RNA id: TCONS_00005909


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00005909
length 10970
lncRNA type antisense_over
GC content 0.31
exon number 1
gene id XLOC_002215
representative False

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 29893626 ~ 29911696 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

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Function

GO: NA

KEGG:

id description
ko03230 Viral genome structure
ko05164 Influenza A
ko03200 Viral proteins

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
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TCONS_00005718 lncRNA upstream 804452 29091237 ~ 29091601 (+) True XLOC_002201
TCONS_00005907 lncRNA upstream 1440968 28442909 ~ 28455085 (+) True XLOC_002199
TCONS_00004221 lncRNA upstream 1465281 28429557 ~ 28430772 (+) True XLOC_002198
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TCONS_00004263 lncRNA downstream 1071364 30978386 ~ 30988104 (+) False XLOC_002219
TCONS_00005911 lncRNA downstream 1071530 30978552 ~ 30988075 (+) True XLOC_002219
TCONS_00005719 lncRNA downstream 1835976 31742998 ~ 31768953 (+) True XLOC_002226
TCONS_00005720 lncRNA downstream 1962260 31869282 ~ 31942176 (+) False XLOC_002228
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TCONS_00004252 mRNA upstream 8189 29855213 ~ 29887864 (+) False XLOC_002211
TCONS_00004254 mRNA upstream 25393 29855281 ~ 29870660 (+) True XLOC_002211
TCONS_00004246 mRNA upstream 38035 29849977 ~ 29858018 (+) False XLOC_002211
TCONS_00004256 mRNA downstream 56496 29963518 ~ 30576089 (+) False XLOC_002216
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TCONS_00004250 other upstream 43811 29852147 ~ 29852242 (+) True XLOC_002214
TCONS_00004249 other upstream 44958 29851000 ~ 29851095 (+) True XLOC_002213
TCONS_00004248 other upstream 45386 29850572 ~ 29850667 (+) True XLOC_002212
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TCONS_00004283 other downstream 2488758 32395780 ~ 32395896 (+) True XLOC_002235

Expression Profile

//