RNA id: TCONS_00066060


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00066060
length 118
RNA type rRNA
GC content 0.54
exon number 1
gene id XLOC_033768
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007118.7
NCBI id CM002891.2
chromosome length 74282399
location 27912938 ~ 27913055 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

TTTGTCAGCGCCTAGCTCTTTGCAACTCTTACGCgttcacccactgaagctaagcaggactgcgCCCGATCAGTACTTAGATGGGAAACCACCTGGAAAAGCTAGGTGGCTGCCggag

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000117365

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00068858 lncRNA upstream 80615 27822444 ~ 27832323 (+) False XLOC_033764
TCONS_00068859 lncRNA upstream 80615 27823531 ~ 27832323 (+) False XLOC_033764
TCONS_00068860 lncRNA upstream 80615 27825631 ~ 27832323 (+) False XLOC_033764
TCONS_00068861 lncRNA upstream 80615 27828012 ~ 27832323 (+) True XLOC_033764
TCONS_00066053 lncRNA upstream 113903 27797821 ~ 27799035 (+) True XLOC_033762
TCONS_00068575 lncRNA downstream 145147 28058202 ~ 28089017 (+) False XLOC_033767
TCONS_00066064 lncRNA downstream 145147 28058202 ~ 28189681 (+) True XLOC_033767
TCONS_00068576 lncRNA downstream 1149120 29062175 ~ 29064397 (+) True XLOC_033780
TCONS_00066088 lncRNA downstream 1172507 29085562 ~ 29090937 (+) True XLOC_033782
TCONS_00066099 lncRNA downstream 1269021 29182076 ~ 29182727 (+) True XLOC_033789
TCONS_00066056 mRNA upstream 25055 27834130 ~ 27887883 (+) False XLOC_033766
TCONS_00066054 mRNA upstream 91962 27802480 ~ 27820976 (+) True XLOC_033763
TCONS_00066052 mRNA upstream 215704 27691647 ~ 27697234 (+) True XLOC_033761
TCONS_00066051 mRNA upstream 217265 27603211 ~ 27695673 (+) False XLOC_033761
TCONS_00066049 mRNA upstream 217325 27455321 ~ 27695613 (+) False XLOC_033761
TCONS_00066061 mRNA downstream 63393 27976448 ~ 28058520 (+) False XLOC_033767
TCONS_00066062 mRNA downstream 64010 27977065 ~ 28047220 (+) False XLOC_033767
TCONS_00066063 mRNA downstream 93041 28006096 ~ 28027498 (+) False XLOC_033767
TCONS_00066068 mRNA downstream 699616 28612671 ~ 28623292 (+) False XLOC_033771
TCONS_00066069 mRNA downstream 701978 28615033 ~ 28623271 (+) True XLOC_033771
TCONS_00066057 other upstream 33345 27848010 ~ 27879593 (+) True XLOC_033766
TCONS_00066055 other upstream 86877 27825945 ~ 27826061 (+) True XLOC_033765
TCONS_00066050 other upstream 252210 27455340 ~ 27660728 (+) False XLOC_033761
TCONS_00066036 other upstream 776292 27059394 ~ 27136646 (+) False XLOC_033759
TCONS_00066032 other upstream 868935 27041364 ~ 27044003 (+) False XLOC_033756
TCONS_00066065 other downstream 340589 28253644 ~ 28255177 (+) False XLOC_033769
TCONS_00066066 other downstream 342041 28255096 ~ 28258626 (+) True XLOC_033769
TCONS_00066067 other downstream 548408 28461463 ~ 28461578 (+) True XLOC_033770
TCONS_00066070 other downstream 811855 28724910 ~ 28733520 (+) False XLOC_033772
TCONS_00066080 other downstream 1101084 29014139 ~ 29015168 (+) True XLOC_033776