RNA id: TCONS_00070406



Basic Information


Item Value
RNA id TCONS_00070406
length 354
RNA type mRNA
GC content 0.44
exon number 7
gene id XLOC_035926
representative True

Chromosome Information


Item Value
chromosome id NC_007119.7
NCBI id CM002892.2
chromosome length 54304671
location 44358443 ~ 44382240 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence


AATCTCAAGAACACTCTGATCTGTCATGTGACTGGATTCTTCCCTCCACCGGTCAGAGTCTTGTGGACCAAGAACAATGTGAATGTGACAGATGGGTCAACTATCAGCAGATATTACCCTGACAATGATAGAAATTTTAATGTCTTTTCTCAACTGAGCTTCATTCCTGAGGAAGGAGATGTTTACAGCTGTTCAGTGGAGCACAAAGCCCTTCAACAACCTCAGACCAGAACATGGGCCCCAACAGTGCCACAAACTGATCGCCACAAAATCATACAAAATGGAGTTAGTCTTGCTCTTGGGCTTTTTGGTTTTGCAACTGGAGTCCTTTTCATTGCCAAAAAACAGACAGGT

Function


GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000189212

JBrowse2


Neighbor


RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00072260 lncRNA upstream 50407 44275846 ~ 44308036 (+) True XLOC_035925
TCONS_00072259 lncRNA upstream 987161 43366458 ~ 43371282 (+) True XLOC_035923
TCONS_00071964 lncRNA upstream 1204006 43149742 ~ 43154437 (+) False XLOC_035921
TCONS_00070411 lncRNA downstream 96083 44478323 ~ 44479644 (+) True XLOC_035929
TCONS_00070418 lncRNA downstream 321614 44703854 ~ 44707487 (+) False XLOC_035934
TCONS_00072261 lncRNA downstream 362593 44744833 ~ 44746973 (+) True XLOC_035936
TCONS_00072262 lncRNA downstream 495735 44877975 ~ 44880401 (+) False XLOC_035938
TCONS_00072263 lncRNA downstream 495740 44877980 ~ 44880401 (+) False XLOC_035938
TCONS_00070404 mRNA upstream 504597 43852743 ~ 43853846 (+) True XLOC_035924
TCONS_00070403 mRNA upstream 994853 43340995 ~ 43363590 (+) True XLOC_035922
TCONS_00070402 mRNA upstream 1274750 43078044 ~ 43083693 (+) True XLOC_035920
TCONS_00070400 mRNA upstream 1301468 43053519 ~ 43056975 (+) False XLOC_035919
TCONS_00070407 mRNA downstream 37868 44420108 ~ 44421418 (+) True XLOC_035927
TCONS_00070408 mRNA downstream 59980 44442220 ~ 44448423 (+) True XLOC_035928
TCONS_00070409 mRNA downstream 93553 44475793 ~ 44480006 (+) False XLOC_035929
TCONS_00070410 mRNA downstream 96054 44478294 ~ 44480456 (+) False XLOC_035929
TCONS_00070412 mRNA downstream 167050 44549290 ~ 44561585 (+) True XLOC_035930
TCONS_00070398 other upstream 1319983 43011613 ~ 43038460 (+) False XLOC_035918
TCONS_00070392 other upstream 1450619 42764234 ~ 42907824 (+) False XLOC_035916
TCONS_00070387 other upstream 1634619 42717004 ~ 42723824 (+) False XLOC_035915
TCONS_00070385 other upstream 1722430 42631632 ~ 42636013 (+) True XLOC_035914
TCONS_00070381 other upstream 2370330 41987350 ~ 41988113 (+) True XLOC_035912
TCONS_00070415 other downstream 277573 44659813 ~ 44659927 (+) True XLOC_035933
TCONS_00070426 other downstream 577047 44959287 ~ 44968031 (+) True XLOC_035939
TCONS_00070440 other downstream 979495 45361735 ~ 45374450 (+) False XLOC_035946
TCONS_00070445 other downstream 1226300 45608540 ~ 45610783 (+) True XLOC_035954
TCONS_00070452 other downstream 1675904 46058144 ~ 46064537 (+) True XLOC_035960

Expression Profile


//