RNA id: TCONS_00000357


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00000357
length 217
RNA type snoRNA
GC content 0.39
exon number 1
gene id XLOC_000213
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007112.7
NCBI id CM002885.2
chromosome length 59578282
location 16458525 ~ 16458741 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

AAGACTATACTTTCAGGGATCATTTCTATAGTTCTTAACTAGGAAATGTGTTTCGAAAGTGACGAGTCCCCCAAACCACGATGATGAGTTTTGATACTCTTTTCTGAGCGTGAATCAGATGCAGAGAAATGATTCAGTTCATATGCTCTGTATCATTGAAGAACGTTCCTTGTTGTGTTCCACAACATAGGAGGAAAAGAGTATGAGCAGAGTGGTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000185436

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00003050 lncRNA upstream 1022200 15422226 ~ 15436325 (+) True XLOC_000209
TCONS_00002820 lncRNA upstream 1384861 15073400 ~ 15073664 (+) True XLOC_000204
TCONS_00003049 lncRNA upstream 1437103 14851622 ~ 15021422 (+) True XLOC_000203
TCONS_00003047 lncRNA upstream 1687871 14769501 ~ 14770654 (+) False XLOC_000202
TCONS_00003051 lncRNA downstream 115225 16573966 ~ 16574929 (+) False XLOC_000215
TCONS_00003052 lncRNA downstream 213348 16672089 ~ 16674126 (+) True XLOC_000217
TCONS_00000380 lncRNA downstream 1450318 17909059 ~ 17911739 (+) True XLOC_000226
TCONS_00002822 lncRNA downstream 1507373 17966114 ~ 17968446 (+) False XLOC_000227
TCONS_00002821 lncRNA downstream 1507373 17966114 ~ 17968446 (+) False XLOC_000227
TCONS_00000355 mRNA upstream 268 16396870 ~ 16458257 (+) False XLOC_000212
TCONS_00000356 mRNA upstream 2024 16397063 ~ 16456501 (+) True XLOC_000212
TCONS_00000354 mRNA upstream 2604 16396870 ~ 16455921 (+) False XLOC_000212
TCONS_00000352 mRNA upstream 238290 16144615 ~ 16220235 (+) True XLOC_000210
TCONS_00000350 mRNA upstream 238291 16073887 ~ 16220234 (+) False XLOC_000210
TCONS_00000358 mRNA downstream 4338 16463079 ~ 16480213 (+) False XLOC_000214
TCONS_00000359 mRNA downstream 8030 16466771 ~ 16470347 (+) True XLOC_000214
TCONS_00000360 mRNA downstream 89992 16548733 ~ 16617741 (+) False XLOC_000215
TCONS_00000361 mRNA downstream 115241 16573982 ~ 16612144 (+) False XLOC_000215
TCONS_00000362 mRNA downstream 115571 16574312 ~ 16619858 (+) False XLOC_000215
TCONS_00000353 other upstream 296305 16162104 ~ 16162220 (+) True XLOC_000211
TCONS_00000343 other upstream 1690855 14767576 ~ 14767670 (+) True XLOC_000201
TCONS_00000342 other upstream 1713786 14744645 ~ 14744739 (+) True XLOC_000200
TCONS_00000341 other upstream 1720961 14737470 ~ 14737564 (+) True XLOC_000199
TCONS_00000340 other upstream 1728135 14730296 ~ 14730390 (+) True XLOC_000198
TCONS_00000364 other downstream 141957 16600698 ~ 16614589 (+) True XLOC_000215
TCONS_00000367 other downstream 309942 16768683 ~ 16768809 (+) True XLOC_000218
TCONS_00000369 other downstream 1054774 17513515 ~ 17522176 (+) True XLOC_000219
TCONS_00000377 other downstream 1399639 17858380 ~ 17861928 (+) True XLOC_000224
TCONS_00000400 other downstream 3076379 19535120 ~ 19539639 (+) False XLOC_000244

Expression Profile

//