RNA id: TCONS_00009170


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00009170
length 93
RNA type mRNA
GC content 0.38
exon number 4
gene id XLOC_004630
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007123.7
NCBI id CM002896.2
chromosome length 49182954
location 17701625 ~ 17739456 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ATTCTCTTTGGAGgtttcaGTAATGAGATTGACTTTATCTTAGCTTTAAAGGCCTGCAGGGCTGCAGTGATATTTGGGGAAAAAAGCTTTTTT

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000193461

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00009169 lncRNA upstream 70918 17626350 ~ 17630707 (+) True XLOC_004629
TCONS_00010911 lncRNA upstream 274245 17424431 ~ 17427380 (+) True XLOC_004625
TCONS_00009162 lncRNA upstream 489956 17201556 ~ 17211669 (+) True XLOC_004623
TCONS_00009160 lncRNA upstream 497231 17201527 ~ 17204394 (+) False XLOC_004623
TCONS_00010910 lncRNA upstream 826922 16742395 ~ 16874703 (+) True XLOC_004615
TCONS_00010914 lncRNA downstream 491186 18209871 ~ 18228004 (+) True XLOC_004635
TCONS_00009195 lncRNA downstream 825107 18543792 ~ 18544621 (+) False XLOC_004641
TCONS_00010915 lncRNA downstream 1142593 18861278 ~ 18867975 (+) True XLOC_004648
TCONS_00009224 lncRNA downstream 1420658 19139343 ~ 19140651 (+) True XLOC_004655
TCONS_00010732 lncRNA downstream 1549074 19267759 ~ 19271156 (+) True XLOC_004660
TCONS_00009168 mRNA upstream 67898 17620067 ~ 17633727 (+) False XLOC_004629
TCONS_00009167 mRNA upstream 82101 17603528 ~ 17619524 (+) True XLOC_004628
TCONS_00009166 mRNA upstream 138922 17504559 ~ 17562703 (+) True XLOC_004627
TCONS_00009164 mRNA upstream 245542 17436904 ~ 17456083 (+) False XLOC_004626
TCONS_00009165 mRNA upstream 245554 17439580 ~ 17456071 (+) True XLOC_004626
TCONS_00009173 mRNA downstream 36174 17754859 ~ 17756905 (+) True XLOC_004631
TCONS_00009174 mRNA downstream 146689 17865374 ~ 17875270 (+) True XLOC_004632
TCONS_00009176 mRNA downstream 209186 17927871 ~ 18105116 (+) False XLOC_004633
TCONS_00009178 mRNA downstream 215090 17933775 ~ 18104154 (+) False XLOC_004633
TCONS_00009177 mRNA downstream 215090 17933775 ~ 18104154 (+) True XLOC_004633
TCONS_00009163 other upstream 355958 17345550 ~ 17345667 (+) True XLOC_004624
TCONS_00009153 other upstream 740844 16960693 ~ 16960781 (+) True XLOC_004618
TCONS_00009129 other upstream 2319811 15381694 ~ 15381814 (+) True XLOC_004597
TCONS_00009115 other upstream 3597819 14102104 ~ 14103806 (+) True XLOC_004585
TCONS_00009106 other upstream 4043481 13658022 ~ 13658144 (+) True XLOC_004581
TCONS_00009172 other downstream 8857 17727542 ~ 17727651 (+) True XLOC_004630
TCONS_00009175 other downstream 209186 17927871 ~ 17941043 (+) False XLOC_004633
TCONS_00009179 other downstream 406973 18125658 ~ 18125774 (+) True XLOC_004634
TCONS_00009200 other downstream 880165 18598850 ~ 18598964 (+) True XLOC_004644
TCONS_00009203 other downstream 962738 18681423 ~ 18699622 (+) False XLOC_004646