G85186


Basic Information

Item Value
gene id G85186
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000013
NCBI id null
chromosome length 12551977
location 10527386 ~ 10534187 (-)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU96953
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>TU96949
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>TU96952
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Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU96953 False 6229 lncRNA 0.38 2 10527386 10534187
TU96949 False 5123 lncRNA 0.39 2 10528630 10534187
TU96952 True 5123 lncRNA 0.39 2 10528630 10534187

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000013_10338616_10372320 SEMA3D coding downstream 152230 10338538 ~ 10375156 (-)
CI01000013_10218387_10244139 SEMA3A, SEMA3AB coding downstream 283247 10218370 ~ 10244139 (-)
CI01000013_10127318_10157548 SEMA3E coding downstream 369838 10127196 ~ 10157548 (-)
CI01000013_10037048_10083444 PCLOB coding downstream 443942 10037048 ~ 10083444 (-)
CI01000013_10014588_10020597 NA coding downstream 506789 10014385 ~ 10020597 (-)
CI01000013_10540473_10556642 NA coding upstream 6228 10540415 ~ 10556688 (-)
CI01000013_10560692_10562065 NA coding upstream 26110 10560297 ~ 10562280 (-)
CI01000013_10564288_10569141 NA coding upstream 29531 10563459 ~ 10569290 (-)
CI01000013_10597504_10610862 IMPDH1B, IMPDH1, IMPDH1A coding upstream 63317 10597504 ~ 10610862 (-)
CI01000013_10799938_10806858 PRPF18 coding upstream 264411 10798598 ~ 10806858 (-)
G85174 NA non-coding downstream 37177 10489814 ~ 10490209 (-)
G85173 NA non-coding downstream 38029 10488834 ~ 10489357 (-)
G85172 NA non-coding downstream 39763 10487359 ~ 10487623 (-)
G85171 NA non-coding downstream 41036 10486127 ~ 10486350 (-)
G85167 NA non-coding downstream 52679 10474494 ~ 10474707 (-)
G85190 NA non-coding upstream 16741 10550928 ~ 10551270 (-)
G85196 NA non-coding upstream 52184 10586371 ~ 10587130 (-)
G85201 NA non-coding upstream 87343 10621530 ~ 10684563 (-)
G85262 NA non-coding upstream 222625 10756812 ~ 10760487 (-)
G85311 NA non-coding upstream 239593 10773780 ~ 10776213 (-)
G85170 NA other downstream 46686 10479861 ~ 10480700 (-)
CI01000013_09309438_09335834 MICAL3A other downstream 1204542 9307036 ~ 9336077 (-)
CI01000013_07339918_07367774 NA other downstream 3145026 7339709 ~ 7367774 (-)
CI01000013_05883498_05884071 CHTF8 other downstream 4643014 5882049 ~ 5884071 (-)
G81547 NA other downstream 4783348 5739526 ~ 5744038 (-)
G85188 NA other upstream 58017 10592204 ~ 10595337 (-)
G85401 NA other upstream 500845 11035032 ~ 11035466 (-)
CI01000013_11596784_11604320 NA other upstream 1064873 11596688 ~ 11604865 (-)

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