RNA id: TCONS_00004360


Basic Information

Item Value
RNA id TCONS_00004360
length 80
RNA type miRNA
GC content 0.49
exon number 1
gene id XLOC_002282
representative True

Chromosome Information

Item Value
chromosome id NC_007121.7
NCBI id CM002894.2
chromosome length 45420867
location 35644719 ~ 35644798 (+)
genome version GRCz11_2017_zebrafish_Genome
species zebrafish
(Danio rerio)

Sequence

ACCTTGGCTCTAGACTGCTTACTGCTTATGGAGTCCGACAGTACAGTAACAGTCTACAGTCATGGCTACTGAAGTCTGGC

Function

GO: NA

KEGG: NA

Ensembl:

ensembl_id ENSDART00000122276

JBrowse2

Neighbor

RNA id RNA type direction distance location representative gene id
TCONS_00005726 lncRNA upstream 192639 35446908 ~ 35452080 (+) True XLOC_002279
TCONS_00005923 lncRNA upstream 230442 35369819 ~ 35414277 (+) True XLOC_002277
TCONS_00005922 lncRNA upstream 233500 35369819 ~ 35411219 (+) False XLOC_002277
TCONS_00005921 lncRNA upstream 255022 35369592 ~ 35389697 (+) False XLOC_002277
TCONS_00004348 lncRNA upstream 352488 35291231 ~ 35292231 (+) True XLOC_002274
TCONS_00005924 lncRNA downstream 556386 36201184 ~ 36342453 (+) False XLOC_002294
TCONS_00004376 lncRNA downstream 556396 36201194 ~ 36224880 (+) False XLOC_002294
TCONS_00004377 lncRNA downstream 556400 36201198 ~ 36224878 (+) False XLOC_002294
TCONS_00004378 lncRNA downstream 556401 36201199 ~ 36381043 (+) False XLOC_002294
TCONS_00005925 lncRNA downstream 556411 36201209 ~ 36203601 (+) False XLOC_002294
TCONS_00004359 mRNA upstream 64633 35554219 ~ 35580086 (+) True XLOC_002281
TCONS_00004356 mRNA upstream 116330 35468978 ~ 35528389 (+) False XLOC_002280
TCONS_00004358 mRNA upstream 116330 35526528 ~ 35528389 (+) True XLOC_002280
TCONS_00004357 mRNA upstream 144016 35491216 ~ 35500703 (+) False XLOC_002280
TCONS_00004355 mRNA upstream 192528 35439952 ~ 35452191 (+) False XLOC_002279
TCONS_00004362 mRNA downstream 307734 35952532 ~ 35959571 (+) False XLOC_002284
TCONS_00004363 mRNA downstream 308270 35953068 ~ 35959294 (+) True XLOC_002284
TCONS_00004364 mRNA downstream 381778 36026576 ~ 36031367 (+) False XLOC_002285
TCONS_00004365 mRNA downstream 384739 36029537 ~ 36032038 (+) True XLOC_002285
TCONS_00004366 mRNA downstream 393179 36037977 ~ 36063414 (+) True XLOC_002286
TCONS_00004347 other upstream 346020 35288158 ~ 35298699 (+) False XLOC_002274
TCONS_00004342 other upstream 488191 35153100 ~ 35156528 (+) False XLOC_002270
TCONS_00004338 other upstream 635282 35002798 ~ 35009437 (+) False XLOC_002268
TCONS_00004339 other upstream 635623 35005895 ~ 35009096 (+) True XLOC_002268
TCONS_00004334 other upstream 693187 34950095 ~ 34951532 (+) False XLOC_002266
TCONS_00004361 other downstream 219 35645017 ~ 35645135 (+) True XLOC_002283
TCONS_00004370 other downstream 514169 36158967 ~ 36160287 (+) False XLOC_002289
TCONS_00004371 other downstream 514814 36159612 ~ 36160187 (+) True XLOC_002289
TCONS_00004384 other downstream 643043 36287841 ~ 36288503 (+) True XLOC_002299
TCONS_00004398 other downstream 794508 36439306 ~ 36442847 (+) False XLOC_002310