RNA id: TCONS_00069740



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00069740
length 126
RNA type rRNA
GC content 0.57
exon number 1
gene id XLOC_035562
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 18670237 ~ 18670362 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


ggccacagccatatcaccctgcagcccaagaccagttgcTCGCTAAAGCTAGGCAGGAGCCACAGAACTGAGCCCGgtgagtacctggatgggagaccacatgggaaaactaggttgctgttggag

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000115876

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00071922 lncRNA upstream 258209 18410984 ~ 18412028 (+) True XLOC_035556
TCONS_00072175 lncRNA upstream 702003 17962829 ~ 17968234 (+) True XLOC_035551
TCONS_00072174 lncRNA upstream 1263157 17368041 ~ 17407080 (+) True XLOC_035546
TCONS_00072173 lncRNA upstream 1543898 17087009 ~ 17126339 (+) False XLOC_035542
TCONS_00072172 lncRNA upstream 1572784 17086991 ~ 17097453 (+) False XLOC_035542
TCONS_00071923 lncRNA downstream 39612 18709974 ~ 18733594 (+) True XLOC_035563
TCONS_00072176 lncRNA downstream 557473 19227835 ~ 19232675 (+) True XLOC_035566
TCONS_00069750 lncRNA downstream 843995 19514357 ~ 19516262 (+) False XLOC_035570
TCONS_00069751 lncRNA downstream 846241 19516603 ~ 19520119 (+) True XLOC_035570
TCONS_00072177 lncRNA downstream 993092 19663454 ~ 19715690 (+) False XLOC_035573
TCONS_00069739 mRNA upstream 22874 18624658 ~ 18647363 (+) True XLOC_035561
TCONS_00069738 mRNA upstream 47133 18615938 ~ 18623104 (+) True XLOC_035560
TCONS_00069736 mRNA upstream 68996 18588551 ~ 18601241 (+) False XLOC_035559
TCONS_00069737 mRNA upstream 76703 18588590 ~ 18593534 (+) True XLOC_035559
TCONS_00069733 mRNA upstream 107258 18545539 ~ 18562979 (+) False XLOC_035558
TCONS_00069741 mRNA downstream 160397 18830759 ~ 18840694 (+) True XLOC_035564
TCONS_00069743 mRNA downstream 685710 19356072 ~ 19359834 (+) True XLOC_035567
TCONS_00069744 mRNA downstream 819492 19489854 ~ 19500354 (+) False XLOC_035568
TCONS_00069745 mRNA downstream 819566 19489928 ~ 19500063 (+) True XLOC_035568
TCONS_00069746 mRNA downstream 833649 19504011 ~ 19512268 (+) False XLOC_035569
TCONS_00069707 other upstream 1573172 17087060 ~ 17097065 (+) True XLOC_035542
TCONS_00069704 other upstream 1596866 17069577 ~ 17073371 (+) False XLOC_035540
TCONS_00069701 other upstream 1859984 16772174 ~ 16810253 (+) True XLOC_035537
TCONS_00069690 other upstream 1981775 16676937 ~ 16688462 (+) False XLOC_035532
TCONS_00069685 other upstream 2590444 16023470 ~ 16079793 (+) False XLOC_035526
TCONS_00069742 other downstream 352899 19023261 ~ 19023377 (+) True XLOC_035565
TCONS_00069748 other downstream 833665 19504027 ~ 19509241 (+) True XLOC_035569
TCONS_00069759 other downstream 1281371 19951733 ~ 19952380 (+) False XLOC_035578
TCONS_00069760 other downstream 1281415 19951777 ~ 19952379 (+) True XLOC_035578
TCONS_00069761 other downstream 1288123 19958485 ~ 19959118 (+) False XLOC_035579