G214571


Basic Information

Item Value
gene id G214571
gene name NA
gene type non-coding
species grasscarp (Ctenopharyngodon idella)
category of species economic fish

Chromosome Information

Item Value
chromosome id CI01000050
NCBI id null
chromosome length 7556436
location 3912797 ~ 3917161 (+)
genome version v1_2015/06_NatureGenetics_grasscarp_Genome

Sequence

>TU243466
TATAATTACAGTAGGATCTTTATTCATCCAAAAATGCAAAGGCAACAGCTGCTTATTGAAATTCTCCTCGTTATTTACTAAAAATAAGCATCTGTGATATAAAGCTTTCTAGCATGAGAGCAGTCTCATTGCAGCCAATTGTCATTTAGGAATCGAGGCTCATGGGAGACATTTTTTGCATTCTGTTTAAAATGAAATGGAAAGATTAGTGGTTGCATATGATGGAAACTAAAGATGATGGTTCAAATTATGGTTTGGCTTGAAATCGTGGCATTCTTTGCCACAAAATGTCCATAACGTTAATTTTCATTGAAGGAAGGCTACAGTATGTGCGTGCCTTATATGCTTTGATTGGATTATAGTTTAAAATCAAAATAATTAATTGCATGAAATGAAAAAGGAATGTCCATTTCCCAGTTTTCAGAGATAAAAGTTAGTGAGTCAGGAACAGAAAAAGCTCTAATACATTTACGGTTGCTTTAAGTACACAAGTTACCACTGATGAGTTAATAAAGTGCAGTACATACTAAACTAATGTTTAGGCAACAATTACAACATTTGTAATGGGAAGTCATGTATTGTTCTACAATTATGGATAAATTAACATCTTCAAAGACATACACTGAGGTCCAAAAGTCTTCTGGACCAGTCTTCTTTGAGGCAAATTTTTTGTAGTTTTTCCTCTTACAATGAAATGTTTGAGAGTATTTTGTCTTAGTAGCAGGTCAAGTTGCAACATAGGCTCATTGGAAACTGCAGTTTTGAGCTGAAATGACCACTGGTGATAGTACAACACCATCAACATTTATTCCTTATCACACAAATTATAATTAGAGGCAGATTACTGAATAATCAACACTTATTGTTATATGTAATATGTTATGACCTCAAAACACTCTTACAATAGTGCATGATTTGCAAATGAATACATTTTGACGTTTGCATCATATAACCAGCTTCATATGTATGGCTTTTCTGACATAGTAAACTTGCTCGGTAGCTCACCCAGTACAGCGCCAAGGCTCGACAGTGCAAGCATTTCTCTCACGTTTATGACTAAAAAGATATGTGTGCGAACTGTAAAATATATTTAGGAGCATGTGTGCAAATTAAGAAAACATAGTTCCAGTGGGTCCTCAGTGTTACGAAATTTAAGGTCATAAAATCTTAAATGGTACAACAAACTTAATAATTTGGAATGAATATACAACCTAATAATGTGATTATTAAATTTCAAAGTTCTGTGATTTAATTACACAAATATGAGCACTGCATGTTTTAAAGTAGCAACGCTGTTGGTTTTAGAGCAGTTCACAATCAATGAATACTTCACATTTATGCCAATCGATTGCTTATGATTTACTGTTGATGAATTTTGACAATATGTTTACATTATGGCGTTTGCATTGTAATATGTTGTGGATGGTTGTAGGATTGCATATTTTATCTCTCTCATCATTTTGAATGAGCAGCCCTAACCTTACCCAATGAAATTGGCTGCATTGTATTTGCGCTAAACTGGTTTTGGTTTTTAAAATGTATAGTTTTTTAATAAAAAGGTTAGTCACATTAACGCACACAGCTAGCTATTATACTGTGGTGTAGTTGCATGGGTCATTTGGATTGCCAGCCTGTTAAAATATGAACAAAAAAAAATCTAGCCTTTAAACCTAGCACTACGTTTTATCAATCTTTTCGTATTATATGCAGCTTTTCTCTTTCTTAATGTTTGTCCATAAGACAGAGATAGAACAAGATGATAATCCATTTATTACTTAAAGCTCATATTTTAACGTATCGCAATCAGCATGTGTAGAGTTTTCTATTGACATTCTTAAACATTCCGAGGTTTGATATTTTCTGATAATGACTGTCGTCAATAACAACGAAGCTGTATAACAAACCGTGACTCACTGGCGCCATCTTGCGTCCACTTAGTGACTGTATTGAAAATGACTACTCACCAGGACGACTGTTTTTATAAAGTAACAAGCTGGATGTACATTATCCCTTACATCATAGAACCTTAATTTCAAATAAAACAGATGATAGAACAATCATATTATTTTGCCTATGTAATACAACTAGGATAAAAAGACTCCAGACTTGACTCGGACTCCAGTGATAAAGACTCCAGACTTGACTCGGACTCCAGCTTAAAGACTTCAGACTTGACTCGGACTCCAGATAAAAGACTCGTGAACATCTCTGGTATTAGCGTTACCTGTAGATTTCAATTTCTGTACAGTCTAATCTCTAAAGATAATTTGTCATACCATACAATCTGCCATCAAAATAAGTTTAATTATTCCAGCTGCTGTGAGAAAAGGCTATAAATGATCCGTCACCTGCAGCATCCTCACATGATATAGTCTACTAGCTGGGACTCCTTCTTTATGTAAACAGACGTGACGTAATGACGCAAAGACGAACGGCGACATGCTTGAATTTCCAGCAGAAACCTACCAGTACCACTCGAATTAGAAAACATTATTGAATTGGGCTAAGGTAAGGAGATGGCTGGTTATGTACTTGCTCAAAAATTTATTTTGGATCATTGTTAACCAAAAAAGTTACAGACTGCAGCTTTAACTTCATATTACATTTTGAAGCAGAAATATTTAAAAGCTTAGTGTACATTTTGTATTCTAATAAATTAATTCATTTTGTTTATAAATGTCTCCTTGTATCCCTTTATTAAGGAAAAACACATTATTTGACGAATTTTAATTGCACCCCTAAAGCTTTTTAATGTGCTCCTAAACGTGCTCCTTGGGACAAAATTAAGCATCAAGCCCTGGGAGCGCTCAGAGACTAAAAGTCCCATGAAACTGCAAATGGCATGATTGCTTCAGGAAAAGTTGATGTTTTTATGTCATGTTAGCTTTTATAACACTATCAGTTTTAAAGGGGGGTTTAGTGTAAGTGGTACTGAATGTTATTTTCACACGTGGTAAAGCCTTAACCTTTTAGCACCACTCTCTGGACATTTCATTTCTGAACTGCAGCCATAGGTTCAACAACCAACTTTATAGTGCAGTAAGTGATTTCTGAGAAACATTGTTGATATTTAAAATCAACCTAAACAAACACACCCCTCCTTTCATTGCTCCACCCCCAAAATGCATGAAAAAACAATGTGGATGTCTCTTTATTACAGCTGAAGCGACGAAAAATATTGCTTCGTGAAAAATAAAGTGAAGATGATGAACGAACAACAAGGAAGAACAAAAAAATGAACAAACAGTACACAAGAGTATATACAAGTGTGTTGTGGTGCTCGGTCTGATCCACTTTCAACAGCGTTTCTCAGAAATCGCTTACTGCACCTTTAATAAAACATTGCCAGATTCATGTTCATCTGTTGTGGATAAAACTTAATGTGTTTTTAGCGCCACTCACTGGGCATTTCACTTCGAAAGTGTTGTGAAACATGCAAAAAGCAACATAATATCATTTTGCACAGACATGATTTTTTCCAATGAGCCTGGGTTGTCAAATCACCATTCAAAGATAGGCTACTATTTTCATTCTATTGTGAGCTCAGATGCAGCCTTCTGTATCGCTGTCATCGGTGCATCTGGCAAGACTTGGTTCCCATTAGTACAGTGTGGGATGTAGATATCTTTAGTTTCATCACGCACAGTCTTCAGTAAGATCATAATCCCTGAACCTCCAGTACCTCTTTCCTCCAGCGCTGTTGGTGCTTTTCTGATTGCATCGAGCTCATCGACCAAACCCTGCTTGTTTGCACGGAGCTGTCTGGCACGGGAGGCCGGTATAGTAATGTAACGGGTGACAATGTTGATGTGGCAATTTCGAAAGTCCACCAAGCGAGCCACACACTGTTCAAATGTGTGCGTTAGATGCTCATCCGCTTGCTGGAGCACAAAGTTGCGCAGGGACGGGCGACTAGAGATGTCTTCAATGAAACGCTTATGAGAGGGCGGCATGTAGTCCCTCATTCTTCTCAGGAAGGCCCCTGTTTGAACAGTATTGACAGAGCGAAAACAAAATTTTC
