RNA id: TCONS_00000744



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000744
length 131
RNA type rRNA
GC content 0.47
exon number 1
gene id XLOC_000432
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 37123642 ~ 37123772 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


catttttaacactgGAAGCACCAGAATtgtataactctctgaaactctcacatggtcacacACTGAAGCTTAGCAGGGCTGTGCCTAGTCAGTACCTGCATGGGAGACCACATcggaaagctaggttgttg

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117485

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002856 lncRNA upstream 157360 36966000 ~ 36966282 (+) True XLOC_000431
TCONS_00002855 lncRNA upstream 465827 36651080 ~ 36657815 (+) False XLOC_000428
TCONS_00000727 lncRNA upstream 1129433 35993297 ~ 35994209 (+) True XLOC_000424
TCONS_00003089 lncRNA upstream 1160580 35956461 ~ 35963062 (+) False XLOC_000423
TCONS_00000757 lncRNA downstream 88464 37212236 ~ 37259712 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000758 lncRNA downstream 160803 37284575 ~ 37292181 (+) True XLOC_000433
TCONS_00000764 lncRNA downstream 281218 37404990 ~ 37417631 (+) True XLOC_000435
TCONS_00002857 lncRNA downstream 467486 37591258 ~ 37638367 (+) True XLOC_000436
TCONS_00003090 lncRNA downstream 709575 37833347 ~ 37834392 (+) True XLOC_000439
TCONS_00000742 mRNA upstream 210551 36772348 ~ 36913091 (+) False XLOC_000430
TCONS_00000743 mRNA upstream 211023 36911471 ~ 36912619 (+) True XLOC_000430
TCONS_00000741 mRNA upstream 293467 36771954 ~ 36830175 (+) False XLOC_000430
TCONS_00000739 mRNA upstream 381274 36722122 ~ 36742368 (+) False XLOC_000429
TCONS_00000737 mRNA upstream 421287 36665602 ~ 36702355 (+) False XLOC_000428
TCONS_00000745 mRNA downstream 71693 37195465 ~ 37305827 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000747 mRNA downstream 71693 37195465 ~ 37310490 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000746 mRNA downstream 71693 37195465 ~ 37310490 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000749 mRNA downstream 72147 37195919 ~ 37291989 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000748 mRNA downstream 72147 37195919 ~ 37291989 (+) False XLOC_000433
TCONS_00000740 other upstream 377073 36728297 ~ 36746569 (+) True XLOC_000429
TCONS_00000735 other upstream 432743 36665543 ~ 36690899 (+) False XLOC_000428
TCONS_00000728 other upstream 969265 36154261 ~ 36154377 (+) True XLOC_000425
TCONS_00000717 other upstream 1320558 35790892 ~ 35803084 (+) True XLOC_000419
TCONS_00000714 other upstream 1608369 35494904 ~ 35515273 (+) False XLOC_000418
TCONS_00000769 other downstream 872687 37996459 ~ 37996577 (+) True XLOC_000440
TCONS_00000777 other downstream 1238576 38362348 ~ 38374799 (+) False XLOC_000445
TCONS_00000779 other downstream 1541982 38665754 ~ 38753029 (+) True XLOC_000446
TCONS_00000785 other downstream 1694540 38818312 ~ 38822163 (+) False XLOC_000448
TCONS_00000786 other downstream 1695805 38819577 ~ 38822163 (+) True XLOC_000448