstream 215584 6414784 ~ 6502093 (-) True XLOC_037612
TCONS_00075290 lncRNA downstream 1671688 5044975 ~ 5045989 (-) True XLOC_037603
TCONS_00073852 lncRNA downstream 1673589 5043087 ~ 5044088 (-) False XLOC_037603
TCONS_00075289 lncRNA downstream 1850238 4866100 ~ 4867439 (-) True XLOC_037602
TCONS_00073887 lncRNA upstream 640018 7357819 ~ 7359484 (-) True XLOC_037626
TCONS_00075291 lncRNA upstream 781459 7499260 ~ 7505531 (-) True XLOC_037631
TCONS_00075292 lncRNA upstream 1223968 7941769 ~ 7942597 (-) True XLOC_037636
TCONS_00075293 lncRNA upstream 1442540 8160341 ~ 8163995 (-) True XLOC_037637
TCONS_00075294 lncRNA upstream 1566354 8284155 ~ 8286208 (-) True XLOC_037638
TCONS_00073874 mRNA downstream 56011 6658699 ~ 6661666 (-) True XLOC_037617
TCONS_00073872 mRNA downstream 56012 6658594 ~ 6661665 (-) False XLOC_037617
TCONS_00073873 mRNA downstream 56020 6658699 ~ 6661657 (-) False XLOC_037617
TCONS_00073871 mRNA downstream 93014 6623536 ~ 6624663 (-) True XLOC_037616
TCONS_00073870 mRNA downstream 99610 6607514 ~ 6618067 (-) True XLOC_037615
TCONS_00073876 mRNA upstream 197810 6915611 ~ 6927587 (-) True XLOC_037619
TCONS_00073877 mRNA upstream 245238 6963039 ~ 6991650 (-) True XLOC_037620
TCONS_00073878 mRNA upstream 363776 7081577 ~ 7089303 (-) True XLOC_037621
TCONS_00073880 mRNA upstream 373227 7091028 ~ 7213772 (-) False XLOC_037622
TCONS_00073879 mRNA upstream 373227 7091028 ~ 7213772 (-) False XLOC_037622
TCONS_00073868 other downstream 308406 6409157 ~ 6409271 (-) True XLOC_037613
TCONS_00073841 other downstream 2270573 4443918 ~ 4447104 (-) True XLOC_037598
TCONS_00073830 other downstream 3197966 3508318 ~ 3519711 (-) True XLOC_037592
TCONS_00073827 other downstream 3221098 3490831 ~ 3496579 (-) True XLOC_037591
TCONS_00073809 other downstream 4380374 2330861 ~ 2337303 (-) True XLOC_037575
TCONS_00073897 other upstream 804634 7522435 ~ 7539023 (-) True XLOC_037632
TCONS_00073901 other upstream 923959 7641760 ~ 7655301 (-) True XLOC_037633
TCONS_00073935 other upstream 3025758 9743559 ~ 9805319 (-) False XLOC_037657
TCONS_00073936 other upstream 3052534 9770335 ~ 9805319 (-) True XLOC_037657
TCONS_00073961 other upstream 4128117 10845918 ~ 10846549 (-) True XLOC_037667