RNA id: TCONS_00069720


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00069720
length 570
RNA type mRNA
GC content 0.41
exon number 4
gene id XLOC_035552
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 17987215 ~ 17990577 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

CTTTACCATGGTATATTCACTGTTTATTTGGTAAACTGCACTCAATCCCTGTTACTGGATCATGGCTACTGGATTTCAGAAGGTGACAAAGACCTAACAGACATTGTGATGGTCAGACTGAACAGCTTGCTTGTAAAGAGTCTCGATCAGATTGGATCTTGCAAAACACTGCGGATTTGCATCTTGGCTGACAACTTTTTAACCAGGATTGAACCTCTAATGGAATGCACTAGCTTGGTGAAGATAGATTTGAAAGGCAATCAGATTGTCCAGCTCCCTGACGCTTCAGGTTGGAGTCATCTGAAAGAACTACAACTTCTGTATCTACATGACAACAACATGTCAACCTGGGACAATATTAAAGGCCTGTCGGGTTGTTTAAAGCTGACTGCTTTAACTCTGTATGACACCCCAGTCAGTTTAAAGGGGAACTACAGGCACCGTCTGGTCAACAACATATGGTCTCTGAAGGCTTTGGACAACTTTGTTATCTCTGATGaggaaataattgaaaatatgTGCCTTCCCTTTCGtggtttcaagcctttatgtttttttttcttttgttga

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000113605

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072175 lncRNA upstream 18981 17962829 ~ 17968234 (+) True XLOC_035551
TCONS_00072174 lncRNA upstream 580135 17368041 ~ 17407080 (+) True XLOC_035546
TCONS_00072173 lncRNA upstream 860876 17087009 ~ 17126339 (+) False XLOC_035542
TCONS_00072172 lncRNA upstream 889762 17086991 ~ 17097453 (+) False XLOC_035542
TCONS_00072171 lncRNA upstream 927838 17055879 ~ 17059377 (+) True XLOC_035539
TCONS_00071922 lncRNA downstream 420407 18410984 ~ 18412028 (+) True XLOC_035556
TCONS_00071923 lncRNA downstream 719397 18709974 ~ 18733594 (+) True XLOC_035563
TCONS_00072176 lncRNA downstream 1237258 19227835 ~ 19232675 (+) True XLOC_035566
TCONS_00069750 lncRNA downstream 1523780 19514357 ~ 19516262 (+) False XLOC_035570
TCONS_00069751 lncRNA downstream 1526026 19516603 ~ 19520119 (+) True XLOC_035570
TCONS_00069719 mRNA upstream 40010 17933475 ~ 17947205 (+) True XLOC_035550
TCONS_00069717 mRNA upstream 69547 17869225 ~ 17917668 (+) False XLOC_035549
TCONS_00069718 mRNA upstream 70260 17884569 ~ 17916955 (+) True XLOC_035549
TCONS_00069715 mRNA upstream 70287 17838924 ~ 17916928 (+) False XLOC_035549
TCONS_00069716 mRNA upstream 75579 17868506 ~ 17911636 (+) False XLOC_035549
TCONS_00069723 mRNA downstream 19991 18010568 ~ 18036613 (+) False XLOC_035554
TCONS_00069724 mRNA downstream 20401 18010978 ~ 18036639 (+) False XLOC_035554
TCONS_00069725 mRNA downstream 20405 18010982 ~ 18031596 (+) False XLOC_035554
TCONS_00069726 mRNA downstream 20945 18011522 ~ 18014029 (+) True XLOC_035554
TCONS_00069727 mRNA downstream 53680 18044257 ~ 18165677 (+) False XLOC_035555
TCONS_00069707 other upstream 890150 17087060 ~ 17097065 (+) True XLOC_035542
TCONS_00069704 other upstream 913844 17069577 ~ 17073371 (+) False XLOC_035540
TCONS_00069701 other upstream 1176962 16772174 ~ 16810253 (+) True XLOC_035537
TCONS_00069690 other upstream 1298753 16676937 ~ 16688462 (+) False XLOC_035532
TCONS_00069685 other upstream 1907422 16023470 ~ 16079793 (+) False XLOC_035526
TCONS_00069740 other downstream 679660 18670237 ~ 18670362 (+) True XLOC_035562
TCONS_00069742 other downstream 1032684 19023261 ~ 19023377 (+) True XLOC_035565
TCONS_00069748 other downstream 1513450 19504027 ~ 19509241 (+) True XLOC_035569
TCONS_00069759 other downstream 1961156 19951733 ~ 19952380 (+) False XLOC_035578
TCONS_00069760 other downstream 1961200 19951777 ~ 19952379 (+) True XLOC_035578

Expression Profile

//