RNA id: TCONS_00000340



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00000340
length 95
RNA type miRNA
GC content 0.62
exon number 1
gene id XLOC_000198
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 14730296 ~ 14730390 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


caggttctctggcttgacgtcccggtgcaggactccgcggctctcgcagtgtttcagagccgcgatcagctgcaccagcactttcttggccagac

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000175698

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00002819 lncRNA upstream 120416 14607834 ~ 14609880 (+) True XLOC_000190
TCONS_00003046 lncRNA upstream 647197 13997130 ~ 14083099 (+) True XLOC_000177
TCONS_00002818 lncRNA upstream 1247787 13481635 ~ 13482509 (+) False XLOC_000175
TCONS_00002817 lncRNA upstream 1247787 13481635 ~ 13482509 (+) True XLOC_000175
TCONS_00003045 lncRNA upstream 1248062 13479133 ~ 13482234 (+) False XLOC_000175
TCONS_00003047 lncRNA downstream 39111 14769501 ~ 14770654 (+) False XLOC_000202
TCONS_00003048 lncRNA downstream 39217 14769607 ~ 14770654 (+) True XLOC_000202
TCONS_00003049 lncRNA downstream 121232 14851622 ~ 15021422 (+) True XLOC_000203
TCONS_00002820 lncRNA downstream 343010 15073400 ~ 15073664 (+) True XLOC_000204
TCONS_00003050 lncRNA downstream 691836 15422226 ~ 15436325 (+) True XLOC_000209
TCONS_00000333 mRNA upstream 70016 14658801 ~ 14660280 (+) True XLOC_000191
TCONS_00000332 mRNA upstream 242222 14466860 ~ 14488074 (+) True XLOC_000189
TCONS_00000331 mRNA upstream 266276 14454663 ~ 14464020 (+) True XLOC_000188
TCONS_00000330 mRNA upstream 287394 14432434 ~ 14442902 (+) True XLOC_000187
TCONS_00000329 mRNA upstream 313861 14406098 ~ 14416435 (+) True XLOC_000186
TCONS_00000344 mRNA downstream 407511 15137901 ~ 15203357 (+) True XLOC_000205
TCONS_00000345 mRNA downstream 474243 15204633 ~ 15224338 (+) False XLOC_000206
TCONS_00000346 mRNA downstream 486269 15216659 ~ 15223551 (+) False XLOC_000206
TCONS_00000347 mRNA downstream 486598 15216988 ~ 15223551 (+) True XLOC_000206
TCONS_00000348 mRNA downstream 495878 15226268 ~ 15257315 (+) True XLOC_000207
TCONS_00000339 other upstream 7046 14723156 ~ 14723250 (+) True XLOC_000197
TCONS_00000338 other upstream 14186 14716016 ~ 14716110 (+) True XLOC_000196
TCONS_00000337 other upstream 21326 14708876 ~ 14708970 (+) True XLOC_000195
TCONS_00000336 other upstream 28466 14701736 ~ 14701830 (+) True XLOC_000194
TCONS_00000335 other upstream 35641 14694561 ~ 14694655 (+) True XLOC_000193
TCONS_00000341 other downstream 7080 14737470 ~ 14737564 (+) True XLOC_000199
TCONS_00000342 other downstream 14255 14744645 ~ 14744739 (+) True XLOC_000200
TCONS_00000343 other downstream 37186 14767576 ~ 14767670 (+) True XLOC_000201
TCONS_00000353 other downstream 1431714 16162104 ~ 16162220 (+) True XLOC_000211
TCONS_00000357 other downstream 1728135 16458525 ~ 16458741 (+) True XLOC_000213