RNA id: TCONS_00011826



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00011826
length 406
RNA type mRNA
GC content 0.50
exon number 2
gene id XLOC_005988
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007124.7
NCBI id CM002897.2
chromosome length 52186027
location 24851102 ~ 24854662 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


GTCAACTGCTCGTGATAAAGCACTCCTCGCCGGGCTGGGAATCACTCATGTTGTAAACTGTGCCGATGGAGCGCATCGCATCAACACAGGCGCTCAGTTCTACTCAGACATGAGTATCAGTTACTGTGGAGTCGAGGCTGCAGATCACCCACAGTTTGATTTGAGCCAGTATTTCAGCTCCACTGCATCCTTCATTAAAGCCGCTCTCACTCCAAATGGTAAAGTGCTGGTCCACTGTGCAATGGGAGTCAGTCGCTCTGGAGCTTTGGTCCTGGCCTTCCTCATGATGTGTGAAAACCTGACGCTTACAGACGCCATTATCGCTGTCAGACTGAACAGAGATATCTGTCCCAACTCAGGCTTTCTAAAGCAGCTCAGAGCTCTGGACAAACATTTGAGGAGCTGA

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000145865

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00011814 lncRNA upstream 176558 24675824 ~ 24677020 (+) True XLOC_005980
TCONS_00011811 lncRNA upstream 203639 24597665 ~ 24649939 (+) False XLOC_005978
TCONS_00013397 lncRNA upstream 203639 24597711 ~ 24649939 (+) True XLOC_005978
TCONS_00013600 lncRNA upstream 255333 24597665 ~ 24598245 (+) False XLOC_005978
TCONS_00013599 lncRNA upstream 280650 24570620 ~ 24572928 (+) True XLOC_005975
TCONS_00011848 lncRNA downstream 579672 25433845 ~ 25435876 (+) False XLOC_005996
TCONS_00011860 lncRNA downstream 907106 25761279 ~ 25762391 (+) True XLOC_006004
TCONS_00013601 lncRNA downstream 915826 25769999 ~ 25782811 (+) True XLOC_006005
TCONS_00013602 lncRNA downstream 1090106 25944279 ~ 25952841 (+) False XLOC_006007
TCONS_00013603 lncRNA downstream 1090106 25944279 ~ 25961369 (+) False XLOC_006007
TCONS_00011824 mRNA upstream 2766 24842857 ~ 24850812 (+) True XLOC_005987
TCONS_00011823 mRNA upstream 15601 24834199 ~ 24837977 (+) True XLOC_005986
TCONS_00011822 mRNA upstream 22861 24829996 ~ 24830717 (+) True XLOC_005985
TCONS_00011819 mRNA upstream 73886 24755049 ~ 24779692 (+) False XLOC_005983
TCONS_00011827 mRNA downstream 345676 25199849 ~ 25204766 (+) False XLOC_005989
TCONS_00011828 mRNA downstream 345676 25199849 ~ 25209080 (+) False XLOC_005989
TCONS_00011829 mRNA downstream 345932 25200105 ~ 25209083 (+) True XLOC_005989
TCONS_00011830 mRNA downstream 432365 25286538 ~ 25379820 (+) False XLOC_005990
TCONS_00011831 mRNA downstream 510151 25364324 ~ 25379820 (+) False XLOC_005990
TCONS_00011821 other upstream 24709 24828753 ~ 24828869 (+) True XLOC_005984
TCONS_00011801 other upstream 563340 24287723 ~ 24290238 (+) True XLOC_005969
TCONS_00011791 other upstream 1032278 23821186 ~ 23821300 (+) True XLOC_005962
TCONS_00011768 other upstream 1981161 22863545 ~ 22872417 (+) False XLOC_005952
TCONS_00011749 other upstream 2271098 22571943 ~ 22582480 (+) True XLOC_005944
TCONS_00011850 other downstream 589811 25443984 ~ 25444370 (+) False XLOC_005997
TCONS_00011851 other downstream 590111 25444284 ~ 25444523 (+) True XLOC_005997
TCONS_00011863 other downstream 1849724 26703897 ~ 26709399 (+) False XLOC_006010
TCONS_00011865 other downstream 1850100 26704273 ~ 26772366 (+) True XLOC_006010
TCONS_00011871 other downstream 2378624 27232797 ~ 27237577 (+) False XLOC_006015

Expression Profile


//