>TU243467
TATAATTACAGTAGGATCTTTATTCATCCAAAAATGCAAAGGCAACAGCTGCTTATTGAAATTCTCCTCGTTATTTACTAAAAATAAGCATCTGTGATATAAAGCTTTCTAGCATGAGAGCAGTCTCATTGCAGCCAATTGTCATTTAGGAATCGAGGCTCATGGGAGACATTTTTTGCATTCTGTTTAAAATGAAATGGAAAGATTAGTGGTTGCATATGATGGAAACTAAAGATGATGGTTCAAATTATGGTTTGGCTTGAAATCGTGGCATTCTTTGCCACAAAATGTCCATAACGTTAATTTTCATTGAAGGAAGGCTACAGTATGTGCGTGCCTTATATGCTTTGATTGGATTATAGTTTAAAATCAAAATAATTAATTGCATGAAATGAAAAAGGAATGTCCATTTCCCAGTTTTCAGAGATAAAAGTTAGTGAGTCAGGAACAGAAAAAGCTCTAATACATTTACGGTTGCTTTAAGTACACAAGTTACCACTGATGAGTTAATAAAGTGCAGTACATACTAAACTAATGTTTAGGCAACAATTACAACATTTGTAATGGGAAGTCATGTATTGTTCTACAATTATGGATAAATTAACATCTTCAAAGACATACACTGAGGTCCAAAAGTCTTCTGGACCAGTCTTCTTTGAGGCAAATTTTTTGTAGTTTTTCCTCTTACAATGAAATGTTTGAGAGTATTTTGTCTTAGTAGCAGGTCAAGTTGCAACATAGGCTCATTGGAAACTGCAGTTTTGAGCTGAAATGACCACTGGTGATAGTACAACACCATCAACATTTATTCCTTATCACACAAATTATAATTAGAGGCAGATTACTGAATAATCAACACTTATTGTTATATGTAATATGTTATGACCTCAAAACACTCTTACAATAGTGCATGATTTGCAAATGAATACATTTTGACGTTTGCATCATATAACCAGCTTCATATGTATGGCTTTTCTGACATAGTAAACTTGCTCGGTAGCTCACCCAGTACAGCGCCAAGGCTCGACAGTGCAAGCATTTCTCTCACGTTTATGACTAAAAAGATATGTGTGCGAACTGTAAAATATATTTAGGAGCATGTGTGCAAATTAAGAAAACATAGTTCCAGTGGGTCCTCAGTGTTACGAAATTTAAGGTCATAAAATCTTAAATGGTACAACAAACTTAATAATTTGGAATGAATATACAACCTAATAATGTGATTATTAAATTTCAAAGTTCTGTGATTTAATTACACAAATATGAGCACTGCATGTTTTAAAGTAGCAACGCTGTTGGTTTTAGAGCAGTTCACAATCAATGAATACTTCACATTTATGCCAATCGATTGCTTATGATTTACTGTTGATGAATTTTGACAATATGTTTACATTATGGCGTTTGCATTGTAATATGTTGTGGATGGTTGTAGGATTGCATATTTTATCTCTCTCATCATTTTGAATGAGCAGCCCTAACCTTACCCAATGAAATTGGCTGCATTGTATTTGCGCTAAACTGGTTTTGGTTTTTAAAATGTATAGTTTTTTAATAAAAAGTCCCCCCCCCCCCGTTTATTACTGGCAATGTAATGTGAACTTTTGTCTGGGCTGCCCCGTCACAGGAAGGAAAGAACATTTAAAGCTGCAGTCTGTAAGTTTTTCCTCTTTGCCGCCACCTCTGTTTTAAACCTGAAATTGCAGTTATTTGCGGAATACGTGGGTTGTGCATCGCCATGGCTCCTCAGCTTTGCTGTCAGTCACCGCACCGGTGTGGATACTGTACTTCGGAATCACAGATTCTACGTCTTGGAAGTATGACCAAAATAAGAATTTTCACCGGAAAACAATTAAAGACACCGGACTGACATCATCAAATTTGATGAGACATCGCATCCACAAAGGTTAGTCACATTAACGCACACAGCTAGCTATTATACTGTGGTGTAGTTGCATGGGTCATTTGGATTGCCAGCCTGTTAAAATATGAACAAAAAAAAATCTAGCCTTTAAACCTAGCACTACGTTTTATCAATCTTTTCGTATTATATGCAGCTTTTCTCTTTCTTAATGTTTGTCCATAAGACAGAGATAGAACAAGATGATAATCCATTTATTACTTAAAGCTCATATTTTAACGTATCGCAATCAGCATGTGTAGAGTTTTCTATTGACATTCTTAAACATTCCGAGGTTTGATATTTTCTGATAATGACTGTCGTCAATAACAACGAAGCTGTATAACAAACCGTGACTCACTGGCGCCATCTTGCGTCCACTTAGTGACTGTATTGAAAATGACTACTCACCAGGACGACTGTTTTTATAAAGTAACAAGCTGGATGTACATTATCCCTTACATCATAGAACCTTAATTTCAAATAAAACAGATGATAGAACAATCATATTATTTTGCCTATGTAATACAACTAGGATAAAAAGACTCCAGACTTGACTCGGACTCCAGTGATAAAGACTTCAGACTTGACTCGGACTCCAGATAAAAGACTCGTGAACATCTCTGGTATTAGCGTTACCTGTAGATTTCAATTTCTGTACAGTCTAATCTCTAAAGATAATTTGTCATACCATACAATCTGCCATCAAAATAAGTTTAATTATTCCAGCTGCTGTGAGAAAAGGCTATAAATGATCCGTCACCTGCAGCATCCTCACATGATATAGTCTACTAGCTGGGACTCCTTCTTTATGTAAACAGACGTGACGTAATGACGCAAAGACGAACGGCGACATGCTTGAATTTCCAGCAGAAACCTACCAGTACCACTCGAATTAGAAAACATTATTGAATTGGGCTAAGGTAAGGAGATGGCTGGTTATGTACTTGCTCAAAAATTTATTTTGGATCATTGTTAACCAAAAAAGTTACAGACTGCAGCTTTAACTTCATATTACATTTTGAAGCAGAAATATTTAAAAGCTTAGTGTACATTTTGTATTCTAATAAATTAATTCATTTTGTTTATAAATGTCTCCTTGTATCCCTTTATTAAGGAAAAACACATTATTTGACGAATTTTAATTGCACCCCTAAAGCTTTTTAATGTGCTCCTAAACGTGCTCCTTGGGACAAAATTAAGCATCAAGCCCTGGGAGCGCTCAGAGACTAAAAGTCCCATGAAACTGCAAATGGCATGATTGCTTCAGGAAAAGTTGATGTTTTTATGTCATGTTAGCTTTTATAACACTATCAGTTTTAAAGGGGGGTTTAGTGTAAGTGGTACTGAATGTTATTTTCACACGTGGTAAAGCCTTAACCTTTTAGCACCACTCTCTGGACATTTCATTTCTGAACTGCAGCCATAGGTTCAACAACCAACTTTATAGTGCAGTAAGTGATTTCTGAGAAACATTGTTGATATTTAAAATCAACCTAAACAAACACACCCCTCCTTTCATTGCTCCACCCCCAAAATGCATGAAAAAACAATGTGGATGTCTCTTTATTACAGCTGAAGCGACGAAAAATATTGCTTCGTGAAAAATAAAGTGAAGATGATGAACGAACAACAAGGAAGAACAAAAAAATGAACAAACAGTACACAAGAGTATATACAAGTGTGTTGTGGTGCTCGGTCTGATCCACTTTCAACAGCGTTTCTCAGAAATCGCTTACTGCACCTTTAATAAAACATTGCCAGATTCATGTTCATCTGTTGTGGATAAAACTTAATGTGTTTTTAGCGCCACTCACTGGGCATTTCACTTCGAAAGTGTTGTGAAACATGCAAAAAGCAACATAATATCATTTTGCACAGACATGATTTTTTCCAATGAGCCTGGGTTGTCAAATCACCATTCAAAGATAGGCTACTATTTTCATTCTATTGTGAGCTCAGATGCAGCCTTCTGTATCGCTGTCATCGGTGCATCTGGCAAGACTTGGTTCCCATTAGTACAGTGTGGGATGTAGATATCTTTAGTTTCATCACGCACAGTCTTCAGTAAGATCATAATCCCTGAACCTCCAGTACCTCTTTCCTCCAGCGCTGTTGGTGCTTTTCTGATTGCATCGAGCTCATCGACCAAACCCTGCTTGTTTGCACGGAGCTGTCTGGCACGGGAGGCCGGTATAGTAATGTAACGGGTGACAATGTTGATGTGGCAATTTCGAAAGTCCACCAAGCGAGCCACACACTGTTCAAATGTGTGCGTTAGATGCTCATCCGCTTGCTGGAGCACAAAGTTGCGCAGGGACGGGCGACTAGAGATGTCTTCAATGAAACGCTTATGAGAGGGCGGCATGTAGTCCCTCATTCTTCTCAGGAAGGCCCCTGTTTGAACAGTATTGACAGAGCGAAAACAAAATTTTC

