RNA id: TCONS_00064135


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00064135
length 116
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_033008
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007117.7
NCBI id CM002890.2
chromosome length 60270059
location 38597669 ~ 38597784 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATCACAGCCATATTACCCTGCAGTCCAAGACTCATTattcactaaagctaagcaggactgagcctggtcagtacctggatgggagaccatatggcaaaactaggttgctgctggaa

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175068

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00065196 lncRNA downstream 239589 38132511 ~ 38358080 (-) False XLOC_033006
TCONS_00064129 lncRNA downstream 847972 37748555 ~ 37749697 (-) True XLOC_033005
TCONS_00065195 lncRNA downstream 1253075 37342328 ~ 37344594 (-) True XLOC_032992
TCONS_00065194 lncRNA downstream 1969572 36621310 ~ 36628097 (-) True XLOC_032987
TCONS_00064099 lncRNA downstream 2044922 36551736 ~ 36552747 (-) True XLOC_032986
TCONS_00065197 lncRNA upstream 161762 38759546 ~ 38763847 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065198 lncRNA upstream 161762 38759546 ~ 38764324 (-) False XLOC_033009
TCONS_00065199 lncRNA upstream 161762 38759546 ~ 38764326 (-) False XLOC_033009
TCONS_00064136 lncRNA upstream 161762 38759546 ~ 38764326 (-) False XLOC_033009
TCONS_00064137 lncRNA upstream 164990 38762774 ~ 38764318 (-) True XLOC_033009
TCONS_00064133 mRNA downstream 178351 38366936 ~ 38419318 (-) False XLOC_033007
TCONS_00064132 mRNA downstream 178807 38366936 ~ 38418862 (-) False XLOC_033007
TCONS_00064128 mRNA downstream 847958 37745719 ~ 37749711 (-) False XLOC_033005
TCONS_00064124 mRNA downstream 852161 37733608 ~ 37745508 (-) False XLOC_033004
TCONS_00064138 mRNA upstream 194116 38791900 ~ 38816500 (-) False XLOC_033010
TCONS_00064139 mRNA upstream 197167 38794951 ~ 38818582 (-) False XLOC_033010
TCONS_00064140 mRNA upstream 197541 38795325 ~ 38816500 (-) True XLOC_033010
TCONS_00064141 mRNA upstream 307263 38905047 ~ 38930726 (-) False XLOC_033011
TCONS_00064143 mRNA upstream 356949 38954733 ~ 39006449 (-) False XLOC_033012
TCONS_00064134 other downstream 170727 38367096 ~ 38426942 (-) True XLOC_033007
TCONS_00064131 other downstream 239589 38355762 ~ 38358080 (-) True XLOC_033006
TCONS_00064130 other downstream 239956 38132511 ~ 38357713 (-) False XLOC_033006
TCONS_00064123 other downstream 982186 37615366 ~ 37615483 (-) True XLOC_033003
TCONS_00064119 other downstream 1098813 37498146 ~ 37498856 (-) True XLOC_033000
TCONS_00064151 other upstream 467041 39064825 ~ 39068492 (-) False XLOC_033015
TCONS_00064162 other upstream 615477 39213261 ~ 39218590 (-) False XLOC_033019
TCONS_00064176 other upstream 927140 39524924 ~ 39525505 (-) True XLOC_033025
TCONS_00064216 other upstream 1495453 40093237 ~ 40162742 (-) False XLOC_033042
TCONS_00064217 other upstream 1576432 40174216 ~ 40182520 (-) True XLOC_033043