G1646476


Basic Information

Item Value
gene id G1646476
gene name NA
gene type non-coding
species rainbow trout (Oncorhynchus mykiss)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_048583.1
NCBI id CM023237.2
chromosome length 67237266
location 62042859 ~ 62056596 (+)
genome version USDA_OmykA_1.1_2020_rainbow_trout_Genome

Sequence

>TU1883793
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>TU1883796
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>TU1883798
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>TU1883800
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>TU1883801
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Function

NR:

description
unnamed protein product

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU1883793 False 1359 lncRNA 0.41 2 62042859 62056596
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TU1883798 False 3843 lncRNA 0.40 4 62042859 62047486
TU1883800 False 1399 lncRNA 0.41 3 62042859 62056596
TU1883801 True 2893 lncRNA 0.42 3 62042859 62045822

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
sav1 sav1 coding upstream 3966 62020594 ~ 62038893 (+)
nin LOC106611458 coding upstream 33558 61924326 ~ 62009301 (+)
pygl LOC106611459 coding upstream 144194 61863637 ~ 61899051 (+)
LOC118941521 NA coding upstream 160526 61881330 ~ 61882333 (+)
trim9 trim9 coding upstream 189978 61746138 ~ 61852881 (+)
map4k5 LOC106611444 coding downstream 38845 62095441 ~ 62210453 (+)
cdkl1 cdkl1 coding downstream 160507 62217103 ~ 62244281 (+)
l2hgdh l2hgdh coding downstream 192131 62248727 ~ 62273364 (+)
sos2 sos2 coding downstream 219515 62276111 ~ 62379517 (+)
cdkn3 cdkn3 coding downstream 362760 62419356 ~ 62422349 (+)
G1646475 NA non-coding upstream 698 62040345 ~ 62042161 (+)
G1646412 NA non-coding upstream 19125 61962651 ~ 62023734 (+)
G1646414 NA non-coding upstream 77372 61964765 ~ 61965487 (+)
G1646394 LOC106603106 non-coding upstream 127362 61914661 ~ 61915497 (+)
G1646485 NA non-coding downstream 20661 62077257 ~ 62077714 (+)
G1646486 NA non-coding downstream 26588 62083184 ~ 62084341 (+)
G1646489 NA non-coding downstream 32566 62089162 ~ 62089482 (+)
G1646491 NA non-coding downstream 33751 62090347 ~ 62090561 (+)
G1646510 NA non-coding downstream 92155 62148751 ~ 62157243 (+)
G1646294 NA other upstream 481775 61558041 ~ 61561084 (+)
G1646225 NA other upstream 697705 61344787 ~ 61345154 (+)
LOC110498404 LOC105025554 other upstream 751018 61242422 ~ 61308910 (+)
G1646089 NA other upstream 839507 61200860 ~ 61203352 (+)
G1645444 NA other upstream 1303902 60718758 ~ 60738957 (+)
G1646509 NA other downstream 87587 62144183 ~ 62145290 (+)
srsf5a LOC106611464 other downstream 430405 62486921 ~ 62493719 (+)
G1647342 NA other downstream 960359 63016955 ~ 63018688 (+)
G1647411 NA other downstream 1018553 63075149 ~ 63077143 (+)
G1647477 NA other downstream 1146160 63202756 ~ 63204057 (+)

Expression


Co-expression Network