Function

GO: NA

KEGG: NA

RNA

RNA id representative length rna type GC content exon number start site end site
TU243466 False 4021 lncRNA 0.37 2 3912797 3917161
TU243467 True 4333 lncRNA 0.37 2 3912797 3917161

Neighbor

gene id symbol gene type direction distance location
CI01000050_03814516_03818892 NA coding upstream 93858 3813420 ~ 3818939 (+)
CI01000050_03807697_03808793 CLCN5B, CLCN5 coding upstream 103927 3805143 ~ 3808870 (+)
CI01000050_03679119_03683710 NA coding upstream 228628 3679080 ~ 3684169 (+)
CI01000050_03641769_03645039 NA coding upstream 267688 3639187 ~ 3645109 (+)
CI01000050_03599274_03618237 SLC25A37 coding upstream 293757 3599274 ~ 3619040 (+)
CI01000050_03938328_03956122 RHOBTB2 coding downstream 21167 3931890 ~ 3957044 (+)
CI01000050_03989489_04121180 NA coding downstream 71096 3988257 ~ 4121393 (+)
CI01000050_04122649_04127014 EGR3 coding downstream 205488 4122649 ~ 4127045 (+)
CI01000050_04159232_04161131 NA coding downstream 241850 4159011 ~ 4161131 (+)
CI01000050_04190820_04204792 BIN3 coding downstream 273659 4190820 ~ 4205923 (+)
G214632 NA non-coding upstream 7716 3904775 ~ 3905081 (+)
G214605 NA non-coding upstream 9069 3873155 ~ 3903728 (+)
G214601 NA non-coding upstream 43291 3869280 ~ 3869506 (+)
G214567 NA non-coding upstream 69071 3843380 ~ 3843726 (+)
G214719 NA non-coding downstream 192334 4109495 ~ 4109890 (+)
G214725 NA non-coding downstream 198205 4115366 ~ 4115601 (+)
G214727 NA non-coding downstream 199648 4116809 ~ 4117109 (+)
CI01000050_02852118_02864754 RNF122 other upstream 1046975 2852118 ~ 2865822 (+)
G212927 NA other upstream 1137664 2774839 ~ 2775133 (+)
CI01000050_01691894_01697791 SULT1ST2, SULT1ST3 other upstream 2215389 1691374 ~ 1698973 (+)
CI01000050_01296683_01297763 SELENOK other upstream 2613191 1296365 ~ 1298255 (+)
G214717 NA other downstream 190421 4107582 ~ 4108280 (+)
CI01000050_04591548_04592778 NA other downstream 674394 4589926 ~ 4593049 (+)
CI01000050_05407682_05409108 FKBP1B, FKBP1AA, FKBP1AB, FKBP1A, FKB1B, FKB1A other downstream 1490424 5407585 ~ 5409417 (+)
G215539 NA other downstream 1712449 5629610 ~ 5631203 (+)

Expression


Co-expression Network