RNA id: TCONS_00051713


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00051713
length 350
RNA type mRNA
GC content 0.43
exon number 2
gene id XLOC_026536
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007114.7
NCBI id CM002887.2
chromosome length 62628489
location 34038753 ~ 34039242 (-)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATGTTCTTGCTAAAGATCTTTCTGCAGTTGGCAGCTGCACACAGTGTTTATTCTCAGATTGTGCTCACACAGTCTGATCAGTCAGTAAGTGTGTCTCCGAGGGGATCTGTTAAGCTGACCTGTGCATGCAGTGGATTCACTCTCAGTAGCTTCAGGATGTTCTGGATCCATCAGACACCAGGAAAAGGACTGGAATTGATTTTGAACTATTTATCAGATTCTGACAAAAGTTCAGCTCAGTCAGTGCAGGGCAGATTTACTGCATCTAAAGACAGCTCTAATTTTTATCTCCACATGAATCAACTGAAGACTGAGGACACTGGGGTGTATTACTGTGCAACATACACCAG

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000151671

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00051677 lncRNA downstream 99932 33936453 ~ 33938821 (-) True XLOC_026512
TCONS_00051675 lncRNA downstream 103315 33922620 ~ 33935438 (-) False XLOC_026512
TCONS_00053065 lncRNA downstream 119558 33918566 ~ 33919195 (-) True XLOC_026511
TCONS_00051667 lncRNA downstream 347999 33681518 ~ 33690754 (-) True XLOC_026509
TCONS_00051659 lncRNA downstream 601021 33435754 ~ 33437732 (-) True XLOC_026506
TCONS_00053066 lncRNA upstream 100395 34139637 ~ 34141181 (-) True XLOC_026572
TCONS_00051762 lncRNA upstream 140565 34179807 ~ 34180432 (-) False XLOC_026573
TCONS_00051763 lncRNA upstream 140565 34179807 ~ 34180451 (-) True XLOC_026573
TCONS_00051771 lncRNA upstream 430912 34470154 ~ 34477363 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051773 lncRNA upstream 486700 34525942 ~ 34546406 (-) False XLOC_026575
TCONS_00051711 mRNA downstream 1689 34036627 ~ 34037064 (-) False XLOC_026535
TCONS_00051707 mRNA downstream 4255 34034048 ~ 34034498 (-) True XLOC_026533
TCONS_00051706 mRNA downstream 6734 34031577 ~ 34032019 (-) True XLOC_026532
TCONS_00051705 mRNA downstream 7818 34030460 ~ 34030935 (-) True XLOC_026531
TCONS_00051704 mRNA downstream 9859 34028457 ~ 34028894 (-) True XLOC_026530
TCONS_00051714 mRNA upstream 388 34039630 ~ 34040063 (-) True XLOC_026537
TCONS_00051717 mRNA upstream 11680 34050922 ~ 34056168 (-) False XLOC_026540
TCONS_00051718 mRNA upstream 11688 34050930 ~ 34051363 (-) True XLOC_026540
TCONS_00051719 mRNA upstream 13153 34052395 ~ 34052882 (-) True XLOC_026541
TCONS_00051720 mRNA upstream 14381 34053623 ~ 34054081 (-) True XLOC_026542
TCONS_00051712 other downstream 872 34037481 ~ 34037881 (-) True XLOC_026535
TCONS_00051708 other downstream 3122 34035192 ~ 34035631 (-) True XLOC_026534
TCONS_00051702 other downstream 15140 34023165 ~ 34023613 (-) True XLOC_026529
TCONS_00051678 other downstream 89965 33948669 ~ 33948788 (-) True XLOC_026513
TCONS_00051656 other downstream 614425 33424192 ~ 33424328 (-) True XLOC_026505
TCONS_00051715 other upstream 7937 34047179 ~ 34047616 (-) True XLOC_026538
TCONS_00051716 other upstream 8963 34048205 ~ 34048653 (-) True XLOC_026539
TCONS_00051722 other upstream 19437 34058679 ~ 34058717 (-) True XLOC_026544
TCONS_00051725 other upstream 24713 34063955 ~ 34064936 (-) True XLOC_026547
TCONS_00051740 other upstream 46799 34086041 ~ 34086483 (-) True XLOC_